王进
- 作品数：59 被引量：235H指数：6
- 供职机构：南京大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金南京大学校科研和教改项目国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生农业科学经济管理更多>>
- 细胞核蛋白质磷酸化位点的预测方法研究被引量：2
- 2020年
- 以包含细胞核蛋白质磷酸化位点的肽段为对象,将文本向量化方法与机器分类算法相组合,开展了蛋白质磷酸化位点特征筛选和组合模型评价。结果表明:磷酸化位点下游第一个氨基酸及磷酸化位点氨基酸种类是两个重要特征。独热编码与支持向量机的组合模型综合效果最好,它在训练集上的准确率达91.6%,精准度达94.0%,召回率达89.2%。测试集上的结果表明:该模型也显示出了良好的泛化能力。本模型为亚细胞层面磷酸化调控的精细分析提供了有效方法。
- 余中洲高强阴玉涵张长青王进
- 关键词：磷酸化位点亚细胞定位细胞核
- 基于基因共表达权重网络分析乳腺癌亚型关键lncRNA
- 2019年
- 目的通过基因共表达权重网络分析(WGCNA)探讨长链非编码RNA(lncRNA)与乳腺癌的不同亚型性状及发病机制的关系。方法收集GEO数据库50个样本中不同乳腺癌亚型的转录组数据,以14 032个lncRNA的表达模式为基础,用WGCNA分析共表达的lncRNA构建聚类模块,并与乳腺癌亚型进行相关性分析。同时将各模块中关键lncRNA与18 904个蛋白编码基因做相关性分析,随后通路富集分析研究其功能。结果共检测到15个lncRNA模块,其中9个模块与乳腺癌的各亚型高度相关。预测到的关键lncRNA基因ADARB2-AS1,已有验证与乳腺癌HER2阳性亚型高度相关。通过联系基因表达矩阵,获得由关键lncRNA和mRNA构成的乳腺癌基因调控核心网络;被调控的基因富集于93个GO功能注释上。结论利用WGCNA方法,通过计算不同组织中的基因表达矩阵,鉴定有生物学意义的基因模块,可进一步验证lncRNA与乳腺癌的亚型特异性有关,有助于揭示乳腺癌相关受体以及各亚型产生的遗传机制。
- 徐琦王进
- 关键词：乳腺癌基因调控机制
- 尿激酶对纤维蛋白低亲和性的结构基础——Ⅰ.尿激酶及相关环饼结构域的三维结构预测被引量：3
- 1991年
- 根据凝血酶原(Prothrombin)环饼结构域-1(PTK-1)2.8晶体X光衍射结构,用残基置换和构型建造(Modeling)预测了纤溶酶原环饼结构域-1(PGK-1),组织型纤溶酶原激活因子环饼结构域-2(PAK-2)和尿激酶原环饼结构域(UKK)的三维结构。预测的三维结构显示PGK-1具有典型的配体结合部位,PAK-2在结构上不具有和配体结合的典型正电荷中心,但邻近的69位精氨酸残基能和配体的羧基生成离子对。UKK在结构上不能形成和配体结合的正负电荷中心,这可能是尿激酶对纤维蛋白低亲和性的主要原因。
- 刘建宁陆梁高翔王进朱德煦来路华徐筱杰唐有祺
- 关键词：尿激酶纤维蛋白
- 中国政务CIO制度建设研究
- 电子政务是影响政府机构管理与服务能力的重要因素，也是衡量一个国家综合竞争力的标志之一。推行电子政务，逐步实现政务信息化是我国政府面临的新课题。发达国家电子政务建设的成功经验，重要的一条就是确立了以政府CIO(chief ...
- 王进
- 关键词：CIO制度电子政务信息化建设行政管理体制政府职能转变
- 一种Solexa技术鉴定肺癌病人血清中微小核糖核酸的方法
- 一种Solexa技术鉴定肺癌病人血清中微小核糖核酸的方法属于生物医药技术领域。具体涉及一种测定肺癌病人血清中微小核糖核酸表达的Solexa技术，以及Solexa技术在肺癌的早期诊断、疗效评价和药效评价等临床诊断和治疗方面...
- 陈江宁王可慧高嵩张峻峰张辰宇蔡星殷媛郭继刚陈熹王进曾柯
- 文献传递
- 大肠杆菌全基因组碱基密度分布的层次结构分析被引量：3
- 2001年
- 应用新近发展的复杂系统层次结构理论来研究大肠杆菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ）全基因组序列碱基密度分布的统计规律．发现大肠杆菌基因组中不同碱基及不同碱基组合的密度分布满足明显的层次相似律，尤其是强氢键作用的Ｇ，Ｃ分布相对于弱氢键作用的Ａ，Ｔ分布具有不同的层次相似参数．反映了基因组碱基排列存在可测量的多尺度自组织结构．其生物学含义有待进一步探讨．
- 王进张琦栋任奎佘振苏
- 关键词：基因组测序碱基大肠杆菌密度分布
- 一种Solexa技术鉴定结肠癌病人血清中微小核糖核酸的方法
- 一种Solexa技术鉴定结肠癌病人血清中微小核糖核酸的方法，属于生物医药技术领域，具体涉及一种研究血清中微小核糖核酸表达的Solexa技术以及Solexa技术在结肠癌诊断中的应用。该方法包括应用Solexa测序方法测定结...
- 陈江宁蔡星殷媛张峻峰张辰宇王可慧郭继刚陈熹王进曾柯
- 文献传递
- 一种microRNA探针序列的设计方法
- 本发明公开了一种microRNA探针序列的设计方法，包括以下步骤：从基因组序列中收集所有能形成茎环结构的茎种序列；计算各茎种序列及其附近100nt～150nt区域序列所形成的RNA二级结构；根据microRNA前体茎环结...
- 王进何沉峰李颖新杨嵘严先昭龚晨光李捷周志华张辰宇
- 文献传递
- 血清中微小核糖核酸的检测方法和用于检测的试剂盒、生物芯片及其制作和应用方法
- 本发明涉及血清中微小核糖核酸分子的检测方法、用于检测血清中微小核糖核酸的试剂盒或生物芯片以及试剂盒和生物芯片的制作和应用方法，目的在于检测血清微小核糖核酸的变化，得到在疾病及正常生理状态下差异表达程度大的一类血清微小核糖...
- 张辰宇张峻峰陈熹巴一陈江宁王可慧殷媛蔡星张燕张红杰曾柯王进郭继刚
- 文献传递
- E·coli L-天冬酰胺酶B细胞抗原表位氨基酸残基Lys^(196)对其抗原性的影响被引量：2
- 2006年
- 目的:研究重组E.coli L-天冬酰胺酶B细胞抗原表位中关键氨基酸残基对其抗原性的影响。方法:以Ala为替代残基,对抗原表位192TPARKHTS199中Lys196进行PCR定点突变,双向免疫扩散法和间接ELISA法分析新型重组E.coli L-天冬酰胺酶的抗原性。结果:采用双向免疫扩散法和间接ELISA法检测,与重组E.coli L-天冬酰胺酶相比,新型重组E.coliL-天冬酰胺酶与重组E.coli L-天冬酰胺酶抗体结合率下降64%。结论:通过对重组E.coli L-天冬酰胺酶B细胞抗原表位关键残基的定点突变有效地降低了其抗原性。
- 陈建华徐欣吴梧桐姚萍刘广桢张艳丽王进
- 关键词：L-天冬酰胺酶抗原表位间接ELISA法
