王朝辉
- 作品数：2 被引量：1H指数：1
- 供职机构：河北联合大学更多>>
- 发文基金：河北省科学技术研究与发展计划项目更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 电子克隆技术及其在医学领域的应用被引量：1
- 2012年
- 基于表达序列标签（ESTs）和基因组数据库的电子克隆（insilico cloning）策略，是近年发展起来的一门基因克隆的新技术。其技术核心是利用生物信息学技术组装延伸ESTs序列，获得基因部分乃至全长cDNA序列。它具有投入低、速度快、技术要求低和针对性强等优点。人类疾病发生与基因的关系已经被广泛证实，因此电子克隆技术必将成为疾病研究的重要手段。旨在阐述电子克隆技术在医学领域的应用进展。
- 王朝辉马小兵
- 关键词：表达序列标签电子克隆生物信息学基因克隆
- 大鼠矽肺相关基因组织蛋白酶B的电子克隆与验证
- 2014年
- 目的探讨差异表达基因组织蛋白酶B在大鼠矽肺模型中的作用。方法对以往经抑制消减杂交筛选得到的一条编号为ES110708的差异表达序列标签(EST)作为种子序列,通过电子克隆进行延伸,并在大鼠矽肺模型中用RT-PCR方法进行验证。结果筛选得到的大鼠矽肺差异表达EST经电子克隆延伸得到了含有完整开放读码框架(ORF)的cDNA序列,长度为1977bp,比原来的EST片段(172bp)延伸了1805 bp。其ORF预测为1020 bp,符合Kozak规则。将ORF序列进行同源性检索,其与序列号为NM022597.2的cDNA部分序列完全同源,说明所测ORF属于序列NM022597.2。该序列代表的基因是组织蛋白酶B。经RT-PCR验证,实验组大鼠肺组织Cathepsin B mRNA表达量明显上调。15 d、30 d、60 d时,其吸光度(A)值分别为对照组的4.133、6.639、4.981倍,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论电子克隆能有效延伸EST序列直至全长cDNA序列,差异表达基因组织蛋白酶B可能参与了矽肺的发生与发展。
- 王朝辉马小兵侯文娜徐慧蓉朱兰伊雪
- 关键词：组织蛋白酶B矽肺差异表达基因电子克隆
