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植物类胡萝卜素裂解氧化酶研究进展被引量：11: 2014年; 类胡萝卜素是重要的四萜类脂溶性抗氧化剂,普遍存在于整个生物界。植物中类胡萝卜素通过其氧化酶催化裂解形成的脱辅基类胡萝卜素及其衍生物在影响农作物风味,调控植株形态建成,参与脱落酸形成等方面具有重要调控作用。CCOs基因家族编码的酶可以特异性的剪切类胡萝卜素的共轭双键形成不同类型的脱辅基类胡萝卜素产物。因此,参与类胡萝卜素代谢的CCOs酶及其裂解产物得到广泛的研究。本文从CCOs家族的数量与分布,酶结构及其生物功能三方面进行综述,并对CCOs家族未来的研究方向进行展望,以期为该领域研究提供有益参考。; 韦艳萍庞欣刘云飞李志邈叶青静王荣青阮美颖姚祝平周国治杨悦俭万红建; 关键词：类胡萝卜素

番茄热激蛋白90的全基因组鉴定及分析被引量：16: 2014年; 热激蛋白90（Heat shock protein 90，Hsp90）是植物应对不良环境胁迫产生的一类特定的抗逆蛋白。文章以番茄（Solanum lycopersicum L.）基因组数据为平台，借助生物信息学方法对Hsp90基因家族进行鉴定与分析。结果表明，番茄至少含有7个Hsp90基因，不均匀分布在6条染色体上，氨基酸序列长度为267~794aa，内含子数目为2~19；共线性分析发现两对基因（Hsp90-1和 Hsp90-3，Hsp90-5和 Hsp90-7）以片段重复形式存在。MEME（Multiple Em for Motif Elicitation）分析显示，番茄Hsp90基因编码的氨基酸序列具有多个保守基序；聚类分析揭示番茄、水稻（Oryza sativaL.）和拟南芥（Arabidopsis thaliana L.）Hsp90基因可以分为5组，存在3对直系同源基因和4对旁系同源基因；基于RNA-seq数据库表达分析发现，3个基因（Hsp90-5、Hsp90-6和Hsp90-7）在营养器官和生殖器官中表达量较高，4个基因（Hsp90-1、Hsp90-2、Hsp90-3和Hsp90-4）除在番茄转色后10 d的果实中表达量较高外，其余组织中表达量均较低；对Hsp90基因启动子序列进行分析，发现了多个参与植物对逆境胁迫的顺式作用元件，如 HSE、CCAAT-box。此外，qRT-PCR 检测结果表明，在叶片热胁迫条件下，番茄Hsp90基因的表达量均存在增强趋势，表明这些基因参与了番茄叶片应对高温胁迫的反应。研究结果为鉴定番茄Hsp90基因的功能和进化起源奠定了基础。; 刘云飞万红建杨悦俭韦艳萍李志邈叶青静王荣青阮美颖姚祝平周国治; 关键词：番茄热激蛋白基因重复

番茄NBS-LRR抗病基因家族全基因组分析被引量：23: 2014年; NBS-LRR(nucleotide-binding site and leucine-rich-repeat)是植物中最大类抗病基因家族之一。番茄基因组测序完成为全基因组水平上分析NBS-LRR抗病基因家族提供了机遇。利用生物信息学方法对番茄NBS-LRR抗病基因家族成员数目进行鉴定,并对其染色体定位和系统发育关系进行了分析。随后,将番茄和马铃薯NBS-LRR抗病基因进行了比较基因组学分析。结果表明:番茄基因组共包括252个NBS-LRR抗病基因,分布于番茄12条染色体上;63.5%的基因成簇存在,大部分为串联重复;系统发育关系分析表明番茄CC-NBS-LRR(CNL)亚家族较其他亚家族扩展程度大;同线性分析发现番茄中共79个NBS-LRR抗病基因与马铃薯基因具有同源关系。结果将为番茄NBS-LRR抗病基因家族的深入研究提供依据,同时也为利用番茄NBS-LRR基因进行基因定位以及相关抗病基因克隆等奠定基础。; 刘云飞万红建韦艳萍李志邈叶青静王荣青阮美颖姚祝平周国治杨悦俭; 关键词：番茄 NBS-LRR 抗病基因

植物NBS-LRR抗病基因的结构、功能、进化起源及其应用被引量：24: 2014年; NBS-LRR(nucleotide binding site-leucine rich repeat)是植物中所含抗病基因数目最多的基因家族,也是植物基因组中最大的基因家族之一。本文全面综述了国内外植物NBS-LRR抗病基因家族的研究进展,主要包括植物NBS-LRR抗病基因的克隆、结构、功能及其起源进化;进一步阐述了该基因家族在抗病基因同源序列克隆、分子标记开发、基因定位等方面的应用,同时对植物NBS-LRR抗病基因家族研究中存在的问题及未来研究方向进行了探讨。本文旨在为进一步开发和利用NBS-LRR抗病基因提供理论依据,为其他抗病基因的研究提供参考。; 刘云飞万红建李志邈叶青静王荣青阮美颖姚祝平周国治韦艳萍杨悦俭; 关键词：植物 NBS-LRR 抗病基因

蔗糖代谢途径关键基因参与白菜叶球形成的机制: 白菜作物(Brassica rapa,2n=20,AA),是十字花科芸薹属“禹氏三角”中重要经济栽培作物之一,分布地域广,形态多样性丰富。白菜生长发育过程中,如种子的萌发,低温春化诱导的开花形成,花粉的发育,叶球的形成等...; 韦艳萍; 关键词：白菜蔗糖代谢转录组蛋白组; 文献传递

菊分支NCED酶分子特征及进化分析被引量：2: 2015年; 为探究9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶（NCED）基因家族进化特性,本文利用生物信息学方法,对菊分支类群已完成测序的植物（包括番茄、马铃薯、烟草、甜菜、猴面花）基于全基因组进行NCED基因家族鉴定,并对其蛋白序列特征,保守基序,次级结构以及系统发育关系进行分析。结果表明,NCED酶是由小基因家族编码的酶,其成员为2~4个。蛋白质氨基酸大小在505~652aa之间,分子质量为56.23~71.42 k Da,除Sl NCED6外,其余各蛋白的等电点均表现为酸性,保守基序分析发现各成员均包含10个保守基序,其长度在29~50之间。此外,NCEDs蛋白结构分析显示,一级结构氨基酸序列N端保守性较低,而次级结构均表现为高度保守。系统发育关系发现,来自番茄的Sl NCED5、Sl NCED6与来自马铃薯的St NCED5、St NCED6分别为直系同源蛋白,这与生物学上的亲缘关系一致。; 韦艳萍刘云飞许桂梅万红建李志邈叶青静王荣青阮美颖姚祝平周国治杨悦俭; 关键词：生物信息学进化

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韦艳萍

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