孙孝德
- 作品数：6 被引量：43H指数：3
- 供职机构：上海海洋大学水产与生命学院更多>>
- 发文基金：山东省农业良种工程项目山东省优秀中青年科学家科研奖励基金山东省科技攻关计划更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 刺参基因组DNA提取的探讨被引量：3
- 2010年
- 以刺参为试验材料,分别以CTAB法、SDS法、Segama试剂盒法对刺参的触手、管足、体壁、纵肌、肠和呼吸树组织进行基因组DNA的提取,均得到了高质量的基因组DNA。Segama试剂盒提取DNA条带较其他两种方法清晰,杂质少且无降解,效果最佳。对比6种不同的刺参组织,其中纵肌组织3种方法均获得高质量基因组DNA,为提取基因组DNA的首选组织。开发了利用刺参触手和管足活体取样提取基因组DNA的方法,得到了高质量的基因组DNA,这为刺参无损伤取样提供了数据支持,使得将来刺参家系建立过程中保证亲体的健康存活及减少试验样品取样所带来的损伤成为可能。
- 孙孝德孙国华杨建敏吉成龙王卫军宋志乐
- 关键词：刺参基因组DNADNA提取CTAB法SDS法
- 刺参（Apostichopus japonicus）微卫星标记的筛选及群体分析
- 利用微卫星DNA技术对刺参微卫星标记进行筛选及其群体分析。首先,对刺参不同部位的DNA提取效果进行研究,分别以CTAB法、SDS法、Segama试剂盒法对刺参的触手、管足、体壁、纵肌、肠和呼吸树组织进行基因组DNA的提取...
- 孙孝德
- 关键词：刺参微卫星标记野生群体选育群体遗传分化
- 文献传递
- 刺参组织总RNA提取的研究被引量：1
- 2010年
- 利用Trizol法和两种RNA提取试剂盒对刺参的肠、呼吸树、纵肌、体壁等不同组织总RNA进行了提取。综合分析结果表明,F试剂盒提取刺参组织总RNA的效果较其他两种方法而言方法最适宜,能获得纯度高、污染少,而且无降解的高质量总RNA。刺参的肠组织富含RNA,且质地较软容易研磨彻底,是提取总RNA的最佳组织,可获得量大、质优的总RNA。
- 吉成龙孙国华杨建敏孙孝德刘爱英
- 关键词：刺参RNATRIZOL法
- 刺参(Apostichopus japonicus)野生及两代选育群体间遗传变异的微卫星标记研究被引量：10
- 2011年
- 应用微卫星DNA技术对野生刺参和两代选育刺参群体遗传多样性进行了研究。9对微卫星引物在三个刺参群体中共扩增获得43个等位基因,每个微卫星座位检测到的等位基因数为2—7个。三个群体的观测杂合度的平均值分别为0.6556、0.6704和0.6148,多态信息含量平均值分别为0.6654、0.5929和0.5275。结果表明,与野生群体相比,选育刺参两代群体存在杂合度降低,遗传多样性下降的现象。Hardy-Weinberg平衡的卡方检验及F-检验数据显示3个群体在某些位点都出现了杂合子缺失,偏离平衡的位点逐代增加,相邻世代之间遗传分化系数逐代减小,人工累代选育已经使群体的遗传结构发生了变化。FST平均值0.0443提示出选育群体处在较弱的分化水平,说明遗传变异主要来自于群体内个体间。遗传距离及遗传相似性结果显示随着选育世代的增加,世代之间遗传距离越来越小,遗传相似性越来越大,但与理论值仍有差距,选育群体刺参仍具育种潜力。
- 孙孝德孙国华袁廷柱杨建敏王卫军吉成龙宋志乐
- 关键词：刺参微卫星野生群体选育群体遗传分化
- 刺参微卫星标记与生长性状体重、体长的相关分析被引量：9
- 2011年
- 运用单标记分析法分析了10个微卫星位点与控制体重、体长数量性状的QTL的连锁关系。10对微卫星引物在8月龄具有生长性状差异的60个刺参个体基因组DNA中扩增得到50个等位基因,每个微卫星位点等位基因数3～7个,平均有效等位基因个数5.0。10个微卫星位点的多态信息含量为0.268 0～0.825 6不等,观测杂合度为0.083 3～0.666 7。采用SPSS软件对刺参的体重、体长生长性状和微卫星位点相关性进行分析,结果显示,微卫星位点AjSSR02基因型AB、AD、CD与体重和体长相关,AjSSR04标记中等位基因A对生长性状有正面影响,位点AjSSR06基因型FF个体仅平均体重与其他基因型个体显著差异,AjSSR09标记的A和B等位基因分别对生长性状具有正面和负面不同影响。
- 孙国华杨建敏孙孝德宋志乐王卫军刘小静
- 关键词：刺参微卫星生长性状
- 刺参(Apostichopus japonicus)EST序列中微卫星分布分析及其标记的筛选被引量：21
- 2010年
- 利用微卫星查找软件对现已公布的6632条刺参ESTs的数据库中2—6个碱基重复单元组成的简单序列重复进行筛选,进而对其微卫星的丰度和分布进行比较研究。共发现微卫星序列416个,占整个ESTs数据库的6.48%;其中含双碱基重复序列146个,数量最多,占ESTs数据库中发现微卫星序列总数的65.86%;三、四、五、六碱基重复序列分别占微卫星序列总数的26.68%、1.68%、0.24%、5.53%。对含有SSR位点符合微卫星引物设计的EST序列利用Primer软件结合人工方法设计合成引物21对,其中13对有扩增产物且均为多态位点。扩增产物变性聚丙烯酰胺胶电泳,统计每个微卫星标记等位基因数目,计算等位基因频率、观测杂合度、期望杂合度等统计学指标的评价。结果表明,在13个微卫星位点上,等位基因的数目从3到8不等,等位基因长度从175—382bp,观测杂合度和期望杂合度分别为0.158—0.650和0.198—0.841,所筛选微卫星标记可于遗传分析。
- 孙国华杨建敏宋志乐孙孝德王卫军张宇
- 关键词：刺参微卫星表达序列标签等位基因
