周晓锋
- 作品数:2 被引量:5H指数:2
- 供职机构:西安电子科技大学计算机学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金陕西省自然科学基金国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域:自动化与计算机技术生物学更多>>
- 一种基于统计的生物网络模体发现算法
- 随着2003年人类基因组计划的完成,生物信息学的研究已经进入后基因组学时代,基因组信息学研究重心开始从揭示生命的所有遗传信息转移到从分子整体水平上对基因功能的研究,从整体水平上反应着基因功能的生物网络成为研究的重点。基因...
- 周晓锋
- 关键词:统计模型
- 文献传递
- 非树型网络模体发现算法被引量:3
- 2009年
- 现有的大多数网络模体发现算法发现网络中的确切模体,但是由于生物数据是不完整的,有噪声的,而且生命过程具有动态性,概率网络模体具有更实际的意义.本文提出了非树型网络模体发现算法,寻找由一组相似子图组成的概率网络模体.在该算法中,首先提出子图挖掘算法ESN挖掘网络中所有给定规模的非树型子图,然后进行多图比对,最后基于统计模型和对应的得分函数,用模拟退火算法求得网络模体.对E.coli和Yeast的基因调控网络的仿真实验表明,该算法能够高效地发现生物网络中的概率模体.
- 覃桂敏高琳周晓锋
- 关键词:生物网络