文志丰
- 作品数:4 被引量:7H指数:2
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- 中国野葡萄锌指蛋白基因克隆及葡萄再生体系的建立
- 葡萄白粉病[Uncinula necato (Schw. )Burr.]是危害葡萄生产主要的真菌病害之一。中国野生华东葡萄白河-35-1对白粉病具有很高的抗性,因此进行华东葡萄抗白粉病基因克隆及其功能研究具有重要的意义。...
- 文志丰
- 关键词:锌指蛋白RACE生物信息学
- 文献传递
- 中国野葡萄锌指蛋白基因的克隆及生物信息学分析
- 2010年
- 【目的】在受白粉病菌侵染的中国野葡萄叶片中克隆锌指蛋白基因全长,研究葡萄抗白粉病的分子机制。【方法】在前期采用mRNA差异显示技术获得的中国野葡萄华东葡萄株系白河35-1抗白粉病基因表达差异cDNA片段T11GG/B0324-292的基础上,利用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆了该cDNA全长序列,并结合生物信息学方法对所获取的序列进行分析。【结果】该cDNA全长2663bp(GenBank登录号HM008621),具有完整的开放阅读框,基因全长2223bp,编码1个由740个氨基酸组成的锌指蛋白(Zinc finger protein),5′和3′非翻译区长度分别为395和44bp。多重比较分析表明,该基因推导的氨基酸序列与拟南芥、蒺藜苜蓿、水稻的C3H亚型CCCH型锌指蛋白的同源性分别为61%,70%和60%。【结论】利用RACE技术获得了锌指蛋白基因全长,为进一步研究锌指蛋白基因与葡萄抗白粉病的关系奠定了基础。
- 文志丰赵素平王西平王倩
- 关键词:白粉病锌指蛋白转录因子RACE生物信息学
- 白粉菌诱导的中国野生毛葡萄抑制消减文库构建及EST序列分析被引量:3
- 2010年
- 【目的】构建白粉菌诱导下中国野生毛葡萄"商-24"的抑制消减文库,获得抗白粉病差异表达基因EST序列。【方法】应用抑制消减杂交(Suppression subtractive hybridization,SSH)技术,构建白粉菌诱导下高抗白粉病的中国野生毛葡萄"商-24"叶片SSH-cDNA文库,通过生物信息学方法对文库中的EST序列进行分析。【结果】成功构建了白粉菌诱导的中国野生毛葡萄"商-24"抑制消减cDNA文库,对消减文库测序后获得了200个EST序列,大小为300~1000bp;BLAST分析表明,其中19个EST序列与已知功能基因序列同源性很高,分别参与了植物的防卫反应、胁迫反应、细胞解毒和信号转导等。【结论】获得了葡萄抗白粉病的EST序列,这为进一步克隆抗葡萄白粉病基因、探明其抗病分子机理奠定了基础。
- 赵素平文志丰侯鸿敏肖欢王跃进王西平
- 关键词:毛葡萄抗白粉病消减文库
- 中国野生葡萄编码NB-ARC结构的抗白粉病基因克隆及功能分析
- 葡萄(Vitis spp.)是世界上重要的经济水果,葡萄白粉病是由葡萄白粉菌(Uncinula necator[Schw.]Burr.)引起的危害葡萄生产的主要真菌病害之一,给葡萄生产造成巨大的经济损失。中国野生华东葡萄...
- 文志丰
- 关键词:中国野生葡萄白粉病抗病性
- 文献传递