伍苑宾
- 作品数：49 被引量：22H指数：3
- 供职机构：广东省妇幼保健院更多>>
- 发文基金：广东省自然科学基金国家自然科学基金广东省医学科学技术研究基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 广州地区人巨细胞病毒临床低传代株UL141基因的序列特征
- 目的 UL141 基因的结构特征及多态性对发现人巨细胞病毒(HCMV)感染致病性机制具有指导意义。文中旨在研究广州地区HCMV 临床低传代株UL141 基因的序列特征。方法 选取2016 年3 月至2017 年3 月在广...
- 谭琪琪王波胡兢晶苏海浩伍苑宾郭梦杰
- 关键词：人巨细胞病毒生物信息学基因序列多态性
- 人巨细胞病毒临床病毒株UL148基因B细胞表位的预测及其免疫原性分析
- 目的：预测与分析人巨细胞病毒临床病毒株UL148基因B细胞表位并制备人巨细胞病毒(HCMV)临床病毒株UL148基因的抗体对其进行免疫原性分析. 方法：应用生物信息学方法,以HCMV UL148基因氨基酸序列为基础,采用...
- 伍苑宾胡兢晶王波六苏海浩郭媛媛谢斌华密英鸽
- 关键词：人巨细胞病毒B细胞表位
- 先天性感染人巨细胞病毒临床病毒株UL148基因生物信息学分析
- 伍苑宾胡兢晶苏海浩丁俊彩郭媛媛谢斌华密英鸽王波
- 广州地区人巨细胞病毒临床低传代病毒株UL142基因的序列特征分析
- 2016年
- 目的 探讨广州地区人巨细胞病毒（HCMV）临床低传代病毒株UL142基因的序列特征。方法 选取2014年3月至2015年12月在广州医科大学附属广东省妇儿医院儿科就诊的10例HCMV症状性感染患儿的尿液标本为研究对象。将从HCMV症状性感染患儿尿液标本中分离出的病毒株进行多重PCR鉴定,对UL142基因全序列克隆到pMD18-T载体上扩增并将产物进行测序,将测序结果提交GenBank并与GenBank收录的其他10株HCMV病毒株的UL142基因进行比对分析。结果 从广州地区HCMV症状性感染患儿尿液中成功分离2株HCMV临床病毒株,分别命名为HCMV D2和D3;克隆测序后由GenBank收录,收录号分别为DQ180384和DQ180370。各HCMV病毒株的UL142基因同源性比对分析发现：UL142基因序列较保守,有69处碱基发生变异,且均为点突变,无插入及缺失突变;编码蛋白的氨基酸残基为306个,序列也较保守,其中28处点突变导致编码氨基酸的改变,其余点突变均未导致编码氨基酸改变。不同HCMV病毒株中UL142基因所编码的氨基酸变异率为0.9%-6.5%。各HCMV病毒株UL142基因编码蛋白的二级结构的氨基酸数目不同,但所有HCMV病毒株UL142基因编码蛋白的等电点均在6.48-8.27。结论 广州地区HCMV临床低传代病毒株ULl42基因序列及其编码产物的氨基酸序列均较为保守,但仍存在一定的多态性,这提示UL142基因在HCMV感染与致病机制的研究中可能具有重要作用。
- 郭梦杰胡兢晶王波苏海浩伍苑宾蔡丽君谭琪琪
- 关键词：巨细胞病毒
- 人巨细胞病毒临床低传代病毒株D2的UL140基因B细胞表位生物信息学特征
- 目的 探讨广东省妇幼保健院分离鉴定的人巨细胞病毒(HCM V)临床低传代病毒株D2(以下简称为HCMV D2)的UL140 基因B 细胞表位的生物信息学特征。方法 采用2016 年3 月至2017 年3 月，于广东省妇幼...
- 苏海浩王波郭梦杰谭琪琪胡兢晶伍苑宾晏翠芳
- 关键词：巨细胞病毒B细胞表位
- 广州地区人巨细胞病毒临床低传代病毒株D3的UL147基因B细胞抗原表位的生物信息学分析
- 2017年
- 目的应用生物信息学方法分析广州地区人巨细胞病毒(human cytomegalovirus,HCMV)临床低传代病毒株D3的UL147基因B细胞抗原表位。方法应用生物信息学方法:用TMHMM预测跨膜区域,用改进型自我优化预测结构(SOPMA)、Garnier-Osguthorpe-Robson(GOR)法、人工神经网络预测法(HNN)预测二级结构,用Hopp&Woods亲水性方案、Janin可及性方案、Welling抗原性方案等参数预测UL147基因抗原表位。结果临床低传代HCMV病毒株D3的UL147基因包含159个氨基酸残基,等电点为9.56;UL147存在一个跨膜区域,为20~42aa区域,胞外区域为1~19aa区域;无规则卷及β-转角区域主要位于12~17、22~28、31~48、99~109、130~145aa区域;亲水性位于15~39、101~111、135~143aa区域;可及性位于14~45、103~124、131~143aa区域;抗原性位于9~14、63~70、108~116aa区域。结论临床低传代HCMV病毒株UL147基因抗原表位可能位于7~12aa区域或其附近。
- 晏翠芳郭梦杰伍苑宾胡兢晶苏海浩谭琪琪梁惠慈肖华王波
- 关键词：人巨细胞病毒抗原表位
- 广州地区人巨细胞病毒临床低传代病毒株UL136基因B细胞表位的多参数预测分析
- 目的 多参数预测广州地区人巨细胞病毒(HCMV)临床低传代病毒株UL136 基因B 细胞表位。方法 应用改进型自我优化预测结构(SOPMA),Garnier-Osguthorpe-Robson(GOR),人工神经网络预测...
- 晏翠芳胡兢晶伍苑宾郭梦杰潘丽雯苏海浩戴津谭琪琪王波
- 关键词：人巨细胞病毒生物信息学B细胞表位
- 靶向人巨细胞病毒UL145基因的CRISPR/Cas9基因敲除质粒的构建
- 2021年
- 目的构建靶向人巨细胞病毒UL145基因的CRISPR/Cas9基因敲除质粒。方法根据CRISPR/Cas9设计原则,设计3条靶向UL145基因的gRNA,构建重组lenti CRISPR-UL145-T1、T2、T3表达质粒,转化并挑选阳性克隆,进行PCR及测序验证。同时通过荧光素酶SSA(Luciferase SSA)检测CRISPR/Cas9活性,筛选出载体活性最佳质粒。结果设计了3条靶向gRNA并构建lenti CRISPR-UL145-T1、T2、T3表达质粒,经PCR及测序鉴定载体构建成功;通过Luciferase SSA检测,结果显示,lenti CRISPR-UL145-T3载体活性最强,明显高于lenti CRISPR-UL145-T1、T2载体活性。结论重组质粒lenti CRISPR-UL145-T3筛选为活性最佳质粒,为进一步进行体内外敲除人巨细胞病毒UL145基因及其功能奠定基础。
- 伍苑宾胡兢晶王波苏海浩谭琪琪
- 关键词：人巨细胞病毒基因敲除
- 应用外部引导序列切割人巨细胞病毒UL148 RNA的研究
- 目的 研究人巨细胞病毒(Human cytomegalovirus,HCMV)临床病毒株UL/b'区域UL148基因功能及抗HCMV 治疗新策略,应用DNA 性质外部引导序列(External guide sequenc...
- 胡兢晶王波苏海浩丁俊彩郭媛媛谢斌华伍苑宾蔡丽君郭梦杰
- 关键词：人巨细胞病毒
- 多参数预测人巨细胞病毒UL144基因B细胞表位
- 目的 预测广州地区人巨细胞病毒(HCMV)临床低传代UL144 基因B 细胞表位。方法 应用生物信息学方法,改进型自我优化预测结构(SOPMA),Garnier-Osguthorpe-Robson(GOR),人工神经网络...
- 晏翠芳胡兢晶伍苑宾郭梦杰潘丽雯苏海浩戴津谭琪琪王波
- 关键词：人巨细胞病毒生物信息学
