郝博搏
- 作品数:5 被引量:49H指数:4
- 供职机构:中南林业科技大学更多>>
- 发文基金:国家林业公益性行业科研专项湖南省研究生科研创新项目国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 濒危植物观光木遗传多样性及遗传结构分析被引量:23
- 2014年
- 采用筛选的8条ISSR引物对濒危植物观光木13个野生种群的遗传多样性及遗传结构进行分析,结果显示:物种和种群水平上多态性位点百分率分别为79.67%和46.84%,Shannon表型多样性指数分别为0.3880和0.2192,与木兰科其他近缘植物相比,遗传多样性水平较高;分子方差分析表明,观光木野生种群间遗传分化系数为0.3752,种群间存在显著的遗传距离;STRUCTURE分析和UPGMA聚类表明,参试的13个野生种群可分为3大类群;相关性分析表明,种群间遗传距离与其地理距离呈显著正相关。南昆山、笔架山、弄相山种群的遗传多样性最丰富,建议优先加以保护。
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- 关键词:观光木ISSR标记
- 伯乐树cpDNA-PCR反应体系的优化与引物筛选被引量:7
- 2013年
- 伯乐树为国家一级保护植物,在研究被子植物的系统发育和古地理、古气候等方面具有重要的科学价值。cpDNA-PCR反应是在分子水平上确定伯乐树系统分类的基础。建立了伯乐树cpDNA-PCR反应体系,对影响扩增反应的因素(Mg2+浓度、dNTP浓度、引物浓度以及模板DNA浓度)进行了优化,得到了伯乐树cpDNA-PCR扩增反应的最佳体系,并筛选出了适合伯乐树分子谱系地理研究的非编码区序列和引物。伯乐树cpDNA-PCR最佳反应体系为:30μL反应体系含有10×PCR buffer、2.9 mmol Mg2+、120 mmol dNTP、上下游引物各11μmol、DNA模版30 ng以及3个单位的Taq酶。适合于伯乐树分子谱系地理学研究的3对引物及其退火温度为PipetB1411F-PipetD738R(52℃)、psbA-trnHGUG(59℃)、trnL-trnF(56℃)。
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- 关键词:伯乐树CPDNA引物筛选
- 伯乐树种群遗传多样性及遗传结构被引量:14
- 2013年
- 了解种内遗传变异信息是制定种群遗传多样性保护策略的前提。伯乐树(Bretschneidera sinensis)是古老的单科属孑遗植物,被列为国家一级保护植物。为了揭示伯乐树天然种群的遗传多样性和遗传结构,采用7条ISSR引物分析了采自湖南、江西、广东、广西和贵州5个省区15个天然种群的219株个体的样本。结果显示,伯乐树遗传多样性水平较高,物种和种群水平上的多态位点百分率(PPB)分别为74.42%和38.06%,Shannon’s表型多样性指数(I)分别为0.3630和0.2081,Nei’s基因多样性指数(He)分别为0.2397和0.1405。种群间遗传分化显著,基于表型多样性指数和分子方差分析揭示的伯乐树天然种群间遗传分化系数分别为FST=0.4267、GST=0.2973。UPGMA聚类表明,参试的15个天然种群可分为2大组群;Mantel检测发现,种群间遗传距离与其地理距离存在显著相关性(r=0.3096,P=0.008)。基于上述研究结果,我们认为,伯乐树濒危原因不是种群遗传进化潜力小,而是由于生境破坏严重,以及自身繁殖能力低、适应性差、竞争力弱等生物学特征导致的。建议优先保护遗传多样性较为丰富的阳明山、莽山、乳阳、八面山种群,并对种群近交衰退开展相应的监测工作。
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- 关键词:SINENSISISSR标记种群遗传结构濒危机制
- 基于ISSR标记的杉木种源遗传多样性分析被引量:6
- 2014年
- 为从分子水平探讨杉木(Cunninghamia lanceolata)种源空间遗传变异模式,采用ISSR分子标记对杉木全分布区内的40个种源进行遗传多样性分析。结果显示:9条ISSR引物共检测出133条带,其中122条多态性条带,多态条带百分率(PPB)为91.73%,各种源PPB和Shannon表型多样性指数(HPOP)分别为37.46%~55.75%和0.201 5~0.344 5,物种水平多态性条带百分率和Shannon信息指数(HSP)分别为89.86%和0.565 5;分子方差分析(AMOVA)揭示,种源间遗传分化系数(ΦST)为0.4651,这表明杉木种源具有较高的遗传多样性,种源间遗传分化较大。UPGMA法聚类表明,参试的40个杉木种源可分为7地理种源区。
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- 关键词:杉木种源ISSR标记
- 杉木遗传多样性的ISSR研究
- 杉木(Cunninghamia lanceolata(Lamb.)HooK)属杉科(Taxodiaceae)杉木属的高大乔木,为第四纪冰期的孑遗植物,是我国南方最主要的造林树种之一,分布于我国南方16个省区,其中,黔东南...
- 郝博搏
- 关键词:杉木种源ISSR标记