谢彤
- 作品数:30 被引量:101H指数:7
- 供职机构:天津市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金:国家科技重大专项国家自然科学基金艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 天津市监狱羁押人群结核病患者分离菌株的分子流行病学研究
- 2021年
- 目的研究天津地区监狱流行的结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)菌株的主要基因型,菌株间的进化关系以及结核病在监狱羁押人员中传播的主要模式。方法选取天津市结核病控制中心参比实验室菌株库中保存的2013年1月至2016年6月来自天津市监狱管理局羁押人员不同结核病患者痰标本中分离培养的124株MTB菌株,采用多重PCR试验检测菌株基因组中RD105差异区域的缺失情况以鉴定北京基因型MTB;使用15个VNTR位点对菌株开展基因分型研究,根据菌株的成簇情况评估天津地区监狱羁押人员结核病近期传播的水平。结果天津监狱结核病患者分离培养的124株MTB菌株中,北京基因型MTB为116株,占全部分析菌株的93.5%。全部124株MTB菌株的VNTR基因分型显示93株(75.0%)为基因分型同簇株,共形成了18个基因分型簇,其中最大的分型簇由25株北京基因型MTB组成,其余的31株MTB为基因分型独特型。基因分型数据经最小生成树算法分析显示,124株MTB被分为3个基因型。其中116株北京基因型MTB组成了其中的1个基因型;8株非北京基因型菌株中,3株MTB和5株MTB分别组成另外2个基因型。结论天津监狱羁押人员中,北京基因型MTB传播的最为广泛,是绝对优势菌株。基因分型表明近期传播(外源性感染)是MTB在监狱羁押人群中传播的主要模式。
- 赵慧谢彤王春花巨韩芳孙蕊李旭
- 关键词:分子流行病学可变数目串联重复序列监狱
- 116株结核分枝杆菌链霉素耐药菌株rspL和rrs基因突变特征研究被引量:5
- 2010年
- 谢彤李桂莲巨韩芳赵德福赵慧穆成王撷秀
- 关键词:耐药菌株链霉素结核分枝杆菌突变特征氨基糖苷类抗生素RPSL基因
- 直接涂片法与沉淀涂片法检测结果评价
- 目的直接痰涂片法具有简便、快速和廉价特点,当天出结果,但敏感性低,通常需5000~10000菌/ml才能够得到阳性结果。就直接涂片法与离心沉淀涂片法检测结果进行比较分析,评价离心沉淀涂片法在筛查涂阳肺结核患者的应用价值。...
- 吴振萍穆成巨韩芳谢彤赵德福
- 关键词:涂片方法
- 文献传递
- 利用可变数目串联重复序列基因分型方法鉴定结核分枝杆菌混合感染
- 目的结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis MTB)的基因分型研究证实了肺结核患者可以同时感染2株或2株以上的 MTB。该研究目的是评估由12个 VNTR 位点组成的结核分枝杆菌散在分布重复单...
- 赵德福谢彤巨韩芳吴振萍王撷秀
- 文献传递
- 应用液态芯片技术建立结核分枝杆菌间隔区寡核苷酸基因分型方法
- 2014年
- 在结核病的分子流行病学研究中,间隔区寡核苷酸基因分型法(spaceroligonucleotidetyping,Spoligotyping)是主要的MTB基因分型方法,其分型原理是根据MTB基因组中存在多拷贝的正向重复序列,在特定的2个正向重复序列之间的是否存在非重复间隔序列,不同的菌株可能存在差别。Spoligotyping分型通过分析MTB基因组中43个正向重复间隔序列存在的多态性来区分不同菌株,并根据相邻3个间隔序列的存在情况,
- 谢彤王撷秀王春花巨韩芳王志锐穆成赵慧
- 关键词:基因分型方法寡核苷酸结核分枝杆菌SPOLIGOTYPING芯片技术液态
- 利用多重PCR方法快速鉴定结核分枝杆菌北京基因型菌株被引量:13
- 2010年
- 目的建立结核分枝杆菌北京基因型菌株快速鉴定方法 ,研究该家族在人群中的流行传播的规律和特点。方法采用间隔区寡核苷酸(spoligotyping)分型与多重PCR方法分别对临床分离的112株结核分枝杆菌进行北京基因型菌株鉴定。结果在分析的112株结核分枝杆菌中,107株为北京基因型,多重PCR鉴定结果与Spoligotyping分型符合率为100%。结论与spoligotyping分型相比,多重PCR技术可以快速地区分北京基因型与非北京基因型株,且方法简单,更适于基层试验室中对北京基因型结核分枝杆菌在人群中的流行进行大规模监测。
- 赵德福谢彤巨韩芳穆成赵慧
- 关键词:寡核苷酸类北京基因型聚合酶链反应
- 天津市输入性基孔肯亚病毒全基因组序列分析被引量:1
- 2022年
- 目的分析天津市1例输入性基孔肯亚病毒(CHIKV)的全基因组序列特征与进化,为CHIKV的监测与防控提供科学依据。方法收集2019年11月4日于天津市第二人民医院采集的血清标本200μl提取核酸,设计叠瓦式引物扩增CHIKV基因组全长,然后利用Illumina Miniseq平台进行高通量测序。结果本研究的CHIKV属于ECSA基因型印度洋分支,与大部分中国分离株一致,相似性为92.72%~99.86%,在国际上与巴基斯坦分离株亲缘关系最近(99.74%)。天津CHIKV在关键位点E1-D284E和E2-I211T处有两处突变,与ECSA基因型一致。此外,天津CHIKV还具备两个关键毒力位点E2-12T和E2-82G,以及nsP3-R524Opal终止子突变。结论天津CHIKV具备较强毒力,且具备在白纹伊蚊中传播的能力,提示应继续加强对CHIKV的监测。
- 谭昭麟吕莉琨谢彤李力吕杰李晓燕
- 关键词:基孔肯亚病毒毒力
- 氟喹诺酮耐药与结核分枝杆菌中gyrA和gyrB基因突变的研究进展被引量:9
- 2017年
- 氟喹诺酮类药物虽然是二线抗结核药物之一,但它在治疗耐多药结核病过程中显得尤为重要。近年来,对氟喹诺酮类药物耐药的结核分枝杆菌不断增加。而结核分枝杆菌对氟喹诺酮类药物产生耐药性的分子机制主要是编码DNA解旋酶的gyr A和gyr B基因,其喹诺酮耐药决定区的突变与耐药性密切相关。目前,gyr A和gyr B基因中喹诺酮耐药决定区的突变类型有多种,但gyr B基因中与耐药表型相关联的突变位点较少,且常与gyr A基因中的突变共存。基于结核分枝杆菌gyr A和gyr B基因突变的分子诊断技术能快速检测氟喹诺酮耐药性,但仅限于常见的突变。而新型分子鉴定技术能检测所有有记录的结核分枝杆菌中与氟喹诺酮耐药相关的gyr A和gyr B基因突变。未来,对gyr A和gyr B基因突变的深入研究,将会改进和优化新型检测结核分枝杆菌氟喹诺酮耐药性的分子诊断技术。
- 王志锐谢彤
- 关键词:结核分枝杆菌氟喹诺酮耐药DNA解旋酶基因突变
- 天津市北京基因型结核分枝杆菌流行特征及与耐药表型关系研究被引量:12
- 2011年
- 目的 了解北京基因型结核分枝杆菌在天津市人群中的分布、流行特征及其与耐药表型的关系.方法 收集2008年1月至2009年6月天津市结核病控制中心和10个区(县)结核病防治机构肺结核患者中初次分离培养的结核分枝杆菌656株及患者管理信息、临床信息和实验室信息.菌株对利福平、异烟肼、链霉素和乙胺丁醇的药物敏感性试验采用比例法.应用多重PCR法鉴定北京和非北京基因型菌株,并分析北京基因型菌株与耐药表型的关系.结果 本研究中菌株的总耐药率为26.98%,耐多药率为6.25%.北京基因型菌株600株(91.46%),非北京基因型56株(8.53%),其分布与天津市户籍(x2=4.26,P=0.039)有关,未见与耐药表型间有明显相关性.结论 北京基因型菌株是天津市的主要流行株,感染北京基因型结核分枝杆菌的天津市户籍患者的比例明显高于本地区流动人口患者,但尚未发现北京和非北京基因型菌株之间在耐药方面有明显的差异.
- 巨韩芳王撷秀李桂莲谢彤赵德福李尚伦李敬新赵慧穆成
- 关键词:结核分枝杆菌北京基因型耐药
- 天津市监狱羁押人员中结核病患者临床分离菌株的基因型分析
- 2019年
- 为揭示结核分枝杆菌(MTB)北京基因型菌株中基于差异区域(RD)多态性形成的各个进化分支在天津监狱羁押人员中的流行情况,笔者收集2013年1月至2016年6月从天津市监狱羁押人员结核病患者痰标本中分离培养获得的124株MTB菌株进行基因型分析。结果发现,124株菌株中经鉴定为北京基因型者有116株(93.5%)。116株北京基因型菌株中,96株(82.8%)为北京基因型现代株,20株(17.2%)为北京基因型古代株。基于大片段多态性分析,北京基因型MTB分为4个进化分支。20株北京基因型古代株中有7株(6.0%)为RD181(+)菌株,13株(11.2%)为RD181(-)菌株;96株北京基因型现代株中,95株(81.9%)为RD150(+)菌株,仅1株(0.9%)为RD150(-)菌株。北京基因型MTB的各个进化分支中,RD150(+)北京基因型现代株在监狱中传播流行最为广泛。结果提示需加强RD150(+)北京基因型现代株在天津监狱羁押人员中流行的监测工作。
- 谢彤王春花赵慧巨韩芳穆成王志锐孙蕊
- 关键词:基因测定基因型囚犯