戴爱琴
- 作品数:21 被引量:34H指数:4
- 供职机构:扬州大学动物科学与技术学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金江苏省自然科学基金国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学自动化与计算机技术更多>>
- 鸡piRNAs分子的克隆及表达规律分析
- 本研究首次以鸡作为研究对象,通过构建小RNAs的cDNA文库和TA克隆测序的方法从睾丸组织中获得了23个piRNAs序列,同时采用Q-PCR技术分析了中国地方鸡种如皋鸡的不同生命阶段不同组织中piRNAs时空表达规律。结...
- 张颖常国斌陈蓉戴爱琴
- 关键词:睾丸Q-PCR克隆
- 文献传递
- 细菌内毒素对鸡NLRC5受体及IFN基因转录的影响被引量:9
- 2011年
- 本研究旨在探讨鸡NLRC5受体及IFN基因对不同细菌内毒素的诱导表达变化,为禽类NLRC5受体的分子功能及其参与先天免疫调控的作用机制提供理论依据。用不同浓度的(0、0.1、1.0、10.0μg.mL-1)来自致病性大肠杆菌(E.coli,EC)和肠炎沙门氏菌(S.enteriditis,SE)的2种内毒素(LPS)分别刺激鸡天然巨噬细胞系(HD11)2、4和6h,在不同的时间点收集细胞,提取总RNA,并设计相关引物,利用荧光定量PCR分析鸡NLRC5受体以及下游功能基因IFNA和IFNB的转录量变化,探讨HD11细胞对不同来源的细菌内毒素的免疫反应。研究表明:与对照组相比,1.0和10.0μg.mL-1的EC-LPS、SE-LPS均能诱导HD11细胞产生免疫应答,但0.1μg.mL-1组未能诱导成功;不同细菌LPS诱导的免疫应答时间不一致,经EC-LPS诱导的NLRC5和IFNB基因均在刺激后6h达到转录高峰,与2、4h差异显著(P<0.05),与对照组差异极显著(P<0.01);但IFNA基因在2、6h达到高峰,而在4h下降,呈"V"型转录趋势。SE-LPS诱导的NLRC5和IFNA、IFNB转录量随时间均保持一直上升的趋势,在6h达到高峰,且与对照组及2、4h差异显著(P<0.05)。结果表明NLRC5受体与IFNA和IFNB共同参与了细胞对细菌内毒素的免疫应答,NLRC5基因可能对鸡先天免疫功能具有调节作用。
- 常国斌陈蓉栾德琴张颖刘向萍马腾戴爱琴周伟陈国宏
- 关键词:IFN先天免疫
- 鹌鹑Piwi基因的克隆及鉴定
- 鉴于Piwi蛋白在哺乳动物生殖细胞中的重要作用,本研究选择体型小、繁殖周期短的鹌鹑为研究对象来开展禽类Piwi蛋白及其结合小RNA的初步研究,以期填补国内相关研究中的空白。本研究通过RT-PCR和RACE技术首次获得了鹌...
- 陈蓉常国斌张颖戴爱琴马腾徐琪陈国宏
- 关键词:鹌鹑PIWIPIRNA禽类
- 文献传递
- 鹌鹑首例小分子RNA测序图谱
- 非编码小分子RNA(ncRNAs)几乎存在于所有较高等的真核生物细胞中,对生物体具有非常重要的调控作用。各种调控小分子RNA图谱的构建可以促进ncRNAs调控网络的完善及RNA生物学的发展。本研究利用Solexa深度测序...
- 常国斌陈蓉张颖戴爱琴马腾徐琪陈国宏
- 关键词:鹌鹑睾丸小分子RNAMIRNAPIRNA
- 文献传递
- 鸡Piwi蛋白的亚细胞定位研究被引量:4
- 2013年
- 通过构建2种真核表达载体比较Piwi蛋白在真核细胞中的表达部位,为进一步研究Piwi蛋白的生物学功能提供依据。采用RT-PCR方法克隆了狼山鸡睾丸组织中Piwi基因CDS,构建含有增强型绿色荧光蛋白(EGFP)报告基因的融合表达载体pEGFP-C1-Piwi,脂质体PEI介导基因转染NIH-3T3细胞,同时构建pcDNA3.1-Piwi真核表达载体,采用细胞间接免疫荧光方法检测Piwi蛋白在NIH-3T3细胞的表达部位。结果表明,成功克隆出公鸡Piwi基因的全序列CDS,大小为2 604bp,与GenBank中预计的序列基本一致;融合表达载体pEGFP-C1-Piwi在整个细胞中都有表达;而间接免疫荧光方法检测到pcDNA3.1-Piwi载体主要在NIH-3T3细胞质中表达。Piwi蛋白主要在细胞质中表达,采用间接免疫荧光方法比EGFP报告基因法更为可靠,适合目的蛋白的亚细胞定位研究。
- 戴爱琴常国斌陈蓉张颖阴彦辉马腾李建超陈国宏
- 关键词:真核表达亚细胞定位绿色荧光蛋白间接免疫荧光
- 鸡piRNAs分子的克隆及表达规律分析
- 本研究首次以鸡作为研究对象,通过构建小RNAs的cDNA文库和TA克隆测序的方法从睾丸组织中获得了23个piRNAs序列,同时采用Q-PCR技术分析了中国地方鸡种如皋鸡的不同生命阶段不同组织中piRNAs时空表达规律.结...
- 张颖常国斌陈蓉戴爱琴
- 关键词:基因表达
- 文献传递
- 基于Web的中国地方鸡品种生物信息查询系统的设计与实现
- 2011年
- 构建独立的中国地方鸡品种生物信息查询系统是解决海量地方鸡品种信息存储和快速搜索策略问题的基础。该系统结合鸡的遗传与育种实际,立足中国特色资源,采用ASP编程技术和Microsoft SQL Server 2005数据库技术,以Windows 2003 Server为开发平台,将相关异质数据快速生成生物信息二次数据库,与Web系统链接,通过后台进行实时更新,并添加数据分析功能,初步实现系统的应用。详细介绍了中国地方鸡品种生物信息查询系统的设计、开发以及实现过程,为农业信息化奠定基础。
- 栾德琴陈国宏常国斌周伟马腾戴爱琴李芹盛中伟白云峰包文斌
- 关键词:生物信息WEB系统
- 鸡Piwill基因启动子区转录调控元件的初步分析
- 1引言Argounaute蛋白是一类高度保守的蛋白家族,含有保守的结构域PIWI和PAZ。根据氨基酸序列的不同,可以分为两个不同的亚家族:Ago和Piwi亚家族。前者与siRNAs和miRNAs相结合,在基因调控中起着重...
- 夏明秀常国斌陈蓉翟飞戴爱琴马腾王洪志徐璐陈静刘璐陈国宏
- 关键词:转录调控
- 文献传递
- 鸡肌内脂肪性状候选基因的聚合效应及初步验证被引量:5
- 2011年
- 【目的】旨在探讨影响鸡脂肪性状重要候选基因A-FABP、Ex-FABP的聚合效应,并对其进行初步验证,为进一步开发利用脂肪性状的有效分子标记提供依据。【方法】运用PCR-SSCP技术分别检测如皋鸡A-FABP、Ex-FABP基因所有外显子区域的单核苷酸多态性(SNPs),分析单基因型和聚合基因型与12周龄胸肌脂肪含量之间的关系;同时,采用荧光定量PCR技术检测后代分离群体单基因型和聚合基因型的发育性表达规律,进行聚合基因型遗传效应的初步验证。【结果】如皋鸡A-FABP的外显子3、Ex-FABP基因外显子4区域中存在A/G突变,共出现3种基因型;AA型(A-FABP)、BB(Ex-FABP)型个体的肌内脂肪含量显著高于其它基因型(P<0.05),为有利基因型,两者聚合的AABB型个体同样为最佳基因型。经后代分离群体Q-PCR证实,单基因表达和聚合基因型的表达均不存在性别效应,在胸肌组织中,两候选基因在4周龄时表达量最高,8周龄下降,至12周龄缓慢上升。在聚合基因型个体中,均以AABB型表达水平最高,ABAB型表达量较低。【结论】A-FABP、Ex-FABP两个基因存在聚合效应;其中,AABB型与胸肌组织中高肌内脂肪含量具有紧密关联性。A-FABP、EX-FABP两基因及其聚合基因型可作为如皋鸡肌内脂肪性状有效的候选标记。
- 常国斌刘向萍陈蓉栾德琴王克华张颖马腾周伟戴爱琴陈国宏
- 关键词:肌内脂肪基因型
- 鸡pilRNAs分子的克隆及表达规律分析被引量:2
- 2012年
- 旨在为禽类piRNAs的遗传特性及发生和消失机理提供基础依据,也为禽类小分子RNA及其结合蛋白的深入研究和实际应用积累基础资料。本研究以鸡作为研究对象,通过构建小RNAs的cDNA文库和TA克隆测序的方法从睾丸组织中获得了19个大小为23~39nt的pilRNAs序列。根据pilRNAs的大小、同源序列和二级结构特征,选择了3个不同序列并采用Q-PCR技术分析了中国地方鸡种如皋鸡和引进隐性白鸡的不同生长阶段不同组织中pilRNAs时空表达规律。结果表明,编码鸡pilRNAs基因序列在染色体和基因组中的分布同其它物种一样分别具有不均匀性和基因间区偏爱性;二级结构预测,发现pilRNAs具有与miRNAs不同的独特的茎-环结构;鸡pilRNAs不仅大量存在于生殖组织,还大量存在于其他组织,表达规律因pilRNAs种类、品种、性别的变化而不同,gga-piR-1在2个品种的公、母鸡所有组织中的表达量均是相对最低,且到12周龄时均趋向一致的水平;而gga-piR-4表达量相对较高;gga-piR-5在如皋公鸡中所检测的全部组织中表达量最高,且在8周龄达到最高峰,在隐性白公鸡中的表达量相对较高,而在如皋母鸡、隐性白母鸡中均呈现中度表达水平。二级结构的独特特征从不同的角度阐明了pilRNAs和miRNAs 2种成熟小RNAs的剪切方式和加工机制的完全不同;鸡pilRNAs的多组织表达表明它可能不仅局限于生殖系的发育和维持,在其他组织中也扮演了重要的角色,不同种类的pilRNAs可能在生命发育过程中参与不同的调控功能。
- 张颖常国斌陈蓉戴爱琴栾德琴李建超马腾华登科陈国宏
- 关键词:睾丸Q-PCR克隆