景奉香
- 作品数:68 被引量:235H指数:8
- 供职机构:中国科学院上海微系统与信息技术研究所更多>>
- 发文基金:中国科学院科研项目国家自然科学基金上海市科学技术发展基金更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学自动化与计算机技术电子电信更多>>
- 聚二甲基硅氧烷球形微腔阵列的数字PCR芯片被引量:2
- 2017年
- 数字聚合酶链式反应(d PCR)技术是一种核酸绝对定量技术,但现有d PCR平台因其昂贵的设备或复杂的操作限制了其实际应用。利用气体膨胀浇注成型技术,结合集成微腔阵列的模具,设计、制作了一种成本低廉、简单可靠的d PCR微流控芯片。独特的球形微腔为液滴存储提供了更稳定的几何形式,保证了样品数字离散化的可靠性和稳定性。同时,芯片还利用预脱气的聚二甲基硅氧烷(PDMS)实现自动进样和样品离散化,大大降低了对复杂昂贵设备的依赖,且提供了更高集成度。利用芯片进行了EGFR基因第19号外显子数字PCR定量检测,验证了该芯片的实用性。
- 符亚云景奉香李刚赵建龙
- 关键词:聚二甲基硅氧烷微流控芯片
- 毛细管电泳微芯片系统的研究
- 赵建龙徐元森陈继锋金庆辉景奉香王吉李铁
- 该项目为细管电泳,是一种新的分离分析技术,由于其极高的柱效,已经被广泛用于蛋白质等生物大分子的分析分离、DNA测序、体内药物的分离等领域。该课题组综合了微电子机械系统和毛细管电泳技术上的优势,利用微电子技术及MEMS加工...
- 关键词:
- 关键词:毛细管电泳微芯片
- 显色法芯片技术快速鉴定分枝杆菌菌种被引量:1
- 2007年
- 目的 利用显色法芯片技术建立快速鉴定分枝杆菌菌种的方法.方法 根据美国国家生物技术信息中心(NCBI)提供的分枝杆菌16S rDNA基因的保守区和突变区(第129~267位核苷酸的A突变区、第430~500位核苷酸的B突变区)分别设计引物和寡核苷酸探针,用地高辛标记引物并制备玻璃芯片.采用双重PCR技术分别对16种分枝杆菌标准株、5种非分枝杆菌标准株和120株分枝杆菌临床分离株(非结核分枝杆菌40株、结核分枝杆菌复合群80株)进行扩增,扩增产物分别与玻璃芯片进行杂交检测,尼龙膜显色,以显现蓝黑色斑点作为阳性信号,并根据其在芯片方阵中的位置判断分枝杆菌种类.根据芯片杂交结果,选取部分经显色法芯片技术检测的临床分离株进行DNA测序.结果 16种分枝杆菌标准株和120株分枝杆菌临床分离株经PCR扩增均各产生2条DNA片段,其中1条长度为272~280 bp,1条长度为183~192 bp.16种分枝杆菌标准株均与芯片上特异性探针杂交,应用显色法芯片技术分析16种分枝杆菌标准株和5种非分枝杆菌标准株的特异性为100%.120株分枝杆菌临床分离株均与分枝杆菌属探针a杂交,其中79株确定为结核分枝杆菌复合群,38株确定为非结核分枝杆菌(不产色分枝杆菌17株,胞内分枝杆菌8株,猿猴分支杆菌6株,瘰疬分枝杆菌5株,偶然分支杆菌2株),另3株只与分枝杆菌属探针a杂交,没有鉴定到种.选取的26株分枝杆菌临床分离株(结核分枝杆菌复合群8株,不产色分枝杆菌5株,胞内分枝杆菌、猿猴分枝杆菌、未鉴定到种的分枝杆菌各3株,瘰疬分枝杆菌、偶然分枝杆菌各2株)DNA测序显示,未鉴定到种的3株分枝杆菌中,1株为结核分枝杆菌突变株,1株为 Mycobacterium lentiflavum,1株为 Mycobacterium arupense,芯片上无后2种菌株的特异性探针;其余23株菌株测序结果与芯片检测结果一致.结论 显色法芯片技术能简便、快速、灵敏、特
- 赵源胡忠义景奉香刘志辉王洁郑瑞娟陆俊梅赵辉尹俊
- 关键词:芯片分析技术分枝杆菌属聚合酶链反应
- EGFR基因突变检测试剂盒及其应用
- 本发明公开了一种用于EGFR基因突变检测试剂盒及其应用,其特征在于本试剂盒包含用于EGFR基因突变位点20条特异性扩增的引物、5条野生序列的高效封阻探针,4条EGFR基因特异性TaqMan荧光探针。该试剂盒可以检测突变拷...
- 景奉香鲍升林张冀申贾春平金庆辉赵建龙
- 文献传递
- 酶显色法基因芯片检测幽门螺杆菌克拉霉素耐药基因被引量:1
- 2009年
- 目的建立酶显色法基因芯片快速、准确检测幽门螺杆菌(Hp)克拉霉素耐药基因。方法设计一对引物,以地高辛标记其中一条引物,扩增Hp 23S rRNA部分基因,得到285 bp DNA片段,根据23S rRNA上的5个位点设计探针和制作芯片,扩增产物与芯片杂交,酶显色后扫描判读结果。结果63例Hp阳性标本中,芯片结果显示突变率:A2143G为3.17%、T2182C为11.11%、A2143G+T2182C为14.29%;酶显色法芯片和DNA直接测序法检测Hp 23S rRNA基因多态性结果符合率为96.83%;质粒浓度为1.53×102拷贝/μl时芯片法仍可检测到野生和突变信号。结论酶显色法芯片检测实现了高通量的同时具有较高敏感性和特异性,能同时检测23S rRNA的多种突变型,无需特殊仪器,可以用于指导临床合理用药和进行流行病学调查,有一定的临床应用价值。
- 宣世海周玉贵邵柏崔亚林周洁王琴徐康王惠民褚少朋景奉香金庆辉
- 关键词:基因芯片幽门螺杆菌克拉霉素耐药
- 念珠菌基因检测芯片及其制作方法和使用方法
- 一种念珠菌基因检测芯片及其制作方法和使用方法,是根据不同种类念球菌基因的特异片段序列,设计相应的寡核苷酸探针,然后将合成的探针固定在经过修饰的玻璃基片上,就构成念珠菌基因检测芯片,利用设计的特异性引物将待检测的DNA样品...
- 赵建龙张为朱利平景奉香赵辉徐元森
- 文献传递
- 结核分支杆菌耐药性检测芯片及其制作方法和应用方法
- 本发明涉及结核分支杆菌耐药性检测芯片及其制作方法和应用方法,主要是根据已知的结核分支杆菌耐利福平、异烟肼等的基因突变信息,设计相应的结核分支杆菌耐药性寡核苷酸探针,然后将合成的探针固定在经修饰的玻片上,从而构成结核分支杆...
- 赵建龙景奉香胡忠义孙斌孙悦徐元森
- 文献传递
- 基于锁核酸及等位位点特异性扩增技术的KRAS基因突变检测荧光定量PCR方法研究被引量:3
- 2017年
- 基于等位位点特异性扩增的原理,设计锁核酸修饰KRAS基因突变特异性扩增引物,结合封阻探针技术,建立检测KRAS基因突变的荧光定量PCR方法。结果发现,锁核酸修饰的引物及探针可显著提高等位位点特异性扩增技术用于复杂样本中的微量基因突变检测的敏感度,该技术检测KRAS基因突变的敏感性可达0.01%~0.1%。进一步用建立的荧光定量PCR方法检测52例结直肠癌患者血浆标本,并用DNA测序法作为对照,同时用健康人血浆标本建立阴性检测结果判读标准,以初步评价该方法应用于循环DNA中KRAS基因突变检测的可行性。结果发现结直肠癌患者KRAS基因突变主要是G12C、G12A和G12R,而且q PCR法的阳性检出率为46.15%,高于DNA测序法(13.46%),阴性结果与DNA测序法的符合率为100%。此外,结直肠癌患者外周血KRAS基因的突变检出率与文献报道组织标本中的突变检出率及常见突变类型基本相符。上述结果说明该方法检测循环肿瘤DNA(circulating tumor DNA,ct DNA)具有较高的可靠性,可以用于肿瘤患者循环血液中KRAS基因突变的检测。
- 刘明华景奉香李瑶吴海张冀申张亚龙孙文洁
- 一种基因芯片的金沉积检测方法
- 本发明提供一种基因芯片的金沉积检测方法,其特征在于所述方法包括将已知的DNA序列点样到微阵列上制备基因芯片,在待测核酸的5’端预先修饰一种生物大分子,以及在纳米金上标记与待测核酸上修饰分子匹配的另一生物大分子构建纳米金复...
- 景奉香贾春平张冀申王文涛金庆辉赵建龙
- 文献传递
- 一种基因芯片的膜转印检测法
- 一种基因芯片的膜转印检测法,在待检测样品的PCR扩增过程中,加入地高辛或生物素标记,然后将PCR产物与芯片进行杂交,杂交以后用抗体与地高辛或生物素标记结合,再用浸润了显色液的尼龙膜或硝酸纤维膜将杂交结果转印到膜上,使杂交...
- 赵建龙景奉香孙悦张为毛红菊赵辉
- 文献传递