马静
- 作品数:3 被引量:3H指数:1
- 供职机构:重庆邮电大学生物信息学院生物信息学研究所更多>>
- 发文基金:重庆市自然科学基金重庆市教育委员会科学技术研究项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:理学更多>>
- π堆积的腺嘌呤-胸腺嘧啶体系激发态电荷转移和无辐射失活的半经典动力学模拟被引量:2
- 2012年
- 采用半经典电子-辐射-离子动力学(SERID)模型模拟了π堆积的腺嘌呤-胸腺嘧啶(A-T)体系激发态的光物理失活过程.设置激光脉冲仅作用于T,模拟发现电子由A转移到T,形成(A+T-)*激基缔合物(exciplex).当分子间距缩短至0.300nm时,由于轨道离域效应产生电荷重组,体系恢复电中性;当A分子的C4-C5扭曲程度最大时,体系通过避免交叉点衰减至基态.Exciplex的失活途径由分子间距离和A分子的变形程序两个因素决定.由于A分子的C4、C5原子位阻较大,难以达到失活所必需的强烈扭曲,因此(A-T)*的寿命比胸腺嘧啶堆积体系(T-T)*显著增长.
- 张文英马静袁帅舒坤贤豆育升
- 关键词:激基缔合物电荷转移
- 胸腺嘧啶紫外损伤与自修复机理的计算机模拟被引量:1
- 2011年
- 为了研究DNA分子紫外光辐射下光损伤和自修复,采用半经典动力学方法模拟了胸腺嘧啶分子激发与失活过程。模拟脉冲频率为5.0 eV,fwhm=50 fs。模拟发现胸腺嘧啶在紫外辐射下会生成电子激发态,导致分子结构畸变,可能引发突变。由于激发态寿命极短,激发态的胸腺嘧啶分子通过H6原子和C6原子的畸变发生无辐射失活而衰减至基态,恢复其初始的平面结构,从而最大程度地避免了紫外损伤。本研究可为皮肤癌等疾病的预防提供一定的理论支持。
- 舒坤贤马静袁帅豆育升
- 关键词:胸腺嘧啶光损伤自修复计算机模拟
- 5-甲基胞嘧啶及胞嘧啶无辐射失活的半经典动力学模拟和CASSCF计算被引量:1
- 2012年
- 采用半经典动力学方法模拟了5-甲基胞嘧啶(5m-Cyt)和胞嘧啶(Cyt)在267nm紫外光辐射下的光物理失活过程.模拟发现,5m-Cyt和Cyt的激发态通过C5-C6键的扭曲以及甲基(或H5)和H6原子平面外振动失活.失活时,甲基(或H5)和H6原子几乎与环面垂直并指向不同方向,形成"双自由基态".由于甲基的体积比H原子的大,振动频率较小,使得C5原子的变形受到抑制,导致5m-Cyt的激发态寿命比胞嘧啶更长.完全活性空间自洽场(CASSCF)计算显示,5m-Cyt的圆锥交叉(CI)点能量比Cyt高0.3eV,这也证明5m-Cyt演化至CI需要克服更大的能垒,因此激发态寿命长于胞嘧啶.
- 袁帅马静张文英舒坤贤豆育升
- 关键词:胞嘧啶CASSCF激发态寿命