张法
- 作品数：62 被引量：124H指数：5
- 供职机构：中国科学院计算技术研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国科学院知识创新工程重要方向项目国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学医药卫生理学更多>>
- 基于旋转和平移不变性的分子图像识别算法
- 2012年
- 目的探讨冷冻电镜分子图像的识别方法,为快速、准确的分子图像识别研究提供有效帮助。方法提出一种新的分子图像识别算法,可以生成旋转不变性和平移不变性的特征,并且采用基于分治思想的优化策略,显著地提高了算法的识别精度。结果在基准测试集上,同当前主流分子图像识别算法进行了对比,识别率优于其他算法。结论基于旋转和平移不变性特征的分子图像识别算法,有效解决了噪声的干扰和分子图像取向随机性的问题,提高了算法的识别精度。基于分治思想的优化策略,显著地提高了算法的识别速度。
- 张阳德任菲张法金鑫
- 生物序列拼接算法--phrap的并行化研究
- 生物序列的拼接是生物信息学中常见的问题,其中phrap算法是目前最流行的拼接算法之一.然而phrap算法在处理大规模数据时的运算速度以及对内存的庞大需求,已经成为需要迫切解决的问题.文章从提高算法的运行速度和降低内存的需...
- 张法刘志勇乔香珍刘玮
- 关键词：生物信息学并行化
- 文献传递
- Single-shot Self-Supervised Cryo-Electron Tomography Volumetric Image Restoration with Sparsity Constraint
- ＜正＞Cryo-Electron Tomography （cryo-ET） is a powerful 3D imaging tool used for the reconstruction and visualizat...
- 张法
- 文献传递
- 多租户数据中心能效优化方法、系统及联合建模方法
- 本发明涉及一种多租户数据中心能效优化方法、系统及联合建模方法，包括：基于边际收益递减规律，建立租户收益与租户当前使用的服务器数量之间的效益函数；基于效益函数与实际空闲服务器需求，计算服务器共享市场单价；租户基于市场单价确...
- 张法王有识刘志勇池策王蕊
- 文献传递
- 数据中心能耗模型及能效算法综述被引量：38
- 2019年
- 近年来,云计算技术发展迅猛.作为云计算的物理平台和重要基础设施,数据中心的数量和规模都得到了前所未有的发展.与此同时,数据中心极低的资源利用率和巨大的能耗问题日益突出,数据中心能效的研究已经成为了近年来学术界与工业界关注的热点.针对数据中心能效的基本问题,研究了基于资源和任务调度的数据中心节能关键技术,从能效模型与能效算法的角度总结了数据中心服务器系统与网络系统的节能研究进展和最新成果,涵盖能效分析、能耗模型、分类标准和策略算法4个方面,并且展望了数据中心能效优化研究的发展趋势.
- 王继业周碧玉张法石翔曾楠刘志勇
- 关键词：能耗数据中心系统模型
- 结合位点进化距离与支持向量机的蛋白质分类方法被引量：6
- 2008年
- 生物信息学的一个关键的研究课题是理解细胞的分子机制,这依赖于对基因所决定的每一条蛋白质的含义或者功能的理解.一般通过与一条或多条功能已知的蛋白质的相似性比较来推测未知蛋白质的功能,其中,基于支持向量机的一些算法取得了很好的成果.SVM-pairwise算法是当前最好的基于支持向量机的算法中的一个,该方法利用两条序列的相似性来将蛋白质序列转化为固定长度的向量.文中提出了一种新的利用支持向量机算法对蛋白质序列进行分类的方法,这种方法使用位点进化距离代替两条序列的比对得分,该方法比SVM-pairwise有着显著的改善,在蛋白质结构分类数据库(SCOP)上进行的实验表明,该方法具有比SVM-pairwise更好的分类性能.
- 李玉岗张法刘志勇
- 关键词：生物信息学内核支持向量机
- 冷冻电镜数据处理与生物大分子三维重构
- Cryo-electron microscopy(Cryo-EM)is increasingly becoming the premier method for determining the three-dimensi...
- 张法
- 一种基于磁共振血管造影图像的脑血管分割方法和系统
- 本发明提出一种基于磁共振血管造影图像的脑血管分割方法和系统.发明目的是解决现有的基于统计模型的MRA图像脑血管分割方法中对细小血管的分割效果较差，血管的连续性不足的问题。针对已有模型中采用的单高斯模型来刻画脑血管灰度值分...
- 万晓华吕智龙张法王醒策刘新宇
- MPI+OpenMP在生物序列拼接算法phrap并行化中的应用
- 生物序列拼接问题,是生物信息学中的关键问题之一.phrap算法是目前最常用的拼接算法,然而phrap算法的运行时间以及对内存空间的庞大需求,已成为生物数据处理的瓶颈.针对这一问题,本文分别对phrap算法的3个步骤提出了...
- 张法陈子阳刘玮
- 关键词：MPI并行计算机体系结构
- 文献传递
- 基于曲线投影模型的电子断层三维重构并行算法
- 2015年
- 大尺度高精度的电子断层三维重构可以获得在更大视角下的生物大分子三维结构的细节信息。但研究尺度的增大给获取高精度重构结果和缩短数据处理时间带来了巨大的挑战。TxBR提出的曲线模型显著提高了重构的精度,但其计算比直线模型更复杂耗时,且在曲线模型下,之前的并行策略不再可行。针对这一问题,提出了一种在GPU平台上实现的针对曲线模型的分块迭代并行算法。通过对曲线模型的研究发现,曲线模型具有一定的空间局域性,利用这种性质提出了一种纵向的分块方式。在算法的实现阶段,提出一个基于页的数据传输策略,从而能够去除冗余的数据传输,减少数据传输带来的时间消耗。实验结果显示,本算法可接近40倍的加速比。
- 张静蓉万晓华张法
- 关键词：分块GPU并行
