钮冰
- 作品数：59 被引量：206H指数：8
- 供职机构：上海大学更多>>
- 发文基金：上海市技术标准专项上海市科学技术委员会资助项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：轻工技术与工程理学生物学医药卫生更多>>
- 联合检测多种马属动物病毒的环介导等温扩增引物组合物及其应用
- 本发明提供了一种联合检测多种马属动物病毒的环介导等温扩增引物组合物、一次性离心式微流控芯片、LAMP微流控芯片试剂盒及其核酸检测方法。环介导等温扩增引物组合物包含核苷酸序列如SEQ ID：1～SEQ ID：16所示。一次...
- 高家乐钮冰陈沁王艳冯之航薛俊欣
- 基于便携式拉曼高光谱成像技术的散装奶粉中硫脲可视化现场快速检测方法研究被引量：1
- 2022年
- 硫脲是一种含氮量高、毒性较大的潜在蛋白掺假化合物,常规的实验室检测方法过程复杂、效率低,无法满足口岸对大批次散装奶粉样本质量快速筛查的需求。为解决口岸抽样监管缺乏快速实时评价方法的难题,利用自主搭建的便携式点扫描拉曼高光谱成像系统,开发了一种简单高效的奶粉中硫脲现场可视化快速检测方法,确保散装奶粉在进出口环节的精准监管。研究以不同添加浓度(0.005%~2.000%)的硫脲奶粉混合物为样本,分别用Whittaker平滑方法和自适应迭代重加权惩罚最小二乘算法(airPLS)消除光谱数据的背景随机噪音信号和荧光背景干扰,峰值识别后对硫脲特征位移处的单波段数据进行二值化处理,得到混合样本感兴趣区域的二值热图,通过二值图中硫脲像素点的有无和坐标,对奶粉中的硫脲进行定性判别和定位分析。进一步分析得感兴趣区域内硫脲像素点数目与添加浓度的关系,结果表明随着添加浓度的增加,硫脲像素点数目呈线性增长趋势,其中线性拟合的决定系数(R^(2))为0.9913,硫脲的最低检出浓度为0.05%。在0.25%,0.60%,1.20%和1.50%的添加水平下,利用像素点数目和线性拟合关系预测奶粉中硫脲的浓度,结果显示预测浓度的相对误差范围为-9.41%~4.01%,相对标准偏差小于7%。该点扫描拉曼高光谱成像系统能在10 min内完成单个样本的检测,结合软件控制系统,实时对奶粉中的硫脲颗粒进行定性、定量和污染分布分析,方法简单高效、准确性好、灵敏度高、稳定性强,为口岸现场对散装奶粉中硫脲掺假物的实时快速检测提供了技术监管手段,能显著提升口岸现场散装样本的监管环节质量评价的精准性,为进口奶粉快速通关提供技术保障。
- 杨巧玲陈沁钮冰邓晓军马金鸽古淑青于永爱郭德华张峰
- 关键词：硫脲奶粉
- 两种分子分型技术在乳制品克诺罗杆菌污染溯源分析上的比较被引量：5
- 2018年
- 对2005-2006年进口婴幼儿配方奶粉等乳制品的原料及产品中分离获得的49株阪崎肠杆菌(Enterobacter sakazakii),通过二代测序技术获得其全基因组序列,并比较两种分子分型技术的优缺点。通过二代测序技术获得49个菌株的全基因组序列,通过fusA确定菌株种属,根据多位点序列分型(Multi-locus Sequence Typing, MLST)确定序列型(ST, Sequence type)。再对32株ST13菌株进行单核苷酸多态性位点分析(single nucleotide polymorphism, SNP),并构建进化树。结果 49株阪崎肠杆菌均确认为阪崎克罗诺杆菌(C.sakazakii)。49株C.sakazakii由8个ST(Sequence type,序列型)组成。ST13的菌株占分离菌株的绝对优势(65.3%, 32/49)。ST13菌株的SNP结果显示32株菌被分成4个组和5个独立的菌株。表明随着高通量测序技术的不断完善,通过全基因组序列的MLST分型方法完成初步分型,而针对遗传相似性很高的菌株,应用SNP分析深入分型,能对被克罗诺杆菌属(Cronobacter spp.)污染的乳粉进行快速溯源,对全球疫情调查有重要意义。
- 郭清艳钮冰杨捷琳
- 关键词：全基因组测序多位点序列分型单核苷酸多态性位点
- 重组酶介导的等温扩增结合CRISPR/Cas12a检测志贺氏菌和克罗诺杆菌
- 2024年
- 目的应用重组酶介导的等温扩增技术(recombinase-aided amplification,RAA)结合成簇规则的间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR),建立志贺氏菌和克罗诺杆菌的快速检测方法。方法通过筛选志贺氏菌和克罗诺杆菌特异性基因,设计特异扩增引物、CRISPR脱氧核糖核酸(CRISPR deoxyribonucleic acid,crDNA)和探针,将靶标进行RAA扩增后,建立CRISPR检测方法。对方法的灵敏度、特异性和应用性进行评价,并与国标检测方法进行对比。结果本研究对志贺氏菌和克罗诺杆菌纯菌液DNA最低检出限分别为4.9×10^(3) CFU/mL、4.4×10^(4) CFU/mL,基因组DNA最低检出限为6.8×10^(‒3) ng/μL、5.7×10^(‒3 )ng/μL,特异性好,与其他病原菌无交叉反应。同时,该方法成功检测出加标猪肉样品和人工污染奶粉中的志贺氏菌和克罗诺杆菌,比国家标准检出限更低。结论本研究建立的RAA-CRISPR方法可有效应用于志贺氏菌和克罗诺杆菌的检测,这为快速筛查食品中是否污染这两种病原菌提供重要价值。
- 张欣悦杨钰娟孔祥翔杨捷琳钮冰陈沁刘志勇
- 关键词：志贺氏菌
- 克罗诺杆菌在特殊环境中耐受性与耐药性的研究进展被引量：6
- 2020年
- 克罗诺杆菌是一种严重威胁婴幼儿健康的食源性致病菌,主要通过婴幼儿食品传播,易使婴幼儿患上如脑膜炎、坏死性小肠结肠炎等致死性疾病。克罗诺杆菌可在干燥、高温等不适合微生物存活的环境中生存,为详细了解克罗诺杆菌在特殊环境中的特性,本文从克罗诺杆菌的耐干燥性、耐热性、耐酸碱性以及耐药性的角度介绍了其目前的研究进展,研究结果将对食品生产尤其是婴幼儿食品生产的安全、临床治疗上提供医学方法,从而保障人类的健康具有重要意义。
- 陈翠玲钮冰杨捷琳赵丽娜蒋原
- 关键词：耐受性耐热性耐药性
- Adaboost算法研究土壤微量元素含量与白血病的关系(英文)
- 2014年
- 目的:本文使用数据挖掘方法研究土壤中微量元素和白血病的相关性。方法:使用CFS-Adaboost算法研究我国29个省、市、自治区白血病死亡率的统计数据和土壤中微量元素含量的对应关系。结果:从29种微量元素中发现了13种微量元素与白血病相关,其中砷(As)的相关性较为明显。基于该13种微量元素,建立了土壤中微量元素和白血病致死率的数学模型,该模型的预报准确率可达到89.7%。结论:土壤中微量元素的含量与白血病有一定关系,其中砷(As)元素含量与白血病死亡率较为密切,这与近年文献报导的少量氧化砷治疗白血病效果显著相符合。以上研究发现,可以为研究土壤中微量元素和白血病的关系提供参考,对白血病的防治工作具有一定意义。
- Isabel Cristina Echeverri Ocampo陈丁滢钮冰陈付学
- 关键词：白血病微量元素ADABOOST算法
- 膜蛋白分类在线预报方法
- 本发明公开了一种膜蛋白分类在线预报方法。本方法是利用机器学习方法Bagging对一个膜蛋白数据库样本进行学习，输出学习模型。预报器载入学习模型，输入数据转换器由Web客户端提交的膜蛋白序列码转换所得只包含“0”和“1”的...
- 金雨欢陆文聪钮冰刘亮王丽
- 文献传递
- 一种长江流域非法捕捞风险的预测方法及系统
- 本发明涉及一种长江流域非法捕捞风险的预测方法及系统，其中该方法基于故障树分析法将长江流域的非法捕捞活动作为顶部事件，分解非法捕捞事件的成因并基于故障树采用层次分析法确定各成因的权重；结合故障树和层次分析结果对非法捕捞进行...
- 钮冰许文诺韦苏航陈沁
- 多位点序列分析方法在克罗诺杆菌属菌株溯源分析上的应用被引量：4
- 2019年
- 克罗诺杆菌(Cronobacter)是一种急性细菌病原体,最初因与新生儿重症监护室爆发的几起致死性疾病(脑膜炎,坏死性小肠结肠炎)相关而受到人们广泛关注。目前Cronobacter PubMLST基因组和序列定义数据库(http://pubmlst.org/cronobacter/)中已包含超过2400多株克罗诺杆菌分离菌株的序列信息,阪崎克罗诺杆菌1774株,丙二酸盐阳性克罗诺杆菌295株是其中的优势菌种,这些菌株共分离自40多个国家和地区。通过将7个位点的多位点序列分型(7-loci multilocus sequence typing,7-lociMLST)方案应用于2438株克诺罗菌株,共揭示了591种可定义的序列型(sequencetype,ST),其中ST4(334株)、ST1(280株)、ST7(78株)和ST13(67株)为主要序列型。7-lociMLST对于克罗诺杆菌的致病型分型鉴定有很大帮助,但由于MLST所针对的七个基因位点在基因组总量中占比较小,导致同一ST型中包含地理来源,分离时间,宿主等不相关的菌株,而对菌株溯源结果适得其反。为了解决这一问题,本研究进一步采用基于直系同源基因簇的多位点序列分析方法(Clusters of Orthologous Genes MLST, cogMLST(1865-loci)),对PubMLST中240株已完成全基因组测序的菌株,包括阪崎克罗诺杆菌ST1(67株),ST4(95株),ST13(43株)和丙二酸盐阳性克罗诺杆菌ST7(35株)进行了全基因组序列分析。结果显示,cogMLST可对ST型相同,但无相关性的菌株进行进一步分型,且不同聚类与菌株分离国家及来源之间存在一定相关性。这或许对于相同ST克罗诺杆菌属菌株的全球溯源分析及食源性疾病监测有较大帮助。
- 闫瑞杨捷琳陈翠玲钮冰徐之雯蒋原
- 关键词：多位点序列分型
- 深度学习在野生动物保护中的应用被引量：3
- 2023年
- 野生动物是重要的生物资源之一,但是人类活动的增加和自然环境的恶化严重威胁着野生动物的生存。而深度学习已经成为人工智能领域重点研究方向之一,被广泛应用于各个学科领域,其灵活性使得它在野生动物保护中的图像识别、监测和音频识别等方面展现出了巨大的潜力。本文介绍了几种常见的深度学习算法,综述了不同深度学习模型在野生动物保护中的应用,分析了目前存在的问题及挑战,包括有限的训练数据、环境条件的多变性以及野生动物行为的复杂性等。在未来利用深度学习保护野生动物,除了要解决数据获取和利用、图像的抗干扰等方面的挑战外,还需开发更加稳健和高效的深度学习模型,以满足野生动物保护的特殊需求。
- 钟俊杰钮冰陈沁陈翔王艳
- 关键词：图像识别野生动物保护
