单志 作品数:32 被引量:151 H指数:8 供职机构: 四川农业大学 更多>> 发文基金: 四川省教育厅自然科学科研项目 国家科技重大专项 四川省教育厅科学研究项目 更多>> 相关领域: 生物学 一般工业技术 理学 医药卫生 更多>>
基于Discovery Studio平台对TGF-β1中药小分子抑制剂的虚拟筛选 被引量:2 2021年 目的:利用中药化学专业数据库与TCMSP分析平台,运用计算机辅助药物设计技术对转化生长因子-β1(TGF-β1)蛋白进行虚拟筛选,寻找潜在的中药小分子抑制剂。方法:通过Discovery Studio 2.5(DS)软件进行药效团模型的构建,应用Hypogen算法预测出潜在活性位点,并分别使用Ramanchandran Plot和Profile-3D评估模型,利用优化的模型进行对实验中药小分子库进行虚拟筛选,最后对筛选出的中药进行ADMET性质预测和分子动力学模拟。结果:应用Hypogen算法成功预测出6个潜在活性位点且模型表现良好,成功从黄芪、丹参、三七中筛选出4种与TGF-β1结合良好的天然小分子化合物,并分析了其结合模式。结论:黄芪、丹参、三七的抑癌效果很可能是通过抑制TGF-β1的激活实现的。 唐彪 王浩翔 付晓丽 黄璐 陈惠 唐自钟 姚慧鹏 单志 王刚 肖义蓉关键词:转化生长因子-Β1 分子对接 磁修饰酵母对直接大红染料的生物吸附 被引量:3 2009年 本研究采用水相合成的纳米级铁磁流体对灭活酿酒酵母细胞进行磁修饰,获得了具有良好磁响应的酵母。傅立叶变换红外光谱分析表明,该修饰酵母在Fe-O特征峰581cm1处的吸收明显加强。透射电镜观察表明,纳米磁性颗粒单个或成团聚集在酵母细胞表面。在本实验条件下,160μL磁修饰酵母对1mL浓度为0.4mg/mL直接大红染料吸附率达100%;8min达到吸附平衡;在70%乙醇中,染料脱吸附率为99.18%。由于磁修饰酵母吸附力强,吸附速度快,易于磁分离,是一种有前景的水溶性染料生物吸附剂。 吴琦 单志 沈茂 李双江 陈惠关键词:酿酒酵母 直接大红 生物吸附 促进载体和插入片段连接的方法 本发明公开了载体和插入片段连接的方法,包括如下步骤:(1)使用限制性内切酶处理插入片段,然后使用碱性磷酸酶处理酶切片段;(2)使用相应的限制性内切酶处理载体;(3)酶切载体以及碱性磷酸酶处理的插入片段通过DNA连接酶连接... 陈惠 王德华 廖燕 吴琦 韩学易 单志 唐自钟文献传递 超声合成Fe3O4@SiO2复合纳米磁性粒子用于质粒DNA的提纯 被引量:12 2009年 用超声合成了Fe3O4@SiO2复合纳米磁性粒子,并用于质粒DNA的提取.用透射电镜(TEM)、红外光谱(FT-IR)、震动样品磁场计(VSM)、X光电子能谱仪(XPS)等方法对合成的复合磁性粒子的表面形貌、结构、磁性质等进行了表征,合成的复合磁微粒粒径分布均匀,在15~20nm,磁响应性好.用该复合磁微粒提取DNA的纯度能达到A260/A280=1.8±0.1,琼脂糖电泳证明质粒DNA结构基本没有被破坏,主要为超螺旋结构,能满足PCR等后续分子生物学操作的要求. 王显祥 王森 杨婉身 单志关键词:超声 DNA “双一流”建设背景下生物化学混合式教学改革的研究与实践 2023年 生物化学课程是农业院校重要的专业基础课,文章在分析生物化学课程现状的基础上,提出构建以“学”为中心的“三环节+双主体+双提高”教学模式,通过抓好课前、课中和课后“三环节”,激活教师与学生“双主体”的互动共振,实现教师教学能力和学生学习能力的“双提高”,探索线上与线下结合的混合式教学改革实践,推动传统课堂教学模式改革创新。 赵海霞 姚慧鹏 布同良 吴琦 单志关键词:生物化学 混合式教学模式 磁响应酵母对直接黄R染料的吸附动力学研究 2011年 采用水相合成的纳米级铁磁流体对灭活酿酒酵母细胞进行磁修饰。将具有良好磁响应的酵母用于吸附直接黄R染料。结果表明:在染料质量浓度为600μg/mL时,磁修饰酵母对该染料的吸附率为92.616 5%,吸附量为1 109.512 2μg/mg,20 min达到吸附平衡;吸附方式用Langmuir吸附等温线拟合较好(R2=0.999 1),属于单分子层吸附,符合二级表观动力学方程,吸附过程主要由化学机制控制。由于磁修饰酵母比同质量下单独的酵母和铁磁流体吸附容量大,吸附速率快,易于磁分离,在水溶性染料废水的处理上具有应用潜力,有助于减轻其对土壤和水体环境的污染。 李双江 沈茂 吴琦 单志 陈惠关键词:酿酒酵母 吸附动力学 CdX(X=Se,Te,Te/ZnS)量子点脂质体的制备及毒性比较 被引量:8 2009年 在水相中以巯基乙酸(mercaptoacetic acid,MA)为稳定剂合成了CdSe、CdTe、CdTe/ZnS量子点及谷胱甘肽(glutathione,GSH)为稳定剂合成了CdTe量子点,然后通过卵磷脂和胆固醇修饰制得相应的量子点脂质体。溶血实验证实GSH修饰量子点的溶血率低于MA修饰的量子点45%;脂质体修饰后,量子点的溶血率<5%,达到生物医用材料要求。不同表面修饰的量子点对小鼠毒性存在明显差异,荧光显微镜观察组织切片证实量子点在小鼠体内主要分布在肺、肾、胸腺等组织中,而脂质体量子点在脑组织中富集明显。 王显祥 杨中科 郭敏 刘怡 黄娟 单志 杨婉身关键词:溶血 毒性 产外切葡聚糖酶真菌的筛选鉴定及毕赤酵母中的表达 被引量:8 2014年 【目的】外切葡聚糖酶是纤维素酶组分中一类对结晶纤维素有降解作用的酶类,如何提高外切葡聚糖酶活力是研究的关键问题。【方法】从筛选鉴定得到的一株产外切葡聚糖酶酶活较高的黑曲霉Asp-524菌株出发,通过PCR技术克隆得到外切葡聚糖酶基因序列,生物学信息分析后,构建了毕赤酵母诱导型表达载体,实现了该基因在毕赤酵母中的成功表达。【结果】抗性筛选得到的阳性转化子,用终浓度为1%甲醇诱导5 d后,酶活达到4.74 U/mL。酶学性质分析显示重组外切葡聚糖酶最适pH为5.0,pH稳定性分析显示在pH为4.0-6.0范围内相对稳定,酶活能保持在最高酶活力的80%以上,最适反应温度为50°C,经60°C保温1 h后,酶活仍能保持80%以上。【结论】结果说明该外切葡聚糖酶具有较好的热稳定性和pH稳定性,这一研究为纤维素酶的实际应用奠定了一定基础。 唐自钟 刘姗 韩学易 晋海军 陈惠 刘默洋 单志 吴琦关键词:毕赤酵母 菌种鉴定 羧基功能化纳米磁性粒子的合成、表征及在质粒DNA纯化中的应用 纳米磁性粒子(magneticnanoparticles,MNPs)是以磁性Fe3O4或γ-Fe2O3等为晶核,高分子基质或表面活性剂为壳经包被或包埋而形成的一种新型复合功能材料。除了微米级磁性微球所具有的超顺磁性和功能... 单志关键词:纳米磁性粒子 质粒DNA 超顺磁性 纳米材料 文献传递 植酸酶phyA^m基因结构延伸突变改善酶的热稳定性 被引量:13 2005年 将来源于黑曲霉N25的植酸酶基因phyAm重组于大肠杆菌表达载体pET30b(+),以重组表达载体pET30bFphyAm为模板经PCR扩增获得结构延伸突变植酸酶基因phyAe(在植酸酶基因C端增加了来源于pET30bFphyAm载体上13氨基酸残基)。含突变基因的重组表达载体pPIC9kphyAe在GS115酵母中表达。纯化的突变酶PPNPe与野生型酶PPNPm8相比:PPNPAe的最适反应温度上升了3℃,75℃处理10min,热稳定性提高21%,比活力略有提高。最适反应pH为5.6,有效pH范围pH4.6到pH6.6。比未突变酶扩大了0.4单位。 陈惠 王红宁 杨婉身 赵海霞 吴琦 单志关键词:植酸酶 毕赤酵母 热稳定性