刘志英 作品数:23 被引量:50 H指数:4 供职机构: 首都医科大学附属北京佑安医院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家科技重大专项 国家重点基础研究发展计划 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
总HIV-1 DNA定量检测技术的建立 被引量:3 2019年 目的建立一种基于实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)方法的1型艾滋病病毒(HIV-1)总脱氧核糖核酸(DNA)定量检测技术。方法构建了同时包含HIV靶基因和内参基因的质粒标准品,设计了涵盖我国主要HIV流行亚型的特异性引物和Taqman水解探针,对引物亚型覆盖面、灵敏度、特异性等相关指标进行了分析,进行了批内和批间重复试验。结果该检测方法所设计的HIV特异性引物和探针序列高度保守,成功检测12种常见及稀有HIV亚型;扩增灵敏度可达4个拷贝/PCR反应管,特异度100%;加入了细胞定量体系,做到了在同一个PCR反应管中既定量了HIV DNA,又定量了细胞数;批内和批间差异性的变异系数均在20%以内。结论该检测方法可用于HIV储藏库检测,评估联合抗病毒治疗的效果,可以用于"窗口期"HIV感染的辅助诊断以及HIV阳性母亲的新生儿HIV感染的诊断。 刘志英 袁霖 张欣 陆小凡 刘利锋 计云霞 夏炜 粟斌 吴昊 张彤关键词:艾滋病病毒 HIV-1 B'/C亚型毒株的复制动力学特点 2010年 目的分析不同疾病进展阶段B'/C亚型毒株的复制动力学特点。方法从长期不进展者(long-term nonprogressors,LTNPs)和AIDS期患者体内分离病毒株,用相同量的病毒株去感染正常人的去CD8+T淋巴细胞的外周血单个核细胞,通过检测感染后第0、3、6、9、12、18、21天的上清液中核衣壳蛋白p24(p24)含量,作出折线图来分析该毒株的复制动力学特征。结果从AIDS期患者体内分离的B'/C重组亚型病毒株的复制速度快且p24峰值高,而从LTNPs体内分离的B'/C重组亚型病毒株的复制速度慢且p24峰值低。结论从AIDS期患者体内分离的B'/C重组亚型病毒株复制能力较强,而从LTNPs患者体内分离的B'/C重组亚型病毒株复制能力较弱。 孙伟 焦艳梅 画伟 刘志英 石英 张彤 吴昊关键词:HIV-1 生物学 病毒复制 1型HIV感染多重PCR检测方法的建立及临床应用 被引量:3 2010年 目的建立检测人免疫缺陷病毒1型(HIV-1)的多重巢式PCR(nPCR)和多重反转录PCR(RT-PCR)方法。将其与已经上市的NASBA法试剂盒进行检测敏感性比较;探讨血浆RNA水平对PCR检测敏感性的影响;评价该方法用于我国HIV-1感染者诊断的价值。方法针对HIV-1的gag、pol和gp41区设计3套引物,建立检测HIV DNA的多重nPCR和检测HIVRNA的多重RT-PCR方法;分别以建立的PCR方法和NASBA法对119例HIV阳性患者进行检测,比较2者的检测敏感性;将患者分为不同的病毒载量组,比较PCR方法在各组患者中的检测敏感性差异;使用建立的PCR方法对10例可疑急性感染者进行检测;扩增HIV-1膜区C2-C3段,对nPCR检测阳性的43例DNA样本进行亚型鉴定。结果多重nPCR的检测敏感度为97.5%(116/119),多重RT-PCR的敏感度为78.2%(93/119),2者的特异度均为100%(50/50),多重nPCR和多重RT-PCR的阳性预测值分别为97.5%(116/119)和78.2%(93/119),阴性预测值均为100%(50/50),准确性分别为98.2%和84.6%。经比较,多重nPCR和多重RT-PCR的检测敏感度都高于NASBA法。在病毒载量<103copy/mL的患者,nPCR的检测敏感性高于RT-PCR,在病毒载量在(103~104)copy/mL的患者及病毒载量≥104copy/mL的患者,2者的敏感性比较相近,均接近100%;检测的10例可疑急性感染者中,有5例患者的nPCR和RT-PCR检测结果阳性,抗体在随访过程中阳转,证实为HIV急性感染者;检测的43例DNA样本分属于B’亚型(37例),AE亚型(5例)和BC亚型(1例)。结论本课题组建立的PCR检测方法可以对我国主要流行的B’、AE和BC亚型病毒株得到很好的扩增效果;nPCR的检测敏感性受血浆RNA水平的影响相对较小,RT-PCR的检测敏感性受血浆RNA水平的影响相对较大;PCR方法可以用于HIV急性感染者的早期诊断。 代丽丽 陈德喜 石英 魏飞力 刘志英 张洪海 吴亚松 梁连春 吴昊 张彤关键词:人类免疫缺陷病毒 核酸检测 聚合酶链式反应 巢式RT-PCR法检测HIV-1阳性者中庚型肝炎病毒感染的研究 被引量:1 2011年 目的调查HIV流行地区庚型肝炎病毒(HGV)在HIV阳性人群中的感染率,并探讨其对HIV病程的影响。方法根据已知并公认的HGV序列,设计特异巢式引物,建立HGVRNA的巢式RT-PCR方法,对100例HIV-1阳性感染者进行检测,同时进行CD4+T细胞计数和HIV病毒载量的测定。结果 100例HIV-1阳性者中检测出HGVRNA阳性感染者22例(22%);合并感染HGV的HIV感染人群体内可见有较高CD4细胞数。结论 HIV阳性感染者有较高的HGV重叠感染率,可能与其具有共同的传播途径有关,合并感染HGV似乎能延缓HIV感染者的病程。 徐萌 绳波 刘志英 陈德喜 吴昊关键词:庚型肝炎病毒 聚合酶链式反应 供血 北京市部分男男同性恋人群中HIV-1分子流行病学研究 被引量:23 2009年 目的了解北京市部分男男同性恋(men who have sex with men,MSM)人群HIV-1的分子流行情况,监测该地区人群HIV毒株的最新流行情况。方法提取17例男男同性恋者HIV-1抗体阳性样本全血基因组DNA,直接进行巢式PCR扩增HIVenv基因C2-V5区及gag基因P17-P24区,对PCR产物进行核苷酸序列测定和分析,确定基因亚型。结果17例患者中,共存在CRF01-AE、B亚型和CRF07-BC3种亚型,其中CRF01-AE9例(52.94%),B亚型5例(29.41%),CRF07-BC3例(17.65%)。结论小样本量的流行病学调查显示,北京地区部分男男同性恋人群中主要存在CRF01-AE、B和CRF07-BC3种亚型;CRF01-AE已取代B亚型而成为北京市MSM人群中HIV主要流行亚型,CRF07-BC重组亚型在北京市MSM人群中增长迅速。 刘志英 李海英 张彤 黄晓婕 魏飞力 徐萌 焦艳梅 徐小宁 陈德喜 吴昊关键词:男男同性恋 人类免疫缺陷病毒1型 北京市男男性行为人群庚型肝炎病毒感染率和流行亚型分析 2013年 庚型肝炎病毒(HGV,GBv-c)与丙型肝炎病毒同属黄病毒科,两者核苷酸有30%的同源性。GBV-C不引起感染人群肝病或其他疾病,感染数年后能自动清除。GBV-C与HIV具有相似的感染途径,大部分经血液、性接触或者母婴传播,所以在高危人群中存在很高的重叠感染。在HIV感染人群中GBV-C感染率明显高于正常人群,40%HIV感染者显示有活跃的GBV-C共同感染, 徐萌 绳波 寇卜心 宋凤丽 袁霖 吴昊 陈德喜 刘志英关键词:庚型肝炎病毒 男男性行为者 亚型分析 多引物小型集合HIV核酸检测技术的建立及在男男性接触者急性感染检测中应用 被引量:1 2010年 目的 建立结合多重反转录巢式PCR技术检测HIV RNA的小型集合NAT,用于MSM人群急性感染的筛查诊断.方法 利用2008年10月至2009年3月期间从3名HIV窗口期感染者、30名HIV慢性感染者、97名健康人采集冻存的EDTA抗凝血浆建立小型集合NAT.将10份待测标本混合组成1个集合,离心富集病毒,提取RNA 针对HXB2的nt5783-nt6228和nt1235-nt2012区分别设计2对引物 采用多重RT-PCR、巢式PCR扩增2个目标区的核酸片段,对结果阳性的集合中标本进一步分别检测.确定小型集合NAT的灵敏度,并进行验证.应用建立的方法对1 005份与上述标本同一时期收集的MSM人群的HIV抗体阴性血浆进行检测.结果 (1)成功扩增出目标区的2条特异性片段,灵敏度为162拷贝/ml (2)对3份HIV窗口期感染者标本用小型集合NAT方法盲法验证的结果和预期一致 (3)用多重RT-PCR和巢式PCR对30份HIV抗体阳性标本检测,阳性率100%(30/30) (4)发现1 005份血浆标本中有1份为HIV RNA阳性,追踪随访发现HIV-1抗体转阳.结论 本研究中建立多引物小型集合RT-PCR、巢式PCR结合的小型集合NAT的敏感性好,可用于MSM人群HIVG感染窗口期筛查检测. 吴亚松 刘志英 焦艳梅 魏飞力 徐萌 张彤 黄晓婕 张福杰 陈德喜 徐小宁 吴昊关键词:HIV感染 HIV-1 核酸扩增技术 20例HIV/AIDS患者耐药结果分析 被引量:4 2009年 目的对高效抗逆转录病毒治疗(highly active antiretroviral therapy,HAART)失败的HIV/AIDS患者,进行回顾性基因型耐药检测,了解HAART过程中HIV-1耐药位点的产生,分析基因型耐药检测在HAART过程中的必要性及指导意义。方法采用Versant HIV-1RNA3.0检测病毒载量;采用TriTEST CD4FITC/CD8PE/CD3PerCP Reagent检测CD4+T淋巴细胞计数;采用Trugene HIV-1Genotyping Kit和OpenGene DNA系统进行基因型耐药检测;用Blast等分子生物学软件进行HIV-1亚型分析。结果20例患者中,17例保存有治疗前的血浆标本,其中1例在治疗前即存在非核苷类逆转录酶抑制剂(non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors,NNRTIs)耐药相关突变。20例患者均进行了治疗后耐药检测,其中3例未检出耐药相关突变。其他17例检出耐药相关突变,其中13例出现NNRTIs耐药相关突变;突变位点主要为K103N、Y188L、Y181C、V106M和G190A;11例显示有核苷类逆转录酶抑制剂(nucleoside/nucleotidereverse transcriptase inhibitors,NRTIs)耐药相关突变,突变位点主要为M184V、T/215Y/F、D67N、K70R以及K219E/Q;3例出现蛋白酶抑制剂(protease inhibitors,PIs)耐药相关突变,其中主突变为M46I/L、V82F/A,而次级突变中以M36I、L63P出现的频率最高。20例患者中B亚型9例(45%,9/20),CRF01_AE重组亚型5例(25%,5/20),CRF07_BC重组亚型5例(25%,5/20),CRF06_CPX1重组亚型1例(5%,1/20)。结论对治疗失败的患者进行基因型耐药检测可以帮助医生判断HAART失败的原因,并指导治疗方案的优化;亚型分析显示HIV-1病毒亚型的流行与感染途径之间存在明显的联系。 魏飞力 吴昊 张彤 李庆 刘志英 王蕊 焦艳梅 陈德喜关键词:HIV-1 基因型耐药 建立反向PCR检测HIV-1整合位点的方法 被引量:4 2009年 焦艳梅 画伟 李娟 刘志英 陈德喜 李在村 张彤 吴昊关键词:PCR检测 整合位点 CD4^+T细胞 病毒治疗 病毒复制 病毒基因 90例猴痘临床特征分析 被引量:1 2023年 目的 分析北京市某传染病医院收治的猴痘患者的临床特征和结局。方法 回顾性分析2023年6—12月在首都医科大学附属北京佑安医院门诊和住院处就诊的90例猴痘患者的临床表现和实验室结果,总结患者的临床特点。结果 本研究中90例猴痘患者全部为男男性接触者,潜伏期为1~30 d,主要临床表现包括发热、皮疹和淋巴结肿大;患者的降钙素原(procalcitonin, PCT)中位值是0.12 mg/mL,C-反应蛋白(C-reactive protein, CRP)中位值是22.3 mg/L,均高于正常值。死亡2例。结论 猴痘患者以男男性接触人群为主,主要表现为发热、皮疹和淋巴结肿大,大部分患者预后良好,极少数患者可发展为重症,甚至死亡。 张美 彭芳 丁基龙 卢亚奇 阎本永 房媛 贾琳 贾寒 郑璐瑶 汪雯 黄晓婕 刘志英 张彤关键词:猴痘 男男性接触者 皮疹