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周志远: 作品数：31 被引量：92H指数：5; 供职机构：四川省医学科学院(四川省人民医院)更多>>; 发文基金：国家自然科学基金四川省科技厅科技支撑计划项目四川省卫生厅科研基金更多>>; 相关领域：医药卫生自动化与计算机技术生物学经济管理更多>>

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细胞信号网络稳定性的计算机仿真分析被引量：1: 2006年; 许多疾病的发生、发展与细胞内信号转导密切相关,众多的信号转导途径之间因交互作用和交叉调节而形成了庞大复杂的信号网络,研究这一网络的结构属性、内在组织机制以及信号转导整合的特征,对于认识和理解系统复杂性、生物自适应以及疾病的发病机制,设计与开发新型治疗药物都具有重要的意义。该文根据构建的信号网络模型,采用计算机仿真技术对细胞信号网络对外界攻击的承受能力进行了动力学模拟,仿真结果表明该网络对不同类型的节点所受攻击的承受能力不同。; 代荣阳李洪周志远; 关键词：细胞信号转导数学模型计算机仿真

槲皮素、异鼠李素逆转体外HDL氧化修饰的实验研究(英文)被引量：5: 2004年; 目的观察槲皮素(Quercetin,Que)和异鼠李素(Isorhamnetin,Iso)在体外对已受到Cu2+、Fe2+氧化修饰的人血浆高密度脂蛋白(highdensitylipoprotein,HDL)的作用。方法采用一次性密度法分离正常人血浆HDL,用Cu2+,Fe2+进行体外氧化修饰。抗氧化组在修饰后6h加Que或Iso(100μmol/L)作用不同时间(4,8和16h)。分别检测HDL中脂质过氧化物丙二醛(MDA)、维生素E(VitE)含量及超氧化物歧化酶(SOD)活性。结果100μmol/LQue和Iso作用4,8h后可分别明显抵制Fe2+-Ox-HDL,Cu2+-Ox-HDL中MDA生成(P<0.001)。Que和Iso作用8,16h后可分别提高Cu2+-Ox-HDL,Fe2+-Ox-HDL中SOD活性(P<0.001);明显延缓VitE含量降低(P<0.05)。结论Que和Iso均对已受到Cu2+,Fe2+氧化修饰的HDL具有明显的抑制作用,但对Cu2+,Fe2+氧化修饰的HDL,槲皮素、异鼠李素的作用存在差异。Que和Iso的作用机制可能与其抗自由基氧化有关,提示该类物质是一种良好的抗氧化剂,对As的防治有一定的运用价值。; 李家富何涛黄维义周志远罗兴林; 关键词：槲皮素异鼠李素高密度脂蛋白氧化修饰

基于计算流行病学的埃博拉出血热的传播与爆发仿真研究被引量：7: 2014年; 目的本研究旨在模拟外来输入性埃博拉出血热（Ebolavirusdisease，EVD）病例出现后，不同的防控策略对该病在我国传播及爆发流行模式的影响，并为相关决策部门提供一种循证决策依据。方法选用传染病SIR动力学模型建模。模拟病毒输入区域为我国南方某特大型城市群，该城市群人口5000万，所有人均为易感者。出现输入性病例，模拟情况分别包含单个感染者入境I（0）=1，某小型旅行者团体（全为感染者）入境I（0）=5及I（0）=10。I（0）我们称为“零号感染者”，其发病过程呈现典型的埃博拉出血热发病过程。其传播能力用B表示。对于输入性埃博拉感染者进入我国后，从其发病到得到控制（启动紧急预案）的时间t＋设定了如下特征参数：t。=6，12，18，24，30h。传播模式设定如下：S0=5×108，IoЕ[1，20]；k（0．1）；qЕ（0．1]；t。E{6，12，18，24}h。结果零号感染者输入后，随着应急预案启动的时刻t,变化，病毒暴发曲线为指数型，指数方程为Y=1．053e1801，模型拟合度R2=1，RSME=0．1185。如在给定启动应急预案的时间点后（即在同一时间点启动应急预案），零号感染者的数量与被感染者人数上限之间的关系表现为线性增加，线性方程为Y：7．605x，模型拟合度R2=1。以最好模型估计，若零号感染者人数为1，输入后在6h内即被识别并启动应急预案进行处置，则感染人数为7人；若其被隔离时间延长为12，18，24及30h，则对应的感染人数分别为32、400、1400和8600。以最坏模型估计，若零号感染者人数为10，在6，12，18，24及30h后才被识别并启动应急预案进行处置，则在对应的新发感染人数分别为67、380、2400、1．4万和8．7万。结论埃博拉出血热在我国爆发流行的可能性较低，即使出现输入性病例，只要能严格执行国家卫计委的相关规定，该病的传播范围将�; 江华潘海霞孙明伟彭谨杨浩周舜秦陈伟陈伟周志远刘义涛何路; 关键词：埃博拉出血热循证决策突发公共卫生灾难医学 SIR模型

应用磁共振波谱代谢组学和基因本体论建立食管癌患者病理分期预测模型的研究被引量：4: 2016年; 目的结合代谢组和计算生物学技术，探索食管癌代谢表型与病理分型的关系，发现食管癌患者代谢网络扰动机制，建立可用于术前快速对肿瘤进行精准分期的方法。方法前瞻性队列研究设计，研究起止时间为2013年4月至2016年1月。纳入2013年5月至2014年4月在四川省人民医院确诊食管癌拟行手术患者，收集血清标本进行磁共振波谱代谢组学检测，绘制不同分期患者的血浆代谢指纹图谱。采用主成分分析、偏最小二乘法和支持向量机进行数据处理，并基于基因本体论（GO）方法建立代谢型-酶学网络-GO通路回溯分析技术探索调控食管癌代谢网络异常的酶-基因网络调节机制，最终建立食管癌分期定量预测模型。所有数据处理过程均在高性能计算平台上使用MatLab完成。计量资料的组间比较采用Wilcoxon秩和检验（非正态分布）或方差分析（正态分布）。计数资料采用）（2检验或Fisher确切概率法。结果纳入不同TNM分期食管癌患者20例，不同分期患者组间年龄无差异（F=1．086，P〉0．05），体重指数无差异（F=1．035，P〉0．05），肿瘤距门齿距离无差异（F=1．078，P〉0．05），其血浆磁共振波谱指纹图谱可特征性区分不同肿瘤分期。在不同TNM分期的患者中，其血浆代谢池中存在明显的代谢物差异：与ⅡB、ⅢA、Ⅳ期患者相比，ⅠB、ⅡA期患者血清中丁酮、乙醇胺、同型半胱氨酸、羟基丙酸、雌三醇浓度升高，而糖蛋白、肌酸、胆碱、异丁酸、丙氨酸、亮氨酸、缬氨酸水平降低。经过计算，最终筛选出4个代谢标志物：乙醇胺、羟基丙酸、同型半胱氨酸、雌三醇。GO分析表明，调控这4个关键代谢标志物的是54对酶和基因。以此为基础建立了基于磁共振波谱的食管癌TNM分期定量预测模型，交叉验证结果表明，该预测模型的均方根误为5．3，R^2=0．47（P=0．036�; 陈星王凯陈伟江华邓鹏翅李子建彭谨周志远杨浩黄贵祥曾俊; 关键词：代谢组学计算生物学基因本体

节点干预对无尺度细胞信号转导网络的影响: 2007年; 在数学建模的基础上研究了无尺度细胞信号转导网络的拓扑结构属性及节点干预对信号网络的影响。结果表明不同类型节点干扰所导致的网络紊乱的范围和程度具有明显的差异。此研究不仅对于认识和理解细胞信号系统复杂性、结构与功能的关系具有重要意义,而且也为复杂系统的研究提供了一种新思路。; 代荣阳李洪周志远; 关键词：细胞信号转导网络拓扑结构计算机模拟动力学

重大地震伤害患者的死亡特征模式及预后预测:2000例汶川地震伤员数据集的计算机模式识别研究: 本文旨在研究拟基于模式识别技术，通过对2008年汶川特大地震2316例住院伤员数据集进行挖掘建模，发现影响患者病死的伤情相关因素组合模式，进而提出一种大地震后伤员病死的预后预测模型。; 曾俊蔡斌彭谨周志远杨浩孙明伟陈伟Charles DamienLu江华; 关键词：创伤临床诊治预后因素; 文献传递

三因素思维模式在生物化学的物质代谢教学中的应用被引量：1: 2009年; 生物化学是医学生的必修课程，与医学有着紧密的联系，其分支分子生物学，自建立以来已迅速渗透到生命科学的各个领域，成为各个分支相互交流的共有平台翻。但由于这门课程讲述的是微观世界中所发生的种种复杂事件．相对医学院校的形态学课程而言，不仅更加抽象而且相关概念也容易混淆。因此，伴随着较高补考率的生物化学课程，长期以来让医学生倍感畏惧。冯志强教授依据丰富的生理学教学经验，经多年的探索发展出三因素思维模式131，用以指导医学生学习生理学。取得了良好的教学效果。考虑到，生物化学和生理学之间存在的千丝万缕的联系．因此我们也尝试将三元互交理论引入到生物化学的教学活动中。结果显示。利用三因素思维模式．不仅降低了同学们记忆的难度，而且也给同学们思考问题和整合相关概念提供了一个思维的平台，对帮助同学们摆脱传统的死记硬背的模式起到了一定的作用。; 周志远姚富丽; 关键词：生物化学课程教学经验思维物质代谢三因必修课程

基于偏最小二乘法(PLS)构建大型突发公共卫生事件创伤预后预测被引量：5: 2011年; 目的采用汶川大地震后一组伤员救治医疗数据,以偏最小二乘(partial least square,PLS)算法为核心,探讨影响因素并构建一种新的大规模突发公共卫生事件创伤救治预后预测模型。方法以四川省医学科学院.四川省人民医院2008年5月收治的地震伤员数据库作为建模资料来源作为训练集,建模过程包括成分提取和建立回归方程,模型优度判别采用交叉检验。运算平台采用EXCEL和Matlab软件。结果通过相关性分析得到9个因素的相关性,VIP值得到5个影响结局的重要因素,并建立了大规模突发公共卫生事件创伤救治预后预测模型。结论本研究构建的以PLS算法为基础的模型,能可靠的帮助筛选大规模公共卫生事件中创伤患者预后预测的关键性影响因素以及综合评价指标。; 杨浩江华孙明伟陈伟陈伟蔡斌彭谨周志远曾俊; 关键词：偏最小二乘法创伤预后预测

DNA甲基化、代谢调控与肿瘤及慢性疾病被引量：1: 2017年; 甲基化是烷基化反应的重要类型之一,是指在底物上增加甲基或者利用甲基取代一个氢原子或基团的过程。生物系统中的甲基化是经酶催化的一种反应,参与了包括基因表达调控、蛋白质功能调节、RNA加工过程和重金属修饰等重要环节。因此对甲基化过程的认识和研究,广泛的应用于生命科学和疾病研究的诸领域,其中包括:癌症、产前诊断、感染性疾病及临床免疫、先天性疾病及获得性疾病的发生发展。; 刘展周志远彭谨陈伟陈伟; 关键词：甲基化癌症慢性疾病

DHA和EPA的抗炎及免疫调节功能被引量：20: 2004年; 代荣阳陈润周志远; 关键词：DHA EPA 抗炎免疫调节功能

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