徐志胜
- 作品数:47 被引量:148H指数:8
- 供职机构:南京农业大学园艺学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金教育部“新世纪优秀人才支持计划”江苏省杰出青年基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学轻工技术与工程医药卫生更多>>
- 类胡萝卜素裂解双加氧酶基因AgCCD4调控芹菜不同组织的着色被引量:6
- 2021年
- 【目的】研究类胡萝卜素裂解双加氧酶基因AgCCD4在不同颜色芹菜中的基因型及相对表达量,结合类胡萝卜素含量测定,分析AgCCD4对芹菜组织中类胡萝卜素积累的影响,为进一步研究CCD亚家族基因在不同颜色芹菜组织着色中的作用奠定基础。【方法】采用同源比对法检索芹菜基因组中的CCD家族基因AgCCD4。从‘津南实芹’‘黄太极’‘紫杆一号’和‘赛雪’4种不同颜色芹菜中分别克隆获得芹菜类胡萝卜素裂解双加氧酶基因AgCCD4。对芹菜AgCCD4的蛋白氨基酸序列组成、蛋白质理化性质、亲缘关系、空间结构等进行分析,预测其保守结构域和二级结构以及建立三级结构模型。采用荧光定量PCR技术检测AgCCD4在不同颜色芹菜不同组织中的表达水平。采用超高效液相色谱(UPLC)对4种颜色芹菜的叶片、叶柄和根中叶黄素和β-胡萝卜素的含量进行测定。采用农杆菌介导的瞬时表达转化法,研究AgCCD4蛋白在烟草表皮细胞中的亚细胞定位。【结果】序列分析结果表明AgCCD4包含1个长度为1779 bp的开放阅读框(ORF),编码592个氨基酸。‘赛雪’中AgCCD4的核苷酸序列与其他品种相比存在18个碱基和9个氨基酸位点的差异,蛋白质相对分子质量分别为65.07 kD和65.12 kD,等电点分别为6.03和5.95。进化树分析表明,芹菜AgCCD4与菊科的向日葵和莴苣CCD4进化关系较近。AgCCD4蛋白的二级结构中包含多个α-螺旋和无规则卷曲,三级结构主要以β-折叠为主。亚细胞定位分析表明AgCCD4是一个定位在叶绿体上的蛋白。对4种颜色芹菜叶片、叶柄和根中叶黄素和β-胡萝卜素的含量进行测定,结果显示芹菜根中均未检测到叶黄素和β-胡萝卜素,叶片中叶黄素和β-胡萝卜素含量均以‘津南实芹’最高,分别为1102.58μg·g^(-1) DW和241.92μg·g^(-1)DW,‘紫杆一号’最低,分别为57.12μg·g^(-1) DW和45.65μg·g^(-1) DW。在叶柄中,仅在�
- 王昊尹莲刘洁霞贾丽丽丁旭沈迪冯凯徐志胜熊爱生
- 关键词:芹菜亚细胞定位基因表达类胡萝卜素
- 一种与胡萝卜类胡萝卜素合成相关的PSY2基因序列及其应用
- PSY2基因是参与类胡萝卜素合成的关键基因。本专利从胡萝卜中克隆了一个新的PSY基因DcPSY2。该基因开放阅读框长为1317bp,编码438个氨基酸。DcPSY2编码的蛋白属于亲水性蛋白。与豆科的红木PSY进化关系最近...
- 熊爱生丁旭徐志胜
- 胡萝卜开花抑制子基因DcFLC的克隆与表达模式
- 2024年
- 开花是植物由营养生长向生殖生长转变的重要标志。开花抑制子基因FLC是植物春化作用的关键调节基因。为了探明FLC基因在胡萝卜花发育过程中的作用,本研究以黑田五寸胡萝卜为试验材料,克隆得到胡萝卜DcFLC基因的编码序列(CDS),并利用实时荧光定量PCR技术(RT-qPCR)分析盛花期黑田五寸胡萝卜各组织及不同发育状态花中DcFLC基因的相对表达量。结果表明,DcFLC基因的开放阅读框(ORF)长度为660 bp,编码219个氨基酸。DcFLC的相对分子量为2.454×10^(4),理论等电点为9.15,是一个亲水性蛋白质。基于FLC编码的蛋白质氨基酸序列,胡萝卜与拟南芥、结球白菜、油菜、萝卜、杧果、白桦、可可、龙眼、葡萄、核桃等物种的遗传距离较远。盛花期胡萝卜肉质根、叶片和叶柄中DcFLC基因的表达量高于茎和花中DcFLC基因的表达量;花中开花抑制子基因DcFLC的相对表达量随着花的发育呈现先上升后下降再上升的变化趋势。本研究结果为胡萝卜FLC基因的利用和耐抽薹胡萝卜品种选育提供依据。
- 刘珊珊段奥其谭杉杉邓元杰王广龙刘慧孙淼徐志胜熊爱生
- 关键词:胡萝卜花发育
- 盐胁迫下胡萝卜肉质根中木质素响应机理研究被引量:13
- 2021年
- 以‘红福七寸’和‘红芯七寸’胡萝卜为材料,测定了不同浓度Na Cl处理下肉质根木质素含量以及根和叶中胁迫相关的生理指标,并利用实时荧光定量PCR方法测定了13个木质素合成相关基因在肉质根中的表达水平。结果显示:在不同浓度盐胁迫下,胡萝卜肉质根中木质素含量均显著高于对照(蒸馏水处理),且在100 mmol·L-1Na Cl处理下含量最高,为对照的1.91倍(‘红福七寸’)和1.83倍(‘红芯七寸’),表明盐胁迫诱导了胡萝卜肉质根木质素的合成。q RT-PCR和相关性分析结果显示13个木质素合成相关基因中的Dc F5H和Dc COMT表达水平与木质素含量的动态变化相似且高度正相关,可能为盐胁迫下胡萝卜肉质根木质素生物合成响应的关键基因。生理指标测定结果显示,在盐胁迫处理下,胡萝卜根和叶中的超氧化物歧化酶(SOD)活性、脯氨酸和可溶性蛋白含量均有不同程度的响应。本研究结果表明盐胁迫诱导胡萝卜肉质根的木质化,木质素合成通路基因参与了对盐胁迫的响应,Dc F5H和Dc COMT可能是盐胁迫下调控木质素合成的关键基因。
- 陈皓炜陈梦娇王雅慧张榕蓉王欣蕊徐志胜谭国飞熊爱生
- 关键词:胡萝卜盐胁迫木质素基因表达生理特性
- 芹菜衔接蛋白基因AgMu2的克隆与表达分析被引量:4
- 2014年
- 为研究芹菜(Apium graveolens)衔接蛋白(Adaptor protein)复合体AP-2中的μ2亚基的功能,以‘六合黄心芹’和‘美国西芹’为试验材料,采用RT-PCR方法获得AgMu2基因。序列分析表明:AP-2复合体AgMu2基因全长1 317个核苷酸,编码438个氨基酸。推测其蛋白质分子量为49.30 kD,pI为9.28。进化分析表明,来自‘美国西芹’的AgMu2亚基在植物间进化具有高度保守性,与葡萄Mu2进化关系最为接近。空间结构分析表明,从芹菜中分离的AgMu2亚基由5个螺旋和26个延伸主链构成,两个平行的β延伸主链构成的平面区域可能含有识别YXXΦ结构的位点。实时定量荧光PCR显示,芹菜中AgMu2基因主要在叶中表达,具有明显的组织特异性,同时该基因可响应低温、高温、干旱和盐胁迫等多种逆境信号,2个品种间该基因响应的时间和强度也具有显著的差异,显示了该基因功能的多样性。
- 王广龙王枫徐志胜蒋倩谭国飞熊爱生
- 关键词:芹菜克隆实时定量PCR
- 胡萝卜光合特性昼夜节律及生物钟基因DcRVEa和DcRVEb响应光周期分析被引量:2
- 2023年
- 为了解胡萝卜生物钟相关基因REVEILLEs (RVEs)在昼夜节律中的分子调控机制,从胡萝卜基因组中检索获得DcRVEa和DcRVEb基因。对两个光周期不同时间点胡萝卜叶片进行光合参数测定,利用实时荧光定量PCR技术对DcRVEa和DcRVEb基因表达量进行检测与分析。结果显示:DcRVEa和DcRVEb分别含有304和307个氨基酸,均为亲水性蛋白;二级结构以α-螺旋和随机卷曲为主。胡萝卜RVE蛋白序列与其他物种同源性序列相似度为66.69%;DcRVEa与莲(Nelumbo nucifera)进化关系较近, DcRVEb与橡胶树(Hevea brasiliensis)进化关系较近。蛋白互作网络分析结果显示,胡萝卜DcRVEa和DcRVEb与LNK1、LNK2、CCA1、TOC1等生物钟核心元件具有较直接的作用。在两个光周期(48 h)中,胡萝卜叶片净光合速率(P_(n))、气孔导度(G_(s))和蒸腾速率(T_(r))在白天处于较高水平,胞间CO_(2)浓度(Ci)则相反。实时荧光定量PCR结果显示,在两个光周期(48 h)中, DcRVEa和DcRVEb的相对表达量均在黑暗条件下达到峰值。DcRVEa和DcRVEb的表达趋势相似,均响应昼夜节律的变化。本文研究结果为进一步研究胡萝卜生物钟基因DcRVEa和DcRVEb的分子机制提供参考。
- 张楠胡志航周建华刘慧王雅慧张雨晴王荟茹徐志胜熊爱生
- 关键词:胡萝卜生物钟光合特性
- 芹菜热激转录因子基因AgHSFB2的克隆及不同温度处理下的表达响应被引量:8
- 2015年
- [目的]热激转录因子HSF(heat shock transcription factor)在植物遭遇高温胁迫时起关键的调节作用,研究芹菜热激转录因子基因及相关蛋白的结构、功能对探究芹菜耐热机制、培育耐热新品种有重要作用。[方法]以‘六合黄心芹’‘津南实芹’和美国西芹‘文图拉’为试验材料,分离并克隆出Ag HSFB2基因,分析相关序列并采用实时定量荧光PCR技术检测该基因在不同温度(4、38和42℃)下的表达响应情况。[结果]研究发现该基因含有1个918 bp的开放阅读框,编码305个氨基酸。推测其蛋白质相对分子质量为34 048,理论等电点p I值为5.09。芹菜Ag HSFB2与拟南芥中HSF蛋白进行比对构建进化树,发现Ag HSFB2与拟南芥HSFB2a和HSFB2b进化距离最近,该基因属于HSFB2亚族。芹菜Ag HSFB2与茄科的番茄、马铃薯相应蛋白的亲缘关系较近。Ag HSFB2蛋白的高级结构主要由3个α螺旋和4个β折叠组成。Ag HSFB2基因主要在芹菜的叶中表达,具有组织、品种特异性,同时对4、38和42℃等多种温度信号有明显响应。该基因对温度胁迫的响应时间和强度有品种的差异:4和38℃处理下‘文图拉’均在2 h有明显上调表达;42℃处理下‘津南实芹’和‘文图拉’均在1 h有明显上调表达。[结论]高温胁迫下Ag HSFB2基因可诱导下游热激蛋白大量表达,帮助植物抵御高温胁迫所带来的伤害。
- 李岩徐志胜谭国飞贾晓玲王枫熊爱生
- 关键词:芹菜克隆温度处理
- 葡萄VvUGT72B1基因和杨树PtUGT72B1基因的合成与功能鉴定
- 一些酚类化合物(PhenolicCompounds,PCs)及3,4-二氯苯胺(Dichloroaniline,DCA)对生物体具有致癌性、致畸性和致突变性。这些物质中许多是农药、防腐剂、消毒剂和偶氮染料等合成和代谢的中...
- 徐志胜
- 关键词:葡萄杨树异源表达植物修复
- 胡萝卜WRKY69基因(DcWRKY69)的克隆及其对不同植物生长调节剂的响应被引量:3
- 2019年
- 以胡萝卜品种‘黑田五寸’(Daucus carota var.sativa‘Heitian Wucun’)为研究对象,采用RT-PCR技术从叶片cDNA中克隆获得DcWRKY69基因片段,并对该基因及其编码的氨基酸序列进行生物信息学分析;同时,采用RT-qPCR技术比较了0.1 mmol·L^-1茉莉酸甲酯(MeJA)、1.0 mmol·L^-1水杨酸(SA)、0.1 mmol·L^-1赤霉素(GA3)和0.1 mmol·L^-1脱落酸(ABA)处理12 h内叶中DcWRKY69基因相对表达量的差异。结果表明:DcWRKY69基因包含1个长度为783 bp的开放阅读框(ORF),编码260个氨基酸;DcWRKY69转录因子氨基酸序列在第52至第110位含有1个WRKY结构域,其锌指结构类型为C2 H2型,理论相对分子质量为30030,理论等电点为pI 4.78;该转录因子含有34个磷酸化位点,无信号肽和跨膜结构,亲水性氨基酸较多,且酸性氨基酸比例最高(27%);该转录因子的二级结构由α-螺旋、β-折叠、延伸链和随机卷曲组成,比例分别为21.92%、4.23%、11.92%和61.92%。序列比对和系统进化树分析结果表明:WRKY转录因子在植物进化过程中具有高度的保守性。RT-qPCR分析结果表明:经MeJA、SA、GA3和ABA处理后,DcWRKY69基因相对表达量的变化趋势不同,分别在处理后8、12、1和4 h达到峰值,且显著高于对照(处理0 h)。研究结果显示:DcWRKY69转录因子属于Ⅱ类WRKY转录因子,为亲水性蛋白,且可能属于非分泌蛋白;DcWRKY69基因可能参与胡萝卜对不同植物生长调节剂的响应过程,但其对不同植物生长调节剂的响应模式存在差异。
- 张榕蓉王雅慧李彤丁旭徐志胜熊爱生
- 关键词:胡萝卜基因克隆植物生长调节剂
- 胡萝卜低温胁迫转录因子DcICE1基因克隆与非生物逆境响应分析被引量:7
- 2015年
- 植物ICE1基因是调控CBF基因表达的上游调控因子,在植物抵抗逆境胁迫中具有重要的作用。该实验以2个胡萝卜品种‘黑田五寸’和‘君川红’为实验材料,分别克隆出DcICE1转录因子基因,并通过荧光定量PCR方法测定了4种不同逆境胁迫下(4℃低温、38℃高温、0.2mol·L-1 NaCl及200g·L-1 PEG)DcICE1基因的表达情况,探讨DcICE1转录因子在植物抵抗非生物胁迫下的功能。序列分析显示,该基因全长1 458bp,编码485个氨基酸。2个胡萝卜品种的DcICE1基因在核苷酸水平上有2个位点的差异,分别为第139位的G/A和第475位的A/G,导致编码的氨基酸在第47位的E/K和第159位的N/D差异,该差异可能与DcICE1转录因子在2个不同品种应对逆境胁迫下的响应不同有关。胡萝卜DcICE1转录因子有一个保守的ICE1功能结构域。实时定量PCR检测DcICE1基因在不同逆境胁迫下的响应表明,低温(4℃)处理能明显地诱导DcICE1基因的表达,但盐(0.2mol·L-1 NaCl)和干旱(200g·L-1 PEG)处理下的诱导效果均不明显。
- 黄莹徐志胜王枫李梦瑶马静熊爱生
- 关键词:胡萝卜基因克隆非生物胁迫