鞠妍
- 作品数:26 被引量:29H指数:4
- 供职机构:中国农业科学院特产研究所更多>>
- 发文基金:吉林省科技发展计划基金吉林省科技厅科技发展计划项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学化学工程更多>>
- 基于高通量测序技术的敖鲁古雅驯鹿鹿茸转录组分析被引量:2
- 2020年
- 试验旨在通过高通量测序技术获得驯鹿的遗传信息和鹿茸组织的转录组特征,并进一步挖掘其中与鹿茸经济性状相关的关键基因信息。对驯鹿鹿茸组织提取RNA,检测RNA纯度、完整性及是否有污染,合格后构建文库,文库构建成功需要进行库检,库检合格后使用Illuminanovaseq平台进行转录组测序分析。利用Diamond、HMMER、KAAS、Blast2GO等软件对驯鹿鹿茸转录组序列进行了功能注释、基因丰度分析和其他分析。结果显示,测序获得47818202条raw reads,经过滤和质量检查得到了46964478条clean reads,组装后得到49171个Unigenes,表明本次测序获得了高质量的鹿茸转录组。基于序列一致性分析,Unigenes与NR、Swiss-Prot、KOG、KEGG、Pfam、GO数据库比对注释成功总共占89.54%,共44029条序列。Corset聚类后得到49171个Unigenes,在这些Unigenes中共找到13795个SNPs位点和18446个SSRs位点。GO注释结果显示22955个Unigenes得到注释,占总注释结果的46.68%。与KEGG数据库进行比对分析,发现49171个Unigenes可能参与或涉及代谢途径,其中20258个Unigenes共注释到32个KEGG代谢通路。此外,在转录组结果中发现了一些高丰度的基因,如OPN、TMSB4、TMSB10等,它们的功能可能与驯鹿生茸有关。本试验结果不仅对驯鹿的基因组数据进行了补充,而且还初步揭示了生长期驯鹿鹿茸的基因特征,为驯鹿分子遗传学研究、资源保护与利用及种群资源恢复提供了参考。
- 鞠妍刘华淼何金明王磊赵佩张然然董依萌董世武唐丽昕邢秀梅
- 关键词:驯鹿鹿茸高通量测序转录组
- 基于蛋白质组学技术的鹿茸不同部位差异蛋白筛选被引量:8
- 2017年
- 旨在了解梅花鹿鹿茸不同部位蛋白表达差异,本研究以腊片部位、血片部位和骨片部位的梅花鹿鹿茸组织为试验材料,运用双向电泳(2-DE)和MALDI-TOF-TOF串联质谱技术对不同部位梅花鹿鹿茸差异表达蛋白质进行鉴定,并对差异蛋白进行生物信息学分析。结果表明,成功筛选出37个差异表达蛋白,主要涉及多细胞生物体发生、解毒、细胞成分组织或生物发生、细胞聚集、定位、对刺激的反应、生物黏附、发育、单一生物体发生、免疫系统等生物学过程。其中鹿茸腊片、血片、骨片组织中分别有18、5与14个蛋白质表达上调。对差异表达蛋白作进一步分析发现,转录延伸因子(EFB1)、视黄酸结合蛋白(CRABP1)在鹿茸的快速生长中起重要调控作用,而载脂蛋白A1(APOA1)、脂肪酸结合蛋白4(FABP4)、转甲状腺素蛋白(TTR)在鹿茸的快速骨化中起重要的调控作用,对鹿茸快速生长与骨化机制的进一步研究具有重要意义。
- 刘华淼鞠妍张然然邢秀梅
- 关键词:梅花鹿鹿茸双向凝胶电泳蛋白质组学
- 一种降低冷冻保存卵母细胞冻融后细胞器损伤的方法
- 一种降低冷冻保存卵母细胞冻融后细胞器损伤的方法,它涉及一种保护冷冻保存卵母细胞细胞器的方法,具体地是将甜菜碱应用于卵母细胞冷冻保存技术领域。它解决了现有高浓度冷冻保护剂对细胞有较大的化学毒性,导致卵母细胞纺锤体、染色体及...
- 曹新燕许保增赵蒙赵伟刚王士勇薛海龙邢明杰常彤张宇飞鞠妍
- 鹿科动物线粒体DNA序列差异和系统进化关系被引量:4
- 2017年
- 从Gen Bank数据库中获得20种鹿科动物的线粒体DNA序列全长,分析了序列碱基含量和遗传距离关系,并构建系统进化树,探讨了鹿科动物的系统进化关系。序列分析表明:鹿科动物线粒体DNA全长为16 305~16 482 bp,A+T含量约占62.58%,各物种间遗传距离为0.014~0.164。系统进化分析表明:驼鹿在鹿科动物中可能是最古老的;麋鹿与鹿属亲缘关系较近,支持将麋鹿划到鹿属的观点;泽鹿与花鹿属的斑鹿和豚鹿先聚到一起,支持将泽鹿划到花鹿属中;麂亚科中小麂可能是最原始的,赤麂和黑麂亲缘关系较近;獐与狍亲缘关系更近,建议将獐与狍划归到一个亚科。
- 鞠妍刘华淼邢秀梅
- 关键词:鹿科动物线粒体DNA系统进化
- 一种用于梅花鹿皮肤松弛相关基因Fibulin-5基因点突变的检测试剂盒
- 本发明涉及一种检测梅花鹿Fibulin-5基因突变的试剂盒,该试剂盒包括扩增Fibulin-5基因的试剂盒检测Fibulin-5基因突变的试剂。所属扩增Fibulin-5基因的试剂包括扩增Fibulin-5基因的PCR引...
- 陈秀敏魏海军杨镒峰徐超鞠妍赵伟刚崔学哲薛海龙赵蒙李丹丽安培培曹新燕宋兴超
- 文献传递
- 一种降低冷冻保存卵母细胞冻融后细胞器损伤的方法
- 一种降低冷冻保存卵母细胞冻融后细胞器损伤的方法,它涉及一种保护冷冻保存卵母细胞细胞器的方法,具体地是将甜菜碱应用于卵母细胞冷冻保存技术领域。它解决了现有高浓度冷冻保护剂对细胞有较大的化学毒性,导致卵母细胞纺锤体、染色体及...
- 曹新燕许保增赵蒙赵伟刚王士勇薛海龙邢明杰常彤张宇飞鞠妍
- 文献传递
- 一种动物卵巢取卵装置
- 本实用新型提供了一种动物卵巢取卵装置,包括;手柄,针板以及针头;所述手柄固定连接于所述针板的底部中心处,所述针头均匀排布于所述针板上。本实用新型的动物卵巢取卵装置具有携带、储存方便安全、操作简便、能够快速取用动物卵泡、切...
- 杨镒峰许保增魏海军陈敏赵伟刚陈秀敏赵蒙鞠妍薛海龙
- 文献传递
- 超微粉碎中草药添加剂在梅花鹿生产中的应用研究
- 为提高茸鹿养殖业经济效益、减少饲养成本,在茸鹿饲料中添加超微粉碎加工的中药添加剂,研究中草药添加剂对提高梅花鹿鹿茸产量的影响,结果表明:在梅花鹿开始脱盘后应用中药添加剂,直至锯二茬茸结束,梅花鹿头茬茸及二茬茸产量均有极显...
- 赵蒙赵伟刚魏海军常忠娟赵靖波鞠妍曹新燕杨镒峰薛海龙许保增
- 关键词:梅花鹿中草药饲料添加剂超微粉碎
- 检测梅花鹿皮肤松弛症相关基因Fibulin-5的601C>G突变的试剂盒
- 本发明涉及一种检测梅花鹿Fibulin-5基因突变的试剂盒,该试剂盒包括扩增Fibulin-5基因的试剂盒检测Fibulin-5基因突变的试剂。所属扩增Fibulin-5基因的试剂包括扩增Fibulin-5基因的PCR引...
- 魏海军陈秀敏杨镒峰鞠妍赵伟刚崔学哲薛海龙徐超宋兴超赵蒙李丹丽安培培曹新燕
- 文献传递
- 梅花鹿线粒体DNA的研究进展
- 2015年
- 线粒体DNA作为一个理想的分子标记已经被广泛应用到梅花鹿的起源进化研究中,并取得了一定的成果。文中介绍了梅花鹿线粒体DNA的结构、多态性研究等,综述了线粒体DNA在梅花鹿分子进化中的研究进展,并初步探讨了未来的发展。
- 鞠妍刘华淼邢秀梅
- 关键词:梅花鹿线粒体DNA多态性