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成纤维细胞生长因子在软骨发育过程中的基因芯片分析及相关研究被引量：4: 2009年; 目的榆测并分析促分裂原活化蛋白激酶（MAPK）信号通路中成纤维细胞生长因子（FGF）在软骨发育过程中的基囚表达规律；通过细胞培养观察FGF基因对骨髓基质干细胞（BMSCs）生长特性的影响。方法用基因芯片技术建立妊娠胎鼠肢芽软骨发育过程的基因表达谱，分析MAPK信号通路中碱性成纤维细胞生长因子（bFGF）在软骨发育过程中的基因表达规律。构建bFGF质粒并转染至培养的BMSCs中，用MTT法、免疫组织化学、HE染色、RT—PCR及酶联免疫吸附法检测bFGF基因转染BMSCs的效果及产物表达。结果MAPK信号通路中的FGF在软骨发育过程中的软骨形成关键期表达显著上调，并肩动MAPK信号通路，促进软骨形成。bFGF基因转染的BMSCs生长活力较强，可以保持2周以上；HE染色显示细胞增殖旺盛，胞核深染；RT—PCR表明有bFGF的基因表达；酶联免疫吸附法检测bFGF表达量高。结论FGF能够启动MAPK信号通路从而促进软骨形成。bFGF质粒转染BMSCs后可促进BMSCs的增殖，细胞有向软骨细胞分化趋势。; 唐欣徐忠世杨述华陈雨辰李奇余从年杨操李进许伟华; 关键词：成纤维细胞生长因子软骨寡核苷酸序列分析骨髓细胞

利用基因芯片技术研究FGFR3在小鼠胚胎肢芽不同发育阶段的表达被引量：2: 2008年; 目的检测在软骨发育分化过程中具有重要作用的成纤维细胞生长因子受体3(FGFR3)在小鼠胚胎肢芽发育过程中的表达。方法采用小鼠全基因组Affymetrix mouse4302.0芯片检测小鼠胚胎肢芽发育不同阶段的基因表达,并进行组织学染色观察。结果FGFR3在E12.5d开始呈现明显的表达上调,在E13.5d达到上调顶峰,E14.5d后FGFR3表达逐渐下调。结论FGFR3的表达与胚胎肢芽软骨发育过程密切相关,在软骨的发育分化过程中发挥着重要的作用,并可作为前软骨细胞的特异性标记物。; 唐欣余从年杨述华陈雨辰李奇杨操李进许伟华; 关键词：成纤维细胞生长因子受体3 软骨发育基因芯片小鼠

生物芯片研究中的生物信息学分析: 生命科学研究进入'后基因组时代',基因组研究的重心转向了基因功能的研究.本文就基因芯片的生物信息学数据处理与分析方法做出了概括性介绍.; 陈雨辰李奇; 关键词：生物芯片技术生物信息学基因芯片; 文献传递

老年骨关节炎患者软骨组织的基因芯片分析被引量：3: 2010年; 目的观察老年骨关节炎(OA)患者软骨组织中细胞凋亡相关基因表达的差异,探讨相关基因与OA导致的软骨退变之间的关系。方法选择老年OA患者5例及对照者5例,应用基因芯片技术检测所获取的软骨组织中细胞凋亡相关基因的差异表达,并进行基因表达通路查询。结果与正常对照者相比,老年OA患者软骨组织中共有11个与细胞凋亡相关基因出现显著差异表达,其中IL-1、TNF-α、IGF、SMPD1及MMP-1表达上调,这些基因主要涉及MAPK信号通路。结论与免疫相关的多个基因的差异表达可能是老年人OA软骨退变发生的关键因素。; 唐欣吕猛王洪陈雨辰许伟华杨操李进杨述华; 关键词：骨关节炎基因表达白细胞介素类肿瘤坏死因子Α

骨形态发生蛋白2与血管内皮生长因子在软骨内成骨过程中的基因表达被引量：6: 2008年; 目的检测并分析骨形态发生蛋白2（BMP-2）及血管内皮生长因子（VEGF）在骨发育基因表达谱及诱导成骨过程中表达规律及相互作用，为工程化BMP-2蛋白在骨科临床治疗中的运用提供依据。方法应用基因芯片技术建立妊娠胎鼠肢芽发育成骨过程的基因表达谱，分析BMP-2与VEGF在发育成骨过程中的表达规律；检测VEGF mRNA在小鼠外源性工程化BMP-2蛋白体内诱导软骨内成骨过程中表达情况，结合组织学、免疫组织化学观察结果与基因表达谱分析结果，分析BMP-2与VEGF在软骨内成骨过程中的相互作用。结果BMP-2及VEGF在发育成骨过程的基因表达谱中以及VEGF表达信号在外源性BMP-2诱导的体内软骨内成骨过程中，均呈现以诱导间质细胞向软骨细胞分化一肥大．吸收直至骨形成这一过程为轴线的时间-浓度表达关系。结论BMP-2及VEGF在骨发育及诱导成骨过程中均存在协同促进作用，工程化BMP-2蛋白将在骨科临床治疗中得到更广泛的运用。; 唐欣傅德皓杨述华陈雨辰李奇余从年许伟华李进叶树楠; 关键词：寡核苷酸序列分析骨形态发生蛋白质类血管内皮生长因子软骨内成骨

Function and Chromosomal Localization of Differentially Expressed Genes Induced by Marssonina brunnea f.sp.multigermtubi in Populus deltoides: 2007年; A total of 1,160 differentially expressed genes induced by Marssonina brunnea f. sp. muhigermtubi were identified in Populus deltoides cv. ＇Lux＇（1-69/55） with two-colour cDNA microarray including 2,952 cDNAs from two cDNA libraries constructed with 72 h inoculated poplar leaves. Functional analysis showed that 1,160 genes were classified into 11 functional categories that are involved in metabolism （15.9%）, signal transduction （9.5%）, transcription and replication （8.7%）, and cell rescue and defense （7.8%）. Among them, 926 genes were sporadically localized on 19 linkage groups. Chromosome 2 contained 102 （11%） differentially expressed genes, followed by chromosome 1 which contains 93 genes （10%）, and chromosome 17 had the least number of differentially expressed genes. Clustering of expressed sequence tags （ESTs） in poplar genome was observed at the terminal regions of several chromosomes. The relationship between cluster of genes and plant defense response would be further studied.; 张燕梅张新叶陈雨辰王琦王明庥黄敏仁; 关键词：POPLAR

SOX9基因在软骨发育过程中的表达谱分析及其质粒转染鼠骨髓基质细胞的实验研究被引量：4: 2008年; 目的检测并分析SOX9基因在软骨发育过程中的表达规律；构建其质粒并转染至培养的骨髓源基质细胞（BMSCs）中，通过细胞培养观察SOX9基因对BMSCs生长特性的影响，为可能的骨关节炎（OA）基因治疗提供理论基础。方法用基因芯片技术建立妊娠胎鼠肢芽软骨发育过程的基因表达谱，分析SOX9基因在软骨发育过程中的表达规律；用噻唑蓝（MTT）法、免疫组织化学、苏木素-伊红（HE）染色、反转录-聚合酶链反应（RT—PCR）及酶联免疫吸附试验（ELISA）法检测SOX9基因转染MSCs的效果及产物的表达。结果SOX9基因在软骨发育过程中的软骨形成关键期表达显著上调；pDC316-SOX-9质粒转染骨髓基质细胞后可促进骨髓基质细胞的增殖，细胞有向软骨细胞分化趋势。结论SOX9能够促进软骨形成，SOX9基因质粒转染的MSCs可望在软骨组织工程临床治疗中得到更广泛的运用。; 唐欣徐忠世杨述华陈雨辰李奇余从年杨操李进许伟华杜靖远; 关键词：芯片分析技术 SOX9基因间质干细胞

Caspase-3在间质干细胞分化过程中的基因芯片分析及体外作用被引量：3: 2008年; 目的观察Caspase-3在小鼠胚胎肢芽间质干细胞分化过程中的作用，并将其运用于体外间质干细胞模型中进行验证。方法用基因芯片技术检测Caspase-3在小鼠胚胎肢芽间质干细胞分化过程中的基因表达，分析其表达规律和可能作用；应用Caspase-3活性检测试剂盒，荧光比色法和Western blot法检测体外培养的骨髓间质干细胞诱导失巢凋亡中Caspase-3活性的改变；借助流式细胞仪分析骨髓间质干细胞凋亡的变化。结果Caspase-3在小鼠胚胎肢芽间质干细胞向软骨分化的关键期（E12）出现显著的表达下调；Caspase-3的活性以及蛋白表达水平随诱导凋亡时间的延长而明显升高，且与细胞凋亡率相关。结论Caspase-3蛋白在体内和体外诱导间质干细胞凋亡的过程中均发挥着重要作用；胚胎发育过程中，通过下调Caspase-3的表达以促进软骨形成，而抑制Caspase-3的活性可以有效降低细胞凋亡率。; 唐欣冯建军陈雨辰李奇许伟华杨操李进杨述华; 关键词：基因芯片半胱天冬酶3 间质干细胞脱噬作用

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陈雨辰

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