2024年11月7日
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刘俊
作品数:
145
被引量:28
H指数:3
供职机构:
浙江工业大学
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相关领域:
自动化与计算机技术
环境科学与工程
文化科学
交通运输工程
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合作作者
张贵军
浙江工业大学
胡俊
浙江工业大学
王柳静
浙江工业大学
郝小虎
浙江工业大学
陈涛
浙江工业大学
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2014
2篇
2013
3篇
2012
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一种基于多残基接触图协同约束的蛋白质结构预测方法
一种基于多残基接触图协同约束的蛋白质结构预测方法,基于Rosetta的框架,首先利用Rosetta第一、第二阶段对种群初始化,然后通过对目标构象进行变异、交叉生成新的测试构象;其次,根据四个contact服务器预测得到的...
张贵军
彭春祥
刘俊
周晓根
夏瑜豪
赵凯龙
一种基于接触图的蛋白质结构比对方法
一种基于接触图的蛋白质结构比对方法,首先根据输入的两个待比对蛋白质的三维结构信息,分别计算两个蛋白质的接触图信息;其次从任一蛋白质接触图中抽取对应蛋白质中的每个氨基酸的周边接触信息;然后根据氨基酸残基的周边接触信息,计算...
胡俊
饶亮
刘俊
周晓根
陈伟锋
张贵军
一种群体爬山迭代蛋白质构象空间优化方法
一种群体爬山迭代蛋白质构象空间优化方法,首先,利用Rosetta协议进行大范围的构象搜索,然后利用迭代爬山搜索方法对构象空间进行进一步的探索,在提高构象空间搜索效率的同时有效避免陷入局部最优,形成更接近天然蛋白质的三维结...
张贵军
刘俊
彭春祥
周晓根
胡俊
余宝昆
文献传递
一种基于差分进化的蛋白质ATP对接方法
一种基于差分进化的蛋白质ATP对接方法,首先,使用ATPbind服务器预测出蛋白质‑ATP绑定残基信息,提升了复合物分子空间结构的预测精度;然后,通过种群个体的设计将原先的蛋白质‑ATP结构预测问题转换成搜索最优个体的优...
饶亮
张贵军
刘俊
彭春祥
胡俊
周晓根
文献传递
一种基于动态抽象凸下界估计的群体蛋白质结构预测方法
一种基于动态抽象凸下界估计的群体蛋白质结构预测方法,在差分进化算法框架下,基于抽象凸理论,首先,通过计算初始种群中每个构象个体的支撑向量,建立能量函数的下界估计模型;然后,将整个子种群平均划分为两个子种群,从子种群中选择...
周晓根
张贵军
彭春祥
刘俊
胡俊
一种基于残基对距离约束的蛋白质结构预测方法
一种基于残基对距离约束的蛋白质结构预测方法,首先,采用片段重组和片段组装策略,广泛的搜索构象空间;然后利用预测的残基距离图实时构建局部扰动模型,利用差分进化算法快速求解扰动量,生成结构多样化的候选构象,进一步改善二级结构...
张贵军
李亭
刘俊
周晓根
陈芳
文献传递
一种基于局部扰动的群体蛋白质构象空间优化方法
一种基于局部扰动的群体蛋白质构象空间优化方法,首先,利用Rosetta协议进行大范围的构象搜索,并在Rosetta协议的第四阶段结合对片段的局部扰动,增强对构象空间的探索,形成较为完整的二级结构;然后,对二级结构进行扰动...
张贵军
刘俊
彭春祥
周晓根
李远峰
余宝昆
文献传递
一种基于构象多样性策略的蛋白质三维结构预测方法
一种基于构象多样性策略的蛋白质三维结构预测方法,在遗传算法的框架下,采用Rosetta标准协议;利用遗传算子对构象的loop区域进行操作,增强对loop区域的空间搜索;引入基于蛋白质二级结构信息的多样性指标,结合构象的能...
张贵军
刘俊
王柳静
谢腾宇
周晓根
马来发
SBRs出水污泥调理返投加速好氧污泥颗粒化研究
好氧颗粒污泥(aerobic granular sludge,AGS)因具有良好的沉降性能、丰富多样的微生物种群和较强的耐冲击能力等优点,而被认为是新一代的污水生物处理技术。然而,AGS培养周期长这一难点极大地限制其发展...
刘俊
关键词:
好氧污泥
胞外聚合物
文献传递
一种基于二面角熵值的蛋白质两阶段构象空间优化方法
一种基于二面角熵值的蛋白质两阶段构象空间优化方法,首先,利用Rosetta协议的第一、二阶段对种群进行初始化;在探索阶段,迭代Rosetta协议的第三阶段进行大范围的构象搜索,并以每一代种群中二面角熵值的变化作为阶段切换...
张贵军
刘俊
谢腾宇
周晓根
彭春祥
郝小虎
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