熊莉丽
- 作品数：22 被引量：59H指数：5
- 供职机构：西南交通大学更多>>
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- 相关领域：生物学医药卫生农业科学环境科学与工程更多>>
- 常山酮抑制肝癌HepG2细胞活性及机制初步研究
- 2024年
- 探讨常山酮(halofuginone)抑制肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)细胞活性的作用及机制。以肝癌HepG2细胞为主要研究对象,使用CCK-8法、Transwell法、流式细胞术检测不同浓度和时间处理下,常山酮对HepG2细胞活性、细胞迁移、细胞周期和细胞凋亡的影响。通过实时荧光定量PCR(qPCR)和Western blot检测常山酮处理后细胞中柠檬酸合酶(citrate synthase,CS)、酮戊二酸脱氢酶(ketoglutarate dehydrogenase,OGDH)和异柠檬酸脱氧酶(isocitrate deoxygenase,IDH)的表达水平。与空白组相比,常山酮显著抑制HepG2细胞活性(P<0.01),降低HepG2细胞迁移率(P<0.01),诱导肝癌HepG2细胞凋亡(P<0.01),促使HepG2细胞周期停滞在S期(P<0.01)。常山酮处理后肝癌HepG2细胞中三羧酸循环关键酶CS、IDH3和OGDH表达量上调,异柠檬酸脱氢酶同工酶IDH1和IDH2表达量下调。常山酮可抑制肝癌HepG2细胞增殖和迁移,促进细胞凋亡并存在明显的剂量依赖性效应,这可能与促进细胞有氧代谢有关。
- 陈孟旸淮瑞平杨丹妮雷利杰蒲秋霖熊莉丽
- 关键词：三羧酸循环HEPG2细胞异柠檬酸脱氢酶有氧代谢
- 基于EST和GSS序列的玉米未知微RNA的数据挖掘被引量：7
- 2011年
- miRNAs通过与靶基因互补位点配对结合,在转录后水平负性调控靶基因的表达。根据miRNA进化上的保守性,以拟南芥、水稻等已知的植物miRNAs为探针,与相关数据库中玉米表达序列标签(EST)和基因组序列(GSS)中的非编码序列比对,采用一系列的标准进行筛选,最后预测得到24个玉米miRNA前体,通过靶基因的预测共得到61个靶基因。通过生物信息学方法大大提高了人们发现miRNAs及其靶基因的效率,补充了玉米miRNA数据库的不足。
- 李婧熊莉丽胡久梅郭志云
- 关键词：MICRORNA玉米ESTGSS靶基因
- 长链非编码RNA RP11-224O19.2抑制剂的用途
- 本发明提供了长链非编码RNA RP11‑224O19.2抑制剂在制备治疗肿瘤的药物中的用途。本发明还提供了一种治疗肿瘤的药物和一种肝癌筛查和/或肝癌预后诊断的试剂盒。本发明表明，RP11‑22O19.2抑制剂对肿瘤治疗效...
- 郭志云熊莉丽刘文荣
- 文献传递
- MicroRNA与转录因子调控网络综述被引量：5
- 2014年
- MicroRNA是一类长度约为18-24nt的非编码小RNA,它在转录后水平通过调控靶基因来行使多种生物学功能,例如:细胞周期、分化、细胞增殖和凋亡等。在转录水平,转录因子作为一种重要的调控因子参与调控多种基因的表达。近些年研究表明转录因子可以直接调控miRNA的表达,并且参与了包括肿瘤疾病发生等多种生物学进程。转录因子与miRNA形成的调控网络已被广泛地研究,文中就目前已有的研究成果进行综述,以期为今后转录因子与miRNA调控通路的研究提供一定的理论基础。
- 熊莉丽张宝郭志云
- 关键词：MICRORNA转录因子调控网络肿瘤
- MicroRNA参与下的p53调控网络被引量：1
- 2010年
- p53作为肿瘤致病的关键因子人们已经进行了广泛的研究,microRNA参与肿瘤的发生也已经成为了不争的事实,但目前关于p53与miRNA的调控关系还不是很清楚。就p53与miRNA存在的可能调控模式及p53对miRNA功能与合成方面的影响进行了综述,并结合已有的研究绘制了可能的p53与miRNA调控模式图。
- 郭志云茆灿泉熊莉丽
- 关键词：P53MIRNA信号通路
- 靶向膜型1基质金属蛋白酶反义肽的虚拟筛选与分子模拟被引量：3
- 2015年
- 膜型1基质金属蛋白酶(Membrane type-1 matrix metalloproteinase,MT1-MMP,MMP14)在肿瘤的发生发展及转移中起着重要作用,是肿瘤潜在理想的药物靶标。为了获得MT1-MMP结合肽,我们首先采用生物信息学方法分析MMPs序列,获得MT1-MMP差异大且特异的序列。以此为正义肽靶标,设计反义肽库,然后通过分子对接、分子动力学模拟以及体外细胞实验等多种方法,进行靶向MT1-MMP反义肽的筛选与活性研究。多序列比对确定了位于MT1-MMP环区的特异序列AYIREGHE(简称MT1-loop),并构建1 536条反义肽。经两轮虚拟筛选,选取打分位于前五的反义肽用于后续研究。该五条反义肽与MT1-MMP存在较强的相互作用且能很好地对接于正义肽区域。进一步分析其与MMPs其他家族成员(MMP1-3,MMP7-13,MMP14HPX,MMP16)的亲和力,发现反义肽FVTFPYIR对MT1-MMP具有更强的特异性。分子动力学模拟表明,反义肽FVTFPYIR可能是通过影响受体MT1-MMP的构象稳定性,进而影响其功能活性。体外细胞实验初步确定反义肽FVTFPYIR可选择性地抑制表达MT1-MMP的人成骨肉瘤细胞MG63和乳腺癌MDA-MB-231细胞的增殖。本研究为抗肿瘤反义肽先导药物的研发提供了一种新的思路与途径。
- 曾丽谭博文杨亚蓝邱槿怡熊莉丽茆灿泉
- 关键词：分子对接分子动力学模拟
- 人a-synuclein及其突变体的克隆、细菌表面展示与筛选
- 帕金森病（Parkinson’s disease,PD）是最为广泛的神经退行性疾病之一,近年来对此疾病的研究越来越受到人们的重视。a-synuclein是synuclein蛋白家族成员之一,由140个氨基酸编码组成,主要...
- 熊莉丽
- 关键词：突变体噬菌体肽库
- 文献传递
- 阿霉素诱导下的肝癌细胞HepG2中微小RNA差异表达分析
- 2016年
- 旨在研究阿霉素诱导引起的DNA损伤压力下,肝癌细胞Hep G2中参与DNA损伤应答的mi RNA,并分析这些mi RNA靶基因参与肝癌DNA损伤应答相关的生物学进程与通路。通过小RNA测序检测阿霉素处理肝癌细胞Hep G2前后mi RNA的差异表达情况,使用GO与KEGG通路富集方法对差异表达mi RNA靶基因进行功能富集分析。结果显示,共检测出显著表达差异mi RNA 68个,其中上调13个,下调55个。mi RNA靶基因的功能分析结果显示,53条mi RNAs靶基因显著富集于调控细胞增殖、细胞凋亡、细胞迁移和细胞周期等与DNA损伤应答以及肿瘤相关的生物进程和信号通路,包括p53信号通路、癌症通路、Wnt信号通路和MAPK信号通路等。研究表明,在阿霉素诱导下,Hep G2中的差异表达mi RNAs与DNA损伤相关的肿瘤生物学进程以及信号通路显著相关,预示这些mi RNAs在阿霉素引发的肝细胞癌DNA损伤应答中起着重要的作用。
- 杨亚蓝郭志云丁若凡茆灿泉郭建秀熊莉丽
- 关键词：阿霉素DNA损伤RNAS
- 人α-synuclein及其突变体的克隆、细菌表面展示与筛选
- 帕金森病(Parkinson’sdisease，PD)是最为广泛的神经退行性疾病之一，近年来对此疾病的研究越来越受到人们的重视。α-synuclein是synuclein蛋白家族成员之一，由140个氨基酸编码组成，主要在...
- 熊莉丽
- 关键词：帕金森病突变体噬菌体肽库菌株筛选
- 文献传递
- 人α-synuclein突变体的克隆及细菌表面展示
- 2010年
- 目的在细菌表面构建及展示人α-synuclein突变体A30P、E46K和A53T。方法采用叠套PCR介导的点突变方法,以野生型α-sy-nuclein为模板。结果成功克隆了α-synucleinA30P、E46K和A53T3个突变型基因,并利用细菌亲密素展示系统将野生型α-synuclein及突变体A30P、E46K和A53T成功展示在大肠杆菌表面。结论α-synuclein及其突变体的细菌表面展示对于α-synuclein空间结构的良好保持和基于α-synu-clein神经退行性疾病靶分子药物、分子诊断试剂的研发和α-synuclein蛋白结构与功能的研究等具有重要的意义和价值。
- 熊莉丽赵鹏郭志云张建华茆灿泉
- 关键词：Α-SYNUCLEIN突变体生物信息
