陈再忠
- 作品数：99 被引量：412H指数：11
- 供职机构：上海海洋大学更多>>
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- 相关领域：农业科学生物学文化科学环境科学与工程更多>>
- 蜕壳前后中华绒螯蟹幼蟹肝胰腺脂肪酸组成变化
- 用Folch法研究了中华绒螯蟹幼蟹蜕壳前后肝胰腺中脂肪酸组成的变化, 结果表明:蜕壳后肝胰腺指数和肝脂含量下降了1．90％,1.58％;∑SFA,∑MUFA 蜕壳后与蜕壳前相比都有所下降,而∑HUFA却上升了1．53％．...
- 张文军贺诗水成永旭陈再忠
- 关键词：中华绒螯蟹幼蟹肝胰腺脂肪酸蜕壳
- 文献传递
- 中华青鳉胚胎低温保存研究被引量：4
- 2013年
- 初步研究了中华青鳉胚胎在低温条件下的保存状况,结果表明,在发眼期使用添加泥炭土的0.5 mg/L聚维酮碘保护液4℃保存胚胎15 d后28℃孵化,正常仔鱼率能达到82.2%,是3个时期4种保存方式中最高的;发眼期胚胎在保存时使用添加泥炭土的1.0 mg/L孔雀石绿保护液,正常仔鱼率也较高,能达到77.8%;在脊索空泡化完成期,孔雀石绿保护液浓度4.0 mg/L时,正常仔鱼率最低,只有33.3%,还有一定的畸形率;其余时期的保存效果介于上述三者之间。结果表明,可以通过低温保存的方式延长青鳉胚胎的存活时间。
- 陈学文陈再忠
- 关键词：青鳉胚胎
- 蓝色七彩神仙鱼虹彩细胞呈色相关基因的发掘
- 2024年
- 为发掘蓝色体色中与虹彩细胞呈色相关的基因,实验选取全蓝、白化全蓝七彩神仙鱼分别与全白七彩神仙鱼的皮肤组织,进行比较转录组学分析。结果显示,全蓝与全白七彩神仙鱼皮肤组织转录组序列比对,共有2192个差异表达基因(DEGs),其中1270个基因上调,922个基因下调,DEGs主要富集至嘌呤核苷酸生物合成过程、肌动蛋白结构组织、嘌呤化合物生物合成过程、氧化磷酸化和柠檬酸循环等代谢通路。白化全蓝与全白七彩神仙鱼转录组序列比对结果显示,共有3168个DEGs,其中1859个基因上调,1309个基因下调,主要富集在氧化磷酸化、核糖核苷二磷酸代谢过程、ADP代谢过程、阳离子结合和甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢等通路。为进一步发掘与虹彩细胞呈色相关的候选基因,通过数据库比对分析,在全蓝与全白七彩神仙鱼筛选出32个DEGs,在白化全蓝与全白七彩神仙鱼筛选出38个DEGs,其中alkal2b、gpnmb、fhl2、pka与虹彩细胞发育相关,pgam、prtfdc1、pnp、slc23a1、slc2a9、rab38、rdh10、psat1、paics与虹彩细胞中鸟嘌呤合成及运输相关。本研究为深入解析鱼类蓝色结构色的形成和调控机制奠定基础。
- 李中军温彬马腾飞刘鑫刘鑫刘鑫
- 关键词：鱼类
- 基于专业审核评估背景下水产类专业实践教学规范化管理研究
- 2019年
- 文章在分析上海海洋大学水产类专业人才培养定位和实践教学现状基础上,从实践教学准备、过程管理和提高实践教学主体主观能动性三个方面形成了水产类专业实践教学管理体系,以期为该专业的建设和发展提供支撑,深化水产类专业实践课程的管理科学化和规范化的教学改革,将我校水产类专业的生产实践完全融入祖国的江河湖海中,充分调动学生、企业和教师的主观能动性,为培养水产类人才做出应有的贡献。
- 王磊王磊黄旭雄谭洪新陈再忠陈再忠周洪娟
- 关键词：实践教学
- 一种制备组织切片的方法
- 本发明公开了一种制备组织切片的方法，包括如下步骤：1）固定组织块：将组织块固定在固定剂中；2）脱水：将组织块依次置于浓度从低到高的二氧六环水溶液中进行脱水；3）透蜡包裹：将脱水后的组织块全部浸入熔融的石蜡中用石蜡包裹好；...
- 陈再忠林睿涓高建忠
- 七彩神仙鱼催乳素基因的克隆、定位及表达分析
- 2024年
- 【目的】七彩神仙鱼(Symphysodon aequifasciatus)具有特殊的亲代抚育行为,克隆并定位七彩神仙鱼催乳素基因,分析其在亲代抚育中的表达模式,为理解催乳素在七彩神仙鱼亲代抚育中的作用提供依据。【方法】通过BLASTP对七彩神仙鱼全基因组进行分析,鉴定出1个催乳素基因,命名为dfprl。基于dfprl基因的CDS区,设计克隆和PCR引物,通过RACE技术克隆获得dfprl基因全长,并利用生物信息学对dfprl基因进行结构分析,对其氨基酸序列进行理化性质和进化分析。对不同抚育阶段七彩神仙鱼的脑、性腺和皮肤进行转录组分析,探究dfprl基因在亲代抚育中的表达特征,并利用原位杂交技术对dfprl基因在七彩神仙鱼皮肤中的表达进行定位。【结果】dfprl全长为1282 bp,cDNA序列开放阅读框长度为639 bp,共编码212个氨基酸,5'-UTR为309 bp,3'-UTR为334 bp。dfprl蛋白存在PRL家族的典型结构域Hormone_1,dfprl蛋白与慈鲷科其他鱼类PRL蛋白相似性较高,与尼加拉瓜湖始丽鱼(Archocentrus centrarchus)对应的氨基酸序列同源性最高、为96.70%。亲鱼进入抚育阶段后,dfprl在性腺和皮肤中的表达水平逐渐上升,抚育结束时表达水平下降。原位杂交结果显示,dfprl在皮肤粘液细胞中表达,且与七彩神仙鱼催乳素受体(dfprlr)表达位点重叠,在抚育早期阶段高表达。【结论】七彩神仙鱼dfprl基因高度保守,存在稳定的Hormone_1结构域。七彩神仙鱼dfprl基因在亲代抚育阶段的皮肤中高表达,且在亲代抚育阶段的皮肤粘液细胞中与dfprlr表达位点重合,表明dfprl可能通过作用于dfprlr进而促进七彩神仙鱼独特抚育行为的发生。
- 成果温彬高建忠陈再忠
- 关键词：七彩神仙鱼催乳素基因克隆
- 七彩神仙鱼BTN1A1基因克隆及其在嗜水气单胞菌胁迫下的表达分析被引量：1
- 2024年
- 【目的】克隆七彩神仙鱼(Symphysodon aequifasciatus)嗜乳脂蛋白1A1(Butyrophilin 1A1,BTN1A1)基因,分析其在病原刺激下的表达模式,为了解七彩神仙鱼BTN1A1基因功能提供依据。【方法】利用生物信息学对七彩神仙鱼2个BTN1A1基因(BTN1A1-1和BTN1A1-2)进行结构和进化分析。根据前期获得的七彩神仙鱼皮肤转录组数据,选取BTN1A1-1和BTN1A1-2基因的CDS区设计引物进行克隆。采用qRT-PCR分析BTN1A1在各组织中的表达及嗜水气单胞菌刺激下的表达模式。【结果】BTN1A1-1和BTN1A1-2的ORF序列长度为894、1275 bp,分别编码298、424个氨基酸。BTN1A1-1和BTN1A1-2蛋白均具有1个信号肽、1个Ig结构域、1个lg_like结构域和1个跨膜结构域的经典结构,BTN1A1-2还具有1个胞质结构域。七彩神仙鱼BTN1A1-1与慈鲷科其他鱼类相似性较高,与尼加拉瓜湖始丽鱼(Archocentrus centrarchus)BTNIAI对应氨基酸序列同源性最高、为94.14%。但BTN1A1-2与其他鱼类发生分离,形成独特分支。BTN1A1-1和BTN1A1-2在七彩神仙鱼各组织中均有表达,但在鳃、肠道、皮肤等与免疫相关的组织中表达量相对较高。七彩神仙鱼BTN1A1-1在嗜水气单胞菌胁迫后表达量先显著下降后上升,而BTN1A1-2表达量则先显著上升后下降。【结论】七彩神仙鱼BTN1A1-1基因相对保守,而BTN1A1-2基因在进化上较为特殊。二者在免疫刺激下的差异表达暗示其可能在七彩神仙鱼免疫防御中发生功能分化。
- 何恺轩温彬高建忠陈再忠
- 关键词：七彩神仙鱼嗜水气单胞菌免疫调节基因表达
- 神仙鱼透明鳃盖转录组解析
- 2024年
- 【目的】神仙鱼透明性状具有很高的经济价值和科研价值。探究神仙鱼透明鳃盖(Transparent gill cover,TGC)和不透明鳃盖(Opaque gill cover,OGC)之间的差异表达基因(Differential expression genes,DEG),并挖掘影响神仙鱼透明鳃盖性状的相关信号通路,可为后续筛选调控神仙鱼透明鳃盖性状的关键基因并开展相关机制研究提供理论基础。【方法】选取红顶三色品系神仙鱼的鳃盖组织为研究材料,OGC和TGC各选取6个样本。基于Illumina Novaseq 6000测序平台进行转录组学测序,利用Fastp对原始测序数据进行质控,利用Trinity软件对质控后的数据进行从头组装获得转录本(Transcript)和对应的单基因(Unigene),利用CD-HIT软件和BUSCO软件分别对初始组装序列进行去冗余分析和结果评估。去冗余后的Unigene基于序列同源性进行功能注释。利用RSEM软件计算每个样本中Unigene的表达量。使用DESeq2软件计算OGC和TGC之间的DEG。使用Goatools软件和KOBAS软件对DEG分别进行GO和KEGG通路富集分析。【结果】(1)测序数据质控后每个样本测序碱基平均错误率均低于0.1%,Q20均高于97.78%,Q30均高于93.58%,测序质量可靠。从头组装后获得200 303个Transcript,对应123 178个Unigene。组装后数据去冗余后共获得147 932个Transcript,对应108 070个Unigene,平均长度为991.85 bp,N50为2 430 bp。(2)共有40 180个Unigene在NR、KEGG、eggNOG、GO、Pfam、Swiss-Prot数据库中获得功能注释,占总体的37.98%,其中10 747个基因在6个数据库中同时被注释,占总体的26.75%。(3)TGC相对于OGC共432个DEG,其中TGC相对于OGC显著上调267个基因、下调165个基因。(4)GO富集结果显示,432个DEG主要富集在IMP生物合成过程、IMP代谢过程、“从头”IMP生物合成过程、氨基酸结合、修饰氨基酸结合等5条生物通路中。(5)KEGG富集结果显示,432个DEG主要富集在神经活性配体-受体相互作用、酪氨酸代谢、嘌呤代谢、
- 张纬宇陈再忠温彬高建忠
- 关键词：神仙鱼转录组学差异表达基因
- 野生型和人工选育全蓝型七彩神仙鱼群体的遗传多样性分析
- 2024年
- 【目的】研究七彩神仙鱼(Symphysodon aequifasciatus)的遗传多样性,分析野生型和两种人工选育蓝色群体的亲缘关系和遗传差异,获得与体色形成相关的候选基因组区域及位点,同时为七彩神仙鱼分类系统的制订提供参考。【方法】对9尾野生型(WF)、8尾全蓝型(BF)和10尾白化蓝型(ABF)七彩神仙鱼个体进行全基因组重测序,获得单核苷酸多态性(SNP)位点,计算群体遗传多样性指标,分析群体遗传结构,进行群体间的选择消除分析。考虑SNP注释和突变率,结合PCR和Sanger测序,验证候选SNP。【结果】在3个七彩神仙鱼群体中共鉴定出1360293个SNP,PIC、Pi、Ho、He表明,野生型、全蓝型和白化蓝型的遗传多样性递减,选育群体的杂合度很低。系统发育进化树、群体结构分析和多态性位点主成分分析结果均显示,3个群体之间相互独立,且群体内部聚集明显。连锁不平衡衰减分析结果表明,白化蓝型群体承受着巨大的选择压力,其次是全蓝型群体。基于群体分化指数F_(ST)和Pi进行选择消除分析,结果表明,全蓝型群体的第3、12、13、18、20号染色体和白化蓝型群体的第1、16、18、19号染色体的较大区域内存在强烈的选择信号。在全蓝型群体和白化蓝型群体中分别鉴定出13个和9个候选SNP。【结论】3个七彩神仙鱼群体的遗传多样性较低,遗传关系显示出与人工选育进程的一致性。USP43、FGFR2、DENND4、MLL1基因可能与七彩神仙鱼体色形成密切相关。
- 吉钰陈再忠温彬高建忠
- 关键词：七彩神仙鱼群体遗传学
- 糠虾的人工养殖方法和养殖设备
- 本发明属于动物养殖业，具体涉及一种糠虾的人工养殖方法和养殖设备。所述糠虾的人工养殖方法是在水产经济动物养殖池中套养糠虾，并且在置于养殖水体内的漂浮式模块化网箱系统中进行养殖；养殖过程中的温度为30℃以下，养殖水体的盐度为...
- 陈再忠潘泓宇袁根军张帅
- 文献传递
