董贻诚
- 作品数:10 被引量:20H指数:2
- 供职机构:中国科学院生物物理研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学医药卫生更多>>
- Q156A天花粉蛋白的晶体结构研究被引量:1
- 1997年
- 核糖体失活蛋白(RIPs)是一类具有RNA N-糖苷酶活性的毒蛋白,它水解真核细胞28SrRNA第4324位腺苷酸的N-糖苷键,释放出一个腺嘌吟碱基,使核糖体失活。天花粉蛋白(TCS)是单链核糖体失活蛋白的重要代表。我们早已报道了天花粉蛋白0.173nm分辨率的晶体结构。关于天花粉蛋白结构与功能关系的深入研究,已经发表了天花粉蛋白与底物类似物的复合物晶体结构。我们还对一些保守残基的突变体进行了研究,其中R22LTCS和Y14F TCS的晶体结构已经测定,Arg22和Tyr14是位于活性口袋外,但与活性口袋又有密切联系的保守残基,其侧链形成的氢键也十分保守。在TCS晶体结构中还有一类保守残基形成的氢(盐)键也是十分保守的,它们是处于活性口袋之内的残基形成的,如Q156的NH_2与E189的OE2,Y111的OH与E160的OE2,R122的NH_2与E189的OE1等。为了探讨活性口袋内这些保守氢键对活性部位构象和活性的影响,我们用基因定位突变方法。
- 董贻诚朱日荣陈世芝李建辉邵鹏柱
- 关键词:突变体晶体结构天花粉蛋白核糖体失活蛋白
- 通力合作攻难关——青蒿素立体结构解析回眸有感被引量:1
- 2015年
- 2015年诺贝尔生理学或医学奖授予了爱尔兰科学家威廉·坎贝尔(William C.Campbell)、日本学者大村智(Satoshi Omura)以及中国药学家屠呦呦,以表彰他们在寄生虫疾病治疗研究方面所取得的成就,其中,屠呦呦在青蒿素的发现和治疗疟疾方面做出了杰出的贡献,使她成为历史上第46位获得诺贝尔奖的女性.
- 董贻诚赫荣乔
- 关键词:青蒿素寄生虫疾病药学家CAMPBELL倍半萜内酯绝对构型
- 天花粉蛋白Y14F/R22L定点突变及其活性研究被引量:2
- 1998年
- 利用多聚酶链式反应(PCR)技术,对天然天花粉蛋白(nTCS)基因在Tyr14和Arg22两个保守残基处同时进行定点突变,即Tyr14变成Phe,Arg22变成Leu,然后克隆到pET-8c高效表达载体上,构建成重组质粒pETY14F/R22L.经序列分析,定点突变的结果与预先设计的完全一致,突变后的天花粉蛋白命名为Y14F/R22LTCS.将pETY14F/R22L转化到E.coliBL21(DE3,pLysS)中,进行表达.经CM-SepharoseCL-6B柱纯化,SDS-PAGE鉴定,纯度可达90%.RIP活性测定显示,Y14F/R22LTCS的活性比nTCS降低了7.5倍,活性变化不显著,因此,TCS的Try14和Arg22对维持其活性部位构象并不是必需的.但由于Y14F/R22LTCS在E.coli中的表达量与nTCS相比明显下降,因此,Tyr14和Arg22可能与TCS翻译后的折叠有关.
- 姚宏兵吴伸董贻诚邵鹏柱
- 关键词:天花粉蛋白定点突变PCR
- α-苦瓜子蛋白晶体结构中的次级相互作用的研究──Ⅰ结构中氢键相互作用的分析被引量:1
- 1994年
- α-苦瓜子蛋白是一种单链核糖体失活蛋白,具有N-糖苷酶活性,2.0A分辨率的三维结构已经测定。α-苦瓜子蛋白中总共有353个氢键,其中主链原子间氢键165个,主链原子与侧链原子间氢键54个,侧链原子间氢键21个,蛋白分子中原子与溶水剂的氢键113个,主链C=O,主链NH及侧链分子结构中有95%的残基能生成氢键,Asp.Glu、Asn、Gln具有较强的生成多个氢键的能力,并对13个没有任何氢键的残基作了分析。An、Leu、Ile、GlU、Gln在α螺旋中出现税率较大,Val、Leu、Tyr、Ile、Thr在β结构中占了一半以上,Arg容易形成远程的氢键,而Ser、Thr则容易形成近程氢键。某些氢键,特别是保守残基间的氢键,对形成蛋白分子局部特征构象和活性部位的特征构象有影响,α-苦瓜子蛋白的特定折叠方式对其与溶剂水分子成氢键有影响。
- 王耀萍陈世芝董贻诚任景山
- 关键词:氢键
- 天花粉蛋白与底物类似物GAGA相互作用的计算机图象模拟被引量:2
- 1994年
- 以天花粉蛋白(TCS)晶体结构模型作为RIPs的代表,RNA四核苷酸GAGA作为底物类似物,用计算机图象模拟建立了TCS和GAGA相互作用的模型。利用这一模型解释了RIPs的N-糖苷酶活性的作用机制。这一模型对专一性识别也能解释,且与一些生化实验结果相符;对某些实变体的活性改变也能有相应的解释.
- 董贻诚黄岳顺梁曦云邵鹏柱杨显荣
- 关键词:天花粉蛋白核糖体失活蛋白计算机模拟
- α-苦瓜子蛋白晶体结构中的次级相互作用的研究Ⅱ疏水相互作用的分析
- 1996年
- α-苦瓜子蛋白结构模型中共有疏水残基141个,占践基总数的57%。其中128个疏水残基有相互作用,占疏水残基的91%。疏水残基之间的相互作用与其是否在α-螺旋或β片层内没有多大关系。本文着重分析了α-螺旋间和α螺旋与β结构之间的疏水相互作用;讨论了α5和大β片层中疏水残基与亲本残基的分布特点,这一特点对该蛋白分子最后折叠成特定的空间结构有重要影响。类似的情况在同源蛋白天花粉蛋白中也是存在的。
- 董贻诚陈世芝朱曰荣王耀萍
- 关键词:疏水相互作用晶体结构
- 栝楼籽核糖体失活蛋白的纯化、性质及晶体生长研究被引量:9
- 1998年
- 栝楼(Trichosantheskirilowi)籽经粉碎抽提、硫酸铵沉淀、阳离子交换及凝胶过滤柱层析等步骤,得到一种单链核糖体失活蛋白-Trichokirin(TCK).SDS-PAGE和IEF显示为单一条带,其分子量为29kD,pI≥9.3,含糖量约为1.75%.该蛋白对兔网织红细胞裂解液系统的蛋白质合成具较强的抑制活性,IC50为6.7×10-10mol/L.改进了纯化方法,提高了产率,并培养出晶体.
- 吴伸陈毓荃吕志强闫军董贻诚
- 关键词:蛋白质核糖体失活蛋白纯化晶体生长
- 凝乳酶β-转角突变体的构建、表达和性质分析被引量:4
- 1998年
- 为了阐明牛凝乳酶的第二个发夹结构中的Ⅵ型β转角的功能,利用基因突变技术,将该转角的氨基酸残基(Leu20Gly21The22Pro23Pro24Gln25)改为(Leu20GlyGlyGln25)、(Leu20SerGlyGln25)或(Leu20GlySerGln25),得到3个突变牛凝乳酶原表达质粒pMCGG,pMCSG和pMCGS。除pMCGS不能在大肠杆菌中表达外,pMCGG和pMCSG均能以包含体的形式进行表达,且表达水平与野生型相当。像野生型凝乳酶原一样,pMCGG和pMCSG的表达产物经过变性复性,均能自活化为假凝乳酶,而且复性后的酶原突变体在DEAESepharoseCL6B上的柱行为与野生型相类似,但突变体假凝乳酶的凝乳及水解酪蛋白活性均明显低于野生型。说明突变对酶原的折叠影响较小,但对酶的催化效率影响较大。
- 黎红晔张渝英董贻诚杨开宇
- 关键词:凝乳酶突变体
- neo Trichosanthin及其突变体Y70A neo Trichosanthin的晶体结构研究
- 1999年
- 天花粉蛋白(Trichosanthin,TCS)的一个亚型,neoTrichosanthin(n-TCS),及其突变体Y70An-TCS被克隆和表达为重组蛋白。用悬滴汽相扩散法得到n-TCS和Y70An-TCS的晶体。在MarResearch面探测器系统上分别收集了0.20nm和0.205nm分辨率的X射线衍射数据。用同晶差值傅立叶法解析了结构。最后晶体学R因子分别为0.183和0.184。键长的r.m.s.偏差分别为0.0016nm和0.0014nm,键角的r.m.s.偏差分别为2.930°和2.732°。n-TCS虽然与TCS有11个氨基酸的差别,但它们都不是活性口袋区的关键残基。并且这些氨基酸的替换绝大多数属于保守替换。和TCS相比,这11个残基及其附近残基的主链间形成的保守氢键在n-TCS中没被破坏,它们所处的二级结构也保持不变。所以n-TCS的整体结构与TCS十分相近。Y70An-TCS的晶体在收集数据前曾用含5'AMP的缓冲液浸泡过,活性口袋区没发现可与Adenine相匹配的密度。用HPLC检测Y70An-TCS与5'AMP作用后产物,层析图谱上相应位置也没有出现Adenine。上述结果表明,7?
- 颜丽吴伸李会广李建辉黄岳顺施庆利董贻诚
- 关键词:天花粉蛋白失活蛋白晶体结构
- 亚天花粉蛋白突变体(R163H n-TCS和R163Q n-TCS)的晶体结构研究
- 1999年
- 用悬滴汽相扩散法得到了R163Hn-TCS和R613Qn-TCS的晶体,在Mar-Research面探测器系统上分别收集了0.200和0.205nm分辨率的X-射线衍射数据。采用同晶差值傅立叶法解析结构,用X-PLOR软件包进行修正,最后的晶体学R因子分别为0.184和0.185,键长偏差分别为0.0013nm和0.0014nm,键角偏差分别为2.590°和2.815°。结构测定显示R163Hn-TCS和R163Qn-TCS与n-TCS的主链结构无较大变化,活性口袋区的结构和氢键体系发生了明显变化。生化分析表明R163Hn-TCS具有糖苷酶活性,R163Qn-TCS没有糖苷酶活性。这说明,第163位侧链的H+对n-TCS发挥N-糖苷酶活性至关重要。
- 李会广吴伸颜丽李建辉李建辉施庆利黄岳顺
- 关键词:突变体晶体结构