孙振璐
- 作品数:26 被引量:111H指数:7
- 供职机构:烟台市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金:云南省自然科学基金烟台市科学技术发展计划项目国家科技重大专项更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学环境科学与工程建筑科学更多>>
- 2015年烟台地区手足口病监测中柯萨奇病毒A4基因特征分析被引量:4
- 2018年
- 研究2015年山东省烟台地区手足口病的病原谱,以及柯萨奇病毒A组4型(Coxsackievirus A4,CV-A4)的分子流行病学。采用实时荧光逆转录聚合酶链反应方法,对2015年烟台地区采集于手足口病患者的696份样品进行总肠道病毒(EV)、柯萨奇病毒A16(CV-A16)型和肠道病毒A71型(EV-A71)的核酸检测,并对非EV-A71非CV-A16的EV阳性标本,进行CV-A4的核酸检测。对CV-A4阳性标本进行病毒分离,对病毒分离阳性的CV-A4标本进行全长VP1区扩增,并进行核苷酸序列测定和分析,然后进行核苷酸/氨基酸相似性分析和系统发育分析。从696份标本中检出肠道病毒阳性标本412份,其中101份为CV-A16,76份为EV-A71,16份为CV-A4。9份CV-A4阳性标本成功病毒分离,并进行了全长VP1区核苷酸序列分析,结果表明,其核苷酸相似性为91.04%~100%,氨基酸相似性为95.24%~100%。系统进化分析显示9株CV-A4烟台株均属于G1基因群。与参考株CVA4-High Point-AY421762-genome相比,氨基酸序列的第20、34,102、111、143、184、185、200及304位氨基酸出现突变,本研究的9株分离株的这些位点也有不同,表明烟台地区的CV-A4有其独特的突变位点。CV-A4是引起2015年烟台地区手足口病发病的病原体之一,本次分离到的CV-A4均属于G1基因群进化分支。
- 孙振璐徐迎春刘娟高巧董兆静刘虹宫连凤
- 2015年山东省烟台地区柯萨奇病毒A组16型VP1区基因特征分析被引量:1
- 2017年
- 目的研究2015年山东省烟台地区手足口病(hand,foot,and mouth disease,HFMD)的病原谱,并分析病原谱中柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CV-A16)流行株的进化及VP1区重要氨基酸位点的变异情况。方法采用实时荧光逆转录聚合酶链反应方法,对2015年烟台地区采集于HFMD患者的696份样品进行肠道病毒(enterovirus,EV)核酸检测和分子定型。根据EV的优势血清型,选取10株CV-A16扩增VP1区,并进行核苷酸序列及系统发育分析。结果从696份标本中检出EV 412株,其中101株为CV-A16,76株为EV-A71型。10株CV-A16的核苷酸序列相似性为88.4%~99.9%,氨基酸序列相似性为98.6%~100%。10株CV-A16烟台株分别属于B基因型的B1a和B1b进化分支,其中B1b进化分支为优势株。与参考株Tainan/5079/98(AF177911)相比,10株CVA16分离株氨基酸序列的第11、23、99、145、289位氨基酸出现突变,10株分离株的这些位点也有不同,表明烟台地区的CV-A16有其独特的突变位点。结论 CV-A16是引起2015年烟台地区HFMD发病的常见病原体,本次分离到的CV-A16均属于B基因型的Bla和B1b进化分支。
- 孙振璐张桂芳宫连凤刘娟王成芳王志昱高巧
- 关键词:手足口病柯萨奇病毒A组16型系统发育
- 烟台市2010-2015年手足口病核酸检测及病原学分析被引量:8
- 2017年
- 目的对烟台市2010~2015年手足口病(hand-foot-mouth disease,HFMD)病例进行核酸检测及病原学分析。方法在2010~2015年烟台各县市区临床诊断的HFMD病例(包括门诊轻症病例和住院重症病例)中,每月采集5例首次就诊的普通病例及所有重症和死亡病例的咽拭子标本,RT-PCR法进行肠道病毒(enterovirus,EV)核酸检测。结果 2010~2015年烟台市HFMD病例年均报告发病率68.68/10万,重症病例占0.36%,男女性别比例为1.81∶1,发病以低于5岁幼儿为主,占91.22%,每年5~8月为发病高峰。病原谱构成差异有统计学意义(P<0.01),其中EV71型769例,占30.95%,柯萨奇病毒A16型(coxsackievirus A16,Cox A16)814例,占32.76%,其他EV型902例,占36.30%。HFMD病原体以EV71和Cox A16交替为主,其中重症患者的主要致病原为EV71(52.54%)。结论烟台市2010~2015年EV71、Cox A16和其他EV交替为HFMD病例的主要病原体,HFMD的发病存在明显季节、性别、年龄差异,重症病例的主要致病原为EV71,应加强对该型别的监测,防控工作重点为托幼机构及小学低年级儿童。
- 孙振璐宫连凤韩文清刘娟徐小雯刘军王志昱高巧张彩骥
- 关键词:手足口病肠道病毒核酸检测病原学分析
- 山东省烟台地区发热伴血小板减少综合征疑似病例检测分析被引量:10
- 2013年
- 目的调查山东省烟台地区发热伴血小板减少综合征疑似病例新型布尼亚病毒(SFTSV)感染情况。方法采用双重探针引物实时荧光定量-聚合酶链反应方法对发热伴血小板减少综合征疑似病例血清进行新型布尼亚病毒特异性核酸检测。结果 135份疑似病例血清样本中新型布尼亚病毒特异性核酸阳性81份,阳性率60.00%。发病第5~8天核酸检出阳性最高;发病高峰主要集中在5-8月;人群年龄分布在37~87岁之间,以60~70岁年龄组发病数最多,占总病例数的32.10%(26/81);92.59%(75/81)的患者为农民;男女性别比为1.79∶1。结论烟台地区发热伴血小板减少综合征疑似病例存在新型布尼亚病毒感染。
- 宫连凤刘娟韩文清孙振璐王志昱高巧
- 关键词:发热伴血小板减少综合征新型布尼亚病毒核酸检测
- 山东省烟台市人与动物新型布尼亚病毒感染调查及同源性分析被引量:22
- 2014年
- 目的:了解山东省烟台市人和动物发热伴血小板减少综合征布尼亚病毒(SFTSV)感染及流行情况。方法2011年4-11月分别在烟台市的蓬莱和莱州2个SFTS病例高发地区连续采集与人密切接触的5种家养动物(羊、牛、猪、犬、鸡)血清标本3576份,应用双抗原夹心ELISA方法和Real time RT-PCR方法检测血清中SFTSV总抗体和病毒核酸;观察不同月份感染情况;采集两地人群血清2590份,应用间接ELISA方法检测SFTSV IgG抗体;用Vero细胞从核酸阳性的人和动物血清中分离病毒,通过RT-PCR方法对SFTSV S片段进行序列扩增、同源性分析。结果3576份动物血清标本中SFTSV血清总抗体阳性1439份,阳性率为40.24%,病毒核酸阳性163份,阳性率为4.56%。其中羊、牛、鸡、犬、猪抗体阳性率分别为62.78%、52.97%、45.56%、28.73%和1.45%,核酸阳性率分别为5.72%、4.63%、3.02%、5.25%和3.73%。动物体内的抗原抗体随季节消长而变化。2590份人群血清SFTSV IgG抗体阳性率为5.41%。对10株来自人的毒株和3株来自动物的毒株进行S片段基因序列扩增分析,显示其同源性在95.23%~100.00%,与国内其他省市分离毒株比较,其同源性在94.72%~99.13%,高度同源。结论烟台地区存在SFTSV流行,人与家养动物普遍易感,其基因序列高度同源,提示家养动物可能作为SFTSV的增殖宿主和扩散宿主,应引起高度重视。
- 宫连凤姜梅刘娟韩文清刘靖宇孙振璐王志昱高巧邢玉芳丁淑军王显军
- 关键词:发热伴血小板减少综合征布尼亚病毒动物同源性
- 2011年山东省胶东地区四种动物感染新型布尼亚病毒情况的调查被引量:13
- 2013年
- 新型布尼亚病毒是近年我国新发现的由蜱传播的新病毒,其能引起患者发热伴血小板减少,但其动物宿主尚不清楚。为了解胶东丘陵地区家畜动物新型布尼亚病毒感染情况,笔者于2011年4月在胶东地区的蓬莱和莱州两县市区,选择有发热伴血小板减少综合征患者的村庄采集羊、牛、狗、猪4种动物血清标本,检测血清中新型布尼亚病毒总抗体和病毒特异性核酸。
- 宫连凤姜梅韩文清刘娟刘靖宇王治电尹海英孙振璐王志昱高巧
- 关键词:布尼亚病毒动物感染血小板减少综合征病毒特异性动物宿主
- 烟台沿海地区贝类海产品戊型肝炎病毒检测分析被引量:1
- 2022年
- 了解烟台地区贝类海产品中戊型肝炎病毒污染状况,为戊型肝炎防控提供科学依据。采集了烟台近海区域贝类海产品11种,用PEG 8000对戊肝病毒进行优化富集,应用实时荧光定量RT-PCR方法进行检测,用已知戊肝阳性病人粪便标本做系列梯度稀释作为荧光信号强度参照。11种共151份贝类海产品中,在海虹(贻贝)中检出戊肝病毒阳性3份,可疑阳性2份,其它10种贝类中未检出。烟台近海区域贝类海产品(贻贝)中存在戊型肝炎病毒污染。
- 崔伟红刘娟孙振璐高巧董兆静宫连凤马莉
- 关键词:戊型肝炎病毒实时荧光定量RT-PCR
- 利用宏基因组纳米孔测序方法检测模拟临床样本中的基孔肯雅病毒和辛德毕斯病毒被引量:3
- 2020年
- 基于二代测序的宏基因组测序方法(m-NGS)在理论上可以无偏性地检测样品中的所有生物,在感染性疾病的分子诊断领域彰显了突出的作用。但其实验流程复杂,需要操作者具备足够的知识和经验才能获得准确而丰富的诊断信息。因此,需要建立更简单,更快速而且更低成本的宏基因组测序方法,以满足公共卫生实验室的需求。本研究基于MinION建立了宏基因组纳米孔测序(m-NanoS)方法,并成功用于基孔肯雅病毒(CHIKV)和辛德毕斯病毒(SINV)模拟临床样本的检测。将CHIKV和SINV培养物与发热病人咽拭子混合,灭活后提取核酸用于构建m-NanoS文库。MinION共产生了25147条reads,平均质量得分为10.20,平均读长为1334 bp。来自CHIKV和SINV的reads分别有47条和1371条,占总数据量的0.19%和5.45%。CHIKV和SINV的基因组覆盖度分别为99.45%和99.34%,经过拼接获得一致性序列,与参考序列比对的一致性分别为95%和90%。在公共卫生领域,快速地对样本中潜在的全部病原体进行准确鉴定是一个重要又困难的工作,而m-NanoS方法的成功建立无疑为该工作提供了一个有力的诊断工具。
- 王佶张瑞卿孙振璐孙振璐陈操陈操董小平
- 关键词:基孔肯雅病毒辛德毕斯病毒
- 烟台沿海地区人源和猪源戊型肝炎病毒基因型别的研究被引量:5
- 2012年
- 目的调查烟台市沿海地区人源与猪源戊型肝炎病毒(HEV)基因型别的相关性。方法应用逆转录一巢式聚合酶联反应(RT—nPcR)方法对当地急性散发戊型肝炎患者、正常人群中抗HEV-IgM阳性者和当地养猪场的猪进行HEVRNA检测,并对HEVRNA阳性标本进行克隆测序和序列分析。结果16例急性散发戊型肝炎患者中有7例粪便标本HEVRNA阳性;51份IgM阳性正常人群血清标本中有1份HEVRNA阳性;34份猪胆汁标本中有1份HEVRNA阳性。序列分析发现该地区HEV人株与猪株在ORF2部分区域的核苷酸序列同源性为87%~98.1%。7株患者的戊肝病毒基因型和1株猪的戊肝病毒基因型均为Ⅳ型,基因序列同源性在87%~98.1%之间;其中有6例患者和猪的基因序列同源性在93.9%~98.1%之间,为Ⅳ型a亚型;1例患者和猪的基因序列同源性为87%,为Ⅳ型d亚型。正常人群的1例戊肝病毒基因型为Ⅰ型d亚型。该地区人与猪HEV的ORF2的部分基因片段与HEVⅠ~Ⅳ型的代表株进行比较,核苷酸序列同源性分别是82.5%~100%,81.7%~92.9%,81.4%~93.9%,84.9%~100%。结论该地区人群中流行的HEV存在2个基因型3个亚型,主要以基因Ⅳa型为主,与猪群中流行的HEV基因Ⅳa型同源性较高;HEVI型在人群中散在存在。
- 宫连凤刘娟韩文清崔伟红孙振璐姜梅
- 关键词:基因型
- 幽门螺杆菌alpA基因在乳酸菌中的表达及免疫原性分析
- 幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori,Hp)是一种微需氧革兰氏阴性螺旋杆菌,在全球人口中的感染率超过50%。H.pylori感染是慢性胃炎和消化性溃疡的主要病因,与胃癌、胃粘膜相关性淋巴样...
- 孙振璐
- 关键词:幽门螺杆菌乳酸乳球菌
- 文献传递