郑正
- 作品数：37 被引量：82H指数：8
- 供职机构：华南农业大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家现代农业产业技术体系建设项目公益性行业(农业)科研专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- 通过比较基因组学方法分析柑橘溃疡病菌A和A^W型菌株的差异
- 2017年
- 本研究选取采自江西的感染柑橘溃疡病的脐橙样品进行病原分离,采用Illumina Miseq测序平台对分离得到的A型jx-6菌株进行全基因组测序,并与已发表的2株A型菌株和2株A^W型菌株进行比较基因组学分析。直系同源分析表明两种菌株核心基因簇3 887个,只有A^W型菌株具有特异基因簇,特异基因簇为216个。对这些特异基因簇进行分析结果显示大部分与生物代谢和细胞代谢过程有关。基因组共线性分析结果显示相比于A型菌株,A^W型菌株基因组存在翻转、易位、倒位等基因组重排事件。另外,对A型菌株和A^W型菌株的全基因组上存在的前噬菌体进行预测分析,结果显示A型菌株基因组含有3个前噬菌体区域,A^W型菌株基因组含有5个前噬菌体区域。通过比对发现A型菌株中的prophage2与A^W型菌株中的prophage2属于同一种噬菌体,其中A^W型菌株中的prophage4和prophage5两个前噬菌体区域正好插入在两个菌株共线性程度较低的部分。这些前噬菌体的插入及基因组重排有可能是导致A^W型菌株寄主专化性的原因所在。基于7个看家基因(atp D,dna K,efp,fyu A,gln A,gyrB,rpoD)的系统发育进化分析表明所有的A型菌株聚为一支,A^W型菌株聚为一支,这一结果与基因同源聚类分析的结果相一致。
- 陈峰郑正邓晓玲
- 关键词：柑橘柑橘溃疡病菌比较基因组学前噬菌体
- 一种基于噬菌体基因为靶标的柑橘黄龙病菌检测引物及其应用
- 本发明公开了一种基于噬菌体基因为靶标的柑橘黄龙病菌检测引物及其应用。本发明基于柑橘黄龙病菌中多拷贝的噬菌体CLasMV1与CLas的同源基因位点设计了特异性实时荧光PCR引物GP04‑F/GP04‑R，当黄龙病样本中含有...
- 郑正李紫怡邓晓玲许美容张玲王成
- 一种利用SSR分子标记引物体系分析柑橘黄龙病菌遗传多样性的方法
- 本发明公开了一种利用SSR分子标记引物体系分析柑橘黄龙病菌遗传多样性的方法。所述SSR分子标记引物体系包括33对Las-SSR可用引物，其中18对为SSR核心引物。本发明首次提出了基于SSR分子标记并结合PAGE电泳分析...
- 许美容邓晓玲郑正李昕昱洪红霞朱青
- 柑桔黄龙病菌在年桔病树枝条和果实桔络内的分布规律
- 2022年
- 本研究以感染黄龙病的年桔枝条(组)和果实为材料,通过定量Real-time PCR分析黄龙病菌(“Candidatus Liberibacter asiaticus”,CLas)在染病年桔枝条(组)及果实桔络中的分布规律。结果表明,在同一染病枝条(组)中CLas呈不均匀分布,只有果实组织(果蒂、果实中心柱和桔络)能稳定检测到CLas,且果实桔络部位的CLas浓度最高,显著高于其他部位组织(当年生叶中脉、当年生枝韧皮部、2年生及以上枝韧皮部)的CLas浓度。CLas在同一条桔络中的分布亦不均匀,其中,中端片段的CLas含量显著高于前端片段和后端片段(每条桔络从果蒂端起长1.5 cm的片段记为“前端片段”,此后每1.5 cm长的片段依次记为“中端片段”“中后端片段”“后端片段”),前端片段和后端片段的CLas含量差异不显著。研究结果可为进一步探究CLas在柑桔植株中的转运与增殖规律提供参考。
- 吕若亚李云郑永钦邓晓玲郑正
- 关键词：柑桔黄龙病年桔症状表现病原分布
- 一种基于水培柑橘枝条和菟丝子的柑橘黄龙病菌快速富集方法
- 本发明公开了一种基于水培柑橘枝条和菟丝子的柑橘黄龙病菌快速富集方法，通过采集田间感染柑橘枝条并构建对应的柑橘枝条水培体系，再建立基于柑橘枝条‑菟丝子的“<I>Ca</I>.L.asiaticus”富集体系，使“<I>Ca...
- 郑正邓晓玲许美容李桃
- 沙田柚耐黄龙病的机理研究
- 柑橘黄龙病(Citrus Huanglongbing)由候选的韧皮部杆菌Candidatus Liberibacter spp.引起,该病害给全世界柑橘生产造成严重威胁。目前尚未发现完全抗黄龙病的柑橘栽培品种,据田间调查...
- 戴泽翰吴丰年郑正许美容邓晓玲
- 关键词：黄龙病沙田柚耐病性转录组
- 文献传递
- 离体砂糖橘黄龙病病果中病菌浓度变化规律的探究被引量：2
- 2021年
- 柑橘黄龙病(Citrus Huanglongbing,HLB)是柑橘生产上最具毁灭性的病害,对我国乃至世界的柑橘产业造成了巨大的经济损失[1]。由于CLas还无法进行分离培养[2],导致对CLas的研究(如病原学、基因组学等)主要依赖于含有CLas的寄主材料,如染病柑橘和带菌柑橘木虱(Diaphorina citri)[3]。因此,获取含有高浓度CLas寄主材料成为了当前CLas研究的前提。
- 李桃郑正邓晓玲
- 关键词：柑橘木虱黄龙病柑橘生产砂糖橘柑橘产业
- 一种柑橘黄龙病菌荧光定量分析的内参基因及其应用
- 本发明公开了一种柑橘黄龙病菌荧光定量分析的内参基因及其应用，内参基因为<I>gyrA</I>和<I>ftsZ，</I>其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.9和SEQ ID NO.10所示。本发明首次筛选出适用于柑橘黄龙...
- 许美容郑永钦郑正邓晓玲
- 杂柑‘W·默科特’黄龙病菌分子鉴定和遗传多样性分析被引量：4
- 2019年
- 2017年12月在云南红河新引种的‘W·默科特’杂柑植株上发现疑似黄龙病的叶片斑驳及'红鼻子果'症状。采集疑似的叶片和果实,分别提取其叶片中脉和橘络的DNA,利用黄龙病菌的特异引物对其16S rRNA基因和β–操纵子基因进行PCR扩增,并对扩增产物进行测序分析。研究结果表明,采自云南的‘W·默科特’样品中PCR能够扩增出黄龙病菌的特异条带,通过上述基因进行系统发育分析,发现该病菌归属于黄龙病菌亚洲种;为了进一步探明这些黄龙病菌的遗传多样性,利用3种类型的原噬菌体特异性引物对样品进行扩增分析,结果表明采自云南的‘W·默科特’植株上的黄龙病菌遗传多样性较为丰富。
- 陈燕玲郑正许美容邓晓玲
- 关键词：黄龙病菌RRNA基因原噬菌体
- 黄龙病菌在4个品种柑橘果枝内的时空分布被引量：2
- 2022年
- 【目的】亚洲种韧皮部杆菌(‘Candidatus Liberibacter asiaticus’,CLas)是引起柑橘黄龙病(Citrus Huanglongbing,HLB)的优势种,也是引发我国柑橘HLB的唯一病原菌。探索CLas在柑橘果枝内的时空分布规律,有利于及时准确地对其进行检测,对HLB的防控具有重要意义。【方法】以砂糖橘、W.默科特、红心蜜柚和沙田柚不同生长期的果枝为材料,利用实时荧光定量PCR检测果枝CLas含量,研究其时空分布规律。【结果】CLas在病枝中分布不均匀,在果实处(橘络、果中轴或种皮)富集。对于宽皮柑橘的砂糖橘和杂柑的W.默科特,成熟期果实橘络中的CLas含量最高;而对于柚类的红心蜜柚和沙田柚,成熟期果轴中的CLas含量最高。砂糖橘果实膨大与成熟过程中,CLas随着营养物质的流动从源器官(叶片)向库器官(果实)分流并聚集;果轴和橘络中的CLas含量不断增加,且橘络中的CLas含量显著上升。【结论】CLas随着柑橘果实生长和成熟而汇集,结合源库理论可解析CLas在果枝上的运转和分布规律。
- 黄桢辉王娟高洁郑正郑正邓晓玲
- 关键词：柑橘黄龙病
