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杨作银: 作品数：42 被引量：94H指数：6; 供职机构：北京化工大学更多>>; 发文基金：国家自然科学基金国家教育部博士点基金中央高校基本科研业务费专项资金更多>>; 相关领域：理学文化科学生物学化学工程更多>>

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苯酚羟基化制备苯二酚反应机理的理论研究被引量：6: 2005年; 采用密度泛函理论 (DFT)在 UB3 LYP/ 6-3 1 1 G* * / / UB3 LYP/ 6-3 1 G* 水平上研究了水溶液中羟基自由基进攻苯酚的邻位和对位生成邻苯二酚和对苯二酚的反应机理 .结果表明 ,2个反应都存在 3个过渡态 ,3个中间体 ,并通过振动分析对过渡态进行了确认 .电荷密度的拓扑分析发现 ,邻位反应中羟基自由基的氧原子和苯酚环上的 2个氢原子之间形成了氢键 ,并相应地形成了六元环和五元环结构 .经单点能校正后 ,2个反应的主反应活化能十分接近 ,说明邻位和对位产物会同时存在 ,这与实验观测的结果一致 .; 曹维良庄绪霞杨作银张信芳张敬畅; 关键词：苯二酚密度泛函理论过渡态氢键

分子容器中苯基卡宾重排反应的理论研究: ＜正＞苯基卡宾（PC）经重排转变为环庚四烯（CHTE）是一重要的有机反应,但因环庚四烯的高张力,发现其只能稳定存在于超低温（15K）的惰性气氛中。令人惊讶的是,近来Ralf Warmuth通过柱状的笼形分子（MC）成功地...; 杨作银王秀丽王菊曹维良; 文献传递

铝杂环化合物分子结构的理论化学计算: 利用量子化学的手段研究了两种β-二酮二亚胺基铝杂环合物(Ⅰ与Ⅱ)。计算中采用密度泛函理论(DFT)、ONIOM分层计算和半经验计算方法(AM1)。对Ⅰ和Ⅱ的几何构型进行优化,采用B3LYP/6-31G*、B3LYP/6-...; 阎林胤刘霖杨作银; 关键词：NBO 密度泛函理论; 文献传递

一种具有规则结构的蛋白单体之间相互识别的分子力学模拟和量子化学计算被引量：2: 2003年; 使用分子力学、分子动态学以及量子化学计算方法，对天然的昆虫抗冻蛋白质分子(TmAFP)以长轴平行的方式发生二体相互作用的可能模式进行了系统研究．分子模拟的结果表明，在可能的相互作用模式中，其相互作用区域必须至少包含一个β-面，并且当蛋白单体均取β-面靠近时，其侧链上的羟基在空间的分布满足结构上的二维匹配；利用分子力学与量子化学相结合的方法得到的结果表明两单体的β-面之间具有相对最强的相互作用，同时，高级别的DFT计算以及van der Waals键电荷密度分析进一步证实β-面的相互识别主要表现为β-面的一个苏氨酸侧链的羟基对另一个的苏氨酸羟基氧的识别，即它们之间能形成较强的氢键．因此，分子力学以及量子化学的计算结果都说明蛋白单体在相互识别的过程中，均以β-面相互作用的可能性最大．; 杨作银贾宗超刘若庄陈光巨; 关键词：抗冻蛋白量子化学计算苏氨酸

β-环糊精与质子化及非质子化环氧苯乙烷超分子体系的理论研究被引量：3: 2008年; 采用分子动力学模拟和量子化学计算方法对β-CD-环氧苯乙烷和质子化的β-CD-环氧苯乙烷形成的超分子体系进行了理论研究.结果表明,质子化的环氧苯乙烷的苯基朝向β-CD的小口时体系最稳定,此时主客体的相互吸引作用相对较大;而对于非质子化的环氧苯乙烷,虽然其苯基朝向-βCD的大口较稳定,但由于主客体之间具有较大的排斥能,最终得到的包结物仍可能以苯基朝向-βCD的小口为主.电荷密度拓扑分析发现,当苯基取向β-CD的小口方向时,质子化以及非质子化的环氧苯乙烷都能与位于-βCD大口边沿的羟基形成氢键.因此,环氧苯乙烷在-βCD内相中的定位作用主要得益于诸如氢键以及偶极等较强的分子间相互作用.; 杨作银丁志新张敬畅曹维良; 关键词：Β-CD 环氧苯乙烷超分子体系分子模拟量子化学

CH_3N_3与C_(60)(NCH_3)_2作用生成三氮杂富勒烯衍生物的反应机理被引量：1: 2008年; 利用AM1半经验算法和密度泛函理论,研究了CH3N3进攻C60(NCH3)2生成三氮杂富勒烯衍生物C60(NCH3)3的反应机理及区域选择性.计算结果表明,CH3N3加成在C60(NCH3)2的两个不同位置的5/6单键上的反应均遵循分步机理.反应途径上都存在3个过渡态和3个中间体.从整个反应活化能、表观活化能以及速控步活化能来看,生成稳定产物的反应并不占优势.; 王佳杨作银张敬畅曹维良; 关键词：过渡态反应机理

C_(36)H_2异构体的稳定性及其加成位置选择性的研究被引量：6: 2001年; 使用 AM1和 PM3两种半经验方法 ,对所有的 C36 H2 异构体实行非对称性限制的全优化 ,并结合频率分析及 HF/6-31 G单点能计算 ,确定了各异构体的基态结构及其相对稳定性 .在此基础上 ,通过分析加成位置与异构体稳定性之间的关系 ,得出三条加成位置选择性的规律 .最后 ,利用 π-轨道轴矢量 ( POAV)方法计算了反应前后碳笼中张力的变化 .张力与键级分析的结果表明加成位置选择性的规律不是由碳笼释放的张力决定的 ,而是由 C36 H2; 杨作银王贵昌尚贞锋潘荫明吴本湘赵学庄; 关键词：稳定性选择性异构体富勒烯

C36的结构及其张力的理论研究被引量：2: 2001年; 在SCF-HF/6-31G水平上，对C36分子进行了非对称性限制下的全优化，对优化的结构使用B3LYP/6-31G*计算了13C NMR谱，并分析了它们的电子结构.同时，使用POAV方法，对不同结构异构体的不同碳原子以及不同键型分别进行了张力、再次杂化及π-π轨道夹角分析.; 杨作银尚贞锋王贵昌杨霞潘荫明赵学庄; 关键词：核磁共振谱富勒烯

435663CH4笼型结构中甲烷溢出的理论研究: 2015年; 通过旋转和平移两种操作方式改变435663CH4笼型结构中四元环、五元环、六元环的相对位置,对435663CH4笼型结构的破坏过程以及甲烷溢出的可能性进行了密度泛函(DFT)理论研究,并计算了甲烷溢出笼型结构过程中所需的能垒值。结果表明:与改变五元环、六元环相对位置相比,通过改变四元环相对位置来破坏435663CH4笼型结构是最容易的;当四元环背离笼型结构平移0.30 nm时,甲烷可以顺利溢出笼型结构;当四元环背离笼型结构平移0.25 nm时,再通过旋转来改变四元环相对位置,可以有效降低甲烷溢出笼型结构所需的能垒。; 寇永丽李亚平杨作银; 关键词：甲烷水合物能垒

两种昆虫抗冻蛋白抗冻活性差异的分子基础被引量：4: 2006年; 云杉蚜虫(Choristoneura fumiferana)体内可产生一种抗冻蛋白(AFP),能够保护其在寒冷的冬季安全越冬,这类昆虫抗冻蛋白(简称CfAFP)存在多种异构体,其中CfAFP-501和CfAFP-337均呈现相似的左手β-螺旋结构.实验测定,相比CfAFP-337仅多出两个插入螺旋环的CfAFP-501的抗冻活性竟然是CfAFP-337的3倍左右.蛋白异构体CfAFP-501显著增强的抗冻活性和它的插入环数不成比例,当然也不能简单归因于两个插入环所导致的与冰晶作用部位及接触面积的增加.为了探讨两种昆虫抗冻蛋白异构体抗冻活性差异的分子基础,深入了解抗冻蛋白作用特点的普遍规律,分别使用分子力学、分子动力学模拟和量子力学方法来系统研究蛋白及其切割体与冰晶结合的结构特征及相互作用.结果表明,CfAFP-501中多数螺旋环比CfAFP-337具有更强的冰晶相互作用和破坏冰晶中水分子的成键的能力,由于螺旋长度增加导致CfAFP-501中各β-螺旋环之间协同效应的增强,是其具有显著增强的抗冻活性的主要来源.这种协同作用对具有β-螺旋结构的抗冻蛋白起十分关键的作用和重要贡献.; 周艳霞谭宏伟杨作银贾宗超刘若庄陈光巨; 关键词：昆虫抗冻蛋白抗冻活性量子力学分子力学

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