乔婷婷
- 作品数:11 被引量:81H指数:5
- 供职机构:中国农业科学院茶叶研究所更多>>
- 发文基金:公益性行业(农业)科研专项国家高技术研究发展计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 中国茶树种质资源生物碱多样性的初步研究
- 生物碱是茶叶中主要的功能成分和风味物质之一。通过选择基本能代表我国主要遗传多样性的401份茶树资源,并测定了春季一芽二叶新梢的生物碱成分,发现咖啡碱、可可碱和生物碱总量分别在1.71%~4.78%、0.05%~0.80%...
- 金基强乔婷婷周炎花马春雷姚明哲王新超陈亮
- 关键词:茶树生物碱多样性
- 文献传递
- 广西茶树地方品种遗传多样性和遗传结构的EST-SSR分析被引量:21
- 2011年
- 利用设计合成的60对扩增稳定的EST-SSR核心引物分析51份广西茶树地方品种的遗传多样性和遗传结构,共检测到232个等位基因,每对引物检测到2~7个,平均3.88个。群体的观测杂合度(Ho)变化范围为0.02(TM149)~0.92(TM186),平均为0.37;期望杂合度(He)的变化范围为0.13(TM144,TM147)~0.73(TM189),平均为0.47;位点的多态信息含量(PIC)介于0.12~0.68之间,平均为0.41。地区间遗传相似系数在0.83~0.94之间,说明不同地区地方品种间的亲缘关系较近。对于茶与白毛茶群体而言,平均遗传分化系数为0.02(P<0.001),即有2%的遗传变异存在于群体间,而有98%的遗传变异存在于群体内。另外,种群内的近交系数Fis平均为0.21,说明群体内近交现象较严重。基于Nei’s遗传距离,利用PowerMarker3.25软件进行Neighbor-Joining聚类分析,将51份地方品种聚为3类:桂林、来宾和贺州的大部分品种,钦州和梧州的全部品种聚在第Ⅰ类;第Ⅱ类包含多数地区的品种;第Ⅲ类主要由崇左、防城港和南宁的品种组成。该结果与基于模型的遗传结构分析结果基本一致。
- 周炎花乔小燕马春雷乔婷婷金基强姚明哲陈亮
- 关键词:茶树EST-SSR
- 浙江省茶树地方品种与选育品种遗传多样性和群体结构的EST-SSR分析被引量:37
- 2010年
- 以茶树品种龙井43幼根为材料,构建cDNA文库并测序,获得4833条EST序列,拼接后得到3482条无冗余EST,总长2290kb。对其进行SSR搜索,共检测到577个SSR位点,分布于500条茶树幼根EST中,其中含有EST-SSR的序列占14.36%,平均每3.97kb出现一个SSR。利用Primer premier5.0,对含有SSR的EST设计引物416对,通过退火温度和多态性筛选,确定可用的引物及其最佳退火温度,并从筛到的引物中选取63对及1对已发表引物作为核心引物,对浙江省茶树地方品种和选育品种进行遗传多样性和遗传结构分析。结果显示,64对引物均在供试材料中表现出多态性,共检测到232个等位位点,平均每对引物3.6个;每对引物可鉴定的基因型为2~13个,平均4.3个。供试材料多态性信息量(PIC)介于0.02~0.84,平均0.44;扩增位点的观测杂合度平均为0.44,期望杂合度平均为0.48。地方品种的遗传多样性水平略高于选育品种(系)。不同地方资源群体多态性信息量为0.24~0.36,举岩群体的多样性最高,惠明群体的多样性最低。浙江各地区以杭州资源的多态性最高,PIC达0.41;丽水的多态性最低,PIC为0.24。Structure2.2群体结构分析和UPGMA聚类分析表明,地方品种、选育品种(系)具有相对独立的群体结构,选育品种(系)根据亲缘关系的不同形成不同的类群。
- 乔婷婷马春雷周炎花姚明哲刘饶陈亮
- 关键词:茶树EST-SSR
- 浙江省茶树地方品种与选育品种遗传多样性和遗传结构的EST-SSR分析
- 采用茶树幼根EST-SSR 引物对浙江省茶树地方品种和选育品种进行遗传多样性和遗传结构分析。结果显示36 对引物均表现出多态性,多态性位点百分率为100%;共检测到128 个等位位点,平均每对引物3.6 个;每对引物可鉴...
- 乔婷婷马春雷周炎花姚明哲陈亮
- 关键词:茶树选育品种聚类分析亲缘关系
- 文献传递
- 浙江省茶树地方品种与选育品种遗传多样性和遗传结构的EST-SSR分析
- 采用茶树幼根EST-SSR引物对浙江省茶树地方品种和选育品种进行遗传多样性和遗传结构分析。结果显示36对引物均表现出多态性,多态性位点百分率为100%;共检测到128个等位位点,平均每对引物3.6个;每对引物可鉴定的基因...
- 乔婷婷马春雷周炎花姚明哲陈亮
- 关键词:茶树品种选育
- 利用EST-SSR基因分型研究分子标记与茶树表型性状的关联性
- 通过EST-SSR 标记对112 份茶树资源材料进行基因分型,开展了分子标记与新梢一芽二叶长(BL)、一芽二叶百芽重(BW)、叶长长度(LL)、叶片宽度(LW)、咖啡碱含量(CAF)、氨基酸含量(AA)和茶多酚含量(TP...
- 姚明哲乔婷婷马春雷金基强陈亮杨亚军
- 关键词:茶树表型性状分子标记基因分型
- 文献传递
- 利用EST-SSR基因分型研究分子标记与茶树表型性状的关联性
- 通过EST-SSR标记对112份茶树资源材料进行基因分型,开展了分子标记与新梢一芽二叶长(BL)、一芽二叶百芽重(BW)、叶长长度(LL)、叶片宽度(LW)、咖啡碱含量(CAF)、氨基酸含量(AA)和茶多酚含量(TP)共...
- 姚明哲乔婷婷马春雷金基强陈亮杨亚军
- 关键词:茶树基因分型表型性状分子标记
- 植物关联分析的研究进展及其在茶树分子标记辅助育种上的应用前景被引量:9
- 2009年
- 茶树是中国重要的经济和饮料作物,由于自交不亲和和长期的异花授粉使其高度异质杂合,选育一个良种耗时长,提高早期选育效率和准确鉴定目标性状成为茶树育种家关心的重大问题之一。关联分析是研究分子标记或候选基因与目标性状关系的一种新方法,现已广泛应用于植物等位基因发掘、功能基因验证以及功能性标记的开发和应用等各方面的研究中,为茶树遗传育种研究提供了新思路。此文主要介绍了关联分析的基本原理、策略和及其在植物中的应用现状,并且探讨了其在茶树分子标记辅助育种研究上的应用前景。
- 乔婷婷姚明哲周炎花马春雷王新超陈亮杨亚军
- 关键词:茶树数量性状
- 基于EST-SSR的广东与广西茶树资源遗传结构和遗传分化比较分析被引量:16
- 2011年
- 【目的】通过揭示茶树资源遗传多样性、遗传结构和遗传分化关系,为资源的有效保护和充分利用提供理论依据。【方法】利用109对核心EST-SSR标记对广东、广西的105份茶树核心资源进行遗传多样性和遗传分化比较分析;同时对广东和广西资源组群间、组群内白毛茶和茶种群间、种群内进行AMOVA分子方差分析,进一步剖析遗传结构,并绘制群体遗传结构图。【结果】109对核心EST-SSR标记共检测到435个等位基因,平均等位基因(NA)3.99个,平均有效等位基因(NE)为2.12,平均Nei's基因多样性(H)为0.59,平均观测杂合度(Ho)为0.32,平均期望杂合度(He)为0.46,平均多态性信息含量(PIC)为0.56。广东茶树资源遗传多样性的上述6个参数均小于广西茶树资源。广东白毛茶NA和H低于广东茶,NE、He、Ho和PIC与茶较为接近;广西白毛茶NA大于广西茶,但是NE、He和H低于茶。F-统计量分析表明白毛茶与茶种群内近交系数(Fis)、种群间近交系数(Fit)和种群遗传分化(Fst)都较低,基因流(Nm)都较高。广东白毛茶与广西白毛茶Fst为0.04,基因交流相对较低为6.26。AMOVA分析显示组群间遗传变异为3.09%,组群内种群间遗传变异为2.22%,种群内遗传变异为94.69%。群体遗传结构显示105份茶树资源可分为3个类群,类群Ⅰ由6份选育品种组成;类群Ⅱ由43份广东资源和16份广西资源组成;类群Ⅲ包括广西36份和广东4份资源。【结论】广东茶树资源遗传多样性程度低于广西。广东白毛茶遗传多样性比广东茶丰富,种群遗传分化低,存在较频繁的基因交流。广东白毛茶遗传多样性低于广西白毛茶,遗传分化相对较高,基因流较低。AMOVA分析显示遗传变异主要分布于广东、广西茶树资源群体内。
- 乔小燕乔婷婷周炎花金基强马春雷姚明哲陈亮
- 关键词:茶树白毛茶遗传分化
- 浙江省茶树地方品种与选育品种遗传多样性和遗传结构的EST-SSR分析
- 采用茶树幼根EST-SSR引物对浙江省茶树地方品种和选育品种进行遗传多样性和遗传结构分析。结果显示36对引物均表现出多态性,多态性位点百分率为100%;共检测到128个等位位点,平均每对引物3.6个;每对引物可鉴定的基因...
- 乔婷婷马春雷周炎花姚明哲陈亮
- 关键词:茶树EST-SSR
- 文献传递