钟欢
- 作品数：10 被引量：17H指数：3
- 供职机构：湖南师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家杰出青年科学基金湖南省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 利用尼罗罗非鱼EST序列筛选免疫抗病相关基因及多态性分析
- 2012年
- 利用生物信息学方法对尼罗罗非鱼ESTs序列进行基因功能注释和免疫抗病基因筛选。研究结果表明，在120991条EST序列中有60852（50．29％）条与已知的斑马鱼蛋白质相匹配，共获得11157个基因，分属于22个生物学功能。其中32个免疫抗病基因中补体因子和趋化因子相关基因有15个基因，占46．88％。结合运用生物信息学软件对补体因子和趋化因子进行多态性SNP分析，共发现8个基因中的140个SNP位点。其中补体c2基因的突变率最高，达7．57％。提示这些基因有较快的进化速率。本文为今后利用公共数据库中ESTs序列分析SNP位点，建立免疫抗病分子标记提供了新的思路。
- 王凤华冯浩周毅钟欢
- 关键词：表达序列标签单核苷酸多态性
- GH/IGF轴相关基因在不同倍性鲫鲤中的表达及与生长的相关性研究
- 异源四倍体鲫鲤是红鲫(Carassius auratus red var.,♀)和湘江野鲤(Cyprinus carpio,(?))远源杂交获得的后代,是世界上首次获得的两性可育、遗传性状稳定的多倍体群体。用雄性异源四倍...
- 钟欢
- 关键词：三倍体湘云鲫异源四倍体鲫鲤
- 文献传递
- 不同倍性鲫鲂高迁移率族蛋白1基因的克隆和原核表达被引量：1
- 2009年
- 用RACEPCR技术,分别获得三倍体鲫鲂、四倍体鲫鲂、红鲫和团头鲂的高迁移率族蛋白1基因(HMG1)mRNA全长序列,其开放阅读框包含579nt,翻译成193个氨基酸.不同倍性鲫鲂HMG1的cDNA和氨基酸序列比较分析表明:在cDNA水平上,四倍体鲫鲂与母本红鲫的同源性(99%)高于同父本团头鲂的同源性(97%);三倍体鲫鲂与父母本同源性(95%)低于亲本之间的同源性(98%);在氨基酸水平上,四倍体鲫鲂与父母本的同源性(100%)高于三倍体鲫鲂与亲本的同源性(97%).结果表明:远源物种间的杂交对两性不育的三倍体鲫鲂HMG1基因造成了一定的冲击,分子遗传效应表现为三倍体鲫鲂HMG1基因位点发生了变异;四倍体鲫鲂HMG1氨基酸序列与亲本的完全一致性,克服了等位基因的杂交不亲和性,为两性可育的异源四倍体鲫鲂遗传稳定奠定了基础.生物信息学分析表明:HMG1蛋白二级结构具有8个螺旋和3个转角,HMG1蛋白三级结构于N-端具有两个DNA结合基序,C-端具有一长为23个重复D或E的氨基酸尾.这种结构决定了HMG1能够与核DNA发生"蛋白-DNA"的相互作用,参与多种核内生物学功能的完成.另外,以HMG1氨基酸序列构建了鱼类、两栖类、爬行类、鸟类和哺乳类的进化树,结果提示HMG1是一种古老的蛋白质,并在物种演化中具有保守性;首次构建了鱼类HMG1原核表达载体,外源的鱼类HMG1基因编码蛋白在原核细胞中得到了表达,这为下一步HMG1蛋白的制备和生物学功能、尤其与DNA转座子相互作用的研究提供了条件,将助于了解物种间的杂交形成异源多倍体的机制.
- 刘东刘臻刘少军刘良国尤翠平陈琳钟欢刘筠
- 关键词：鱼类多倍体系统进化原核表达
- 雌核发育二倍体鲫鲤Dmc1基因的全长cDNA克隆及表达分析被引量：3
- 2012年
- Dmc1(disrupted meiotic cDNA)基因是一个在减数分裂前期Ⅰ表达的特异基因,其产物是减数分裂前期Ⅰ同源染色体配对所必需的。根据据酵母菌、小鼠以及人的DMC1中保守的氨基酸基序设计简并引物,PCR扩增克隆获得了第四代雌核发育二倍体鲫鲤(G4)Dmc1基因部分cDNA序列。在此基础上,通过RACE获得了G4Dmc1基因全长cDNA序列,长度为1 369 bp,其中开放阅读框为1 029 bp,编码含342个氨基酸的蛋白质。同时,系统进化分析表明,在进化过程中Dmc1基因在鱼类中保持着高度保守的进化特征。RT-PCR结果表明,Dmc1基因只在G4性腺中表达,在其他组织中不表达。通过实时荧光定量PCR,对Dmc1基因在G4和普通鲤鱼的早期卵巢的表达进行分析,发现G4表达比鲤鱼高。由此可见,雌核发育二倍体鲫鲤Dmc1基因也是减数分裂特异基因,而且其高表达暗示雌核发育二倍体鲫鲤具有正常的减数分裂过程并且其早期性腺存在着多倍体卵原细胞。
- 陶敏刘少军钟欢张纯刘筠
- 关键词：系统进化分析
- GH/IGF轴相关基因在不同倍性鲫鲤中的表达及生长的相关性研究
- 异源四倍体鲫鲤是红鲫(Carassius auratus red var，♀)和湘江野鲤(Cyprinus carpio，♂)远源杂交获得的后代，是世界上首次获得的两性可育、遗传性状稳定的多倍体群体。用雄性异源四倍体鲫鲤...
- 钟欢
- 关键词：三倍体湘云鲫异源四倍体鲫鲤
- 文献传递
- 基于ISSR,AFLP分子标记和cyclins基因克隆的异源四倍体鲫鲤进化分析被引量：2
- 2009年
- 为了解两性可育、遗传性状稳定的异源四倍体鲫鲤基因组的进化情况,用ISSR,AFLP分子标记及cyclin A1和B1基因克隆的方法,从多倍体基因组和单个基因在多倍体形成前后的变化两个角度对上述问题进行了探讨分析.研究结果表明,异源四倍体鲫鲤经过连续15代培育,仍然保持了原始亲本遗传性状的稳定性,但基因组的遗传相似性及cyclins基因的碱基变异水平都说明异源四倍体鲫鲤具有明显的偏母性遗传特性.ISSR和AFLP分析表明,在异源四倍体鲫鲤基因组中,除了新产生的、原始亲本中没有的DNA条带外,还发生了原始亲本的DNA带纹消失,而且消失的带纹倾向于父本基因组.cyclins基因序列分析表明,在异源四倍体鲫鲤不同于原始亲本的核苷酸变异位点中,由于存在密码子单个碱基的非同义突变导致了异源四倍体鲫鲤新的氨基酸位点的产生.异源四倍体鲫鲤上述基因组的非加性变化,可能是应对杂交和多倍化冲击而使其趋于遗传稳定的一种适应性变化.
- 刘良国颜金鹏刘少军刘东尤翠平钟欢陶敏刘筠
- 关键词：异源四倍体鲫鲤CYCLINB1基因基因组进化
- 日本白鲫IGF-1基因全长cDNA克隆及组织表达分析被引量：6
- 2012年
- 通过已获得的多个物种IGF-1基因的cDNA序列,设计合成简并引物,用日本白鲫的肝脏总RNA反转录获得的cDNA做模板,克隆获得了IGF-1中间序列.在此基础上,通过SMART RACE,获得了IGF-1全长cDNA序列.经过序列对比分析,所得到的序列是日本白鲫(Carassius cuvieri)IGF-1 cDNA全长,其中开放阅读框为486 bp,编码含161个氨基酸的蛋白质,该蛋白质含有保守的信号肽、B、C、A、D和E结构域和6个半胱氨酸残基.同时,系统进化分析表明,在进化过程中IGF-1基因在鱼类中保持着高度保守的进化特征.IGF-1在日本白鲫中广泛表达于多个组织,尤其在肝脏中表达量最高.在垂体、心脏、肾脏和肌肉中有较高的表达.而在脑、脾脏、精巢和卵巢中的表达量较低.
- 陶敏钟欢刘少军周毅
- 关键词：IGF-1基因日本白鲫SMARTRACE
- 不同倍性鲤科鱼Cyclin B基因内含子克隆与进化分析
- 2009年
- 运用PCR扩增、克隆、测序等技术,分别获得三倍体鲫鲂、四倍体鲫鲂、五倍体鲫鲂和团头鲂、草鱼、鲢鱼、鳙鱼等鲤科鱼Cyclin B基因部分DNA序列.结合异源四倍体鲫鲤及其原始亲本红鲫和鲤鱼Cyclin B基因对应DNA序列,对不同倍性鲤科鱼类Cyclin B基因DNA片段序列进行比较分析.结果表明:由相同引物扩增的染色体数为48的鲂、草、鲢、鳙鱼,只扩增出1条DNA片段,片段长度分别为750bp,950bp,720bp和720bp,而染色体数目加倍的红鲫、鲤鱼、异源四倍体鲫鲤、异源四倍体鲫鲂,扩增出2条DNA片段(1200bp和900bp),三倍体和五倍体鲫鲂扩增出3条DNA片段(1200bp,900bp和750bp),每个DNA片段均含Cyclin B基因第2,3内含子和第2,3,4外显子.序列分析表明,四倍体鲫鲤、三倍体鲫鲂、四倍体鲫鲂和五倍体鲫鲂与其母本1200bp片段同源性分别为99.5%,98.9%,99.5%和88.7%,与母本900bp片段同源性分别为97.5%,94.6%,94.2%和89.9%,说明四倍体鲫鲤与多倍体鲫鲂1200bp和900bpCyclin B基因片段与母本红鲫同源性高,在进化上具有偏母性遗传特性.而三倍体和五倍体鲫鲂的750bpCyclin B基因片段与父本同源性分别高达98.6%和98.2%,说明其来自父本团头鲂.在两性可育的异源四倍体鲫鲤和异源四倍体鲫鲂中存在各自父本Cyclin B基因片段序列消除现象.此外,用Cyclin B基因内含子3序列构建不同倍性鲤科鱼的系统进化树,结果表明,由Cyclin B基因内含子序列构建的系统进化树可以正确反映亲缘关系较近的鲤亚科属间鱼类系统进化关系,而不适合亲缘关系较远的亚科间杂交鱼类系统进化分析.
- 刘良国尤翠平刘少军刘东钟欢刘筠
- 关键词：鲤科鱼类异源四倍体CYCLIN
- 雌核发育二倍体鲫鲤及其他倍性鱼cdc2基因cDNA全序列克隆及表达被引量：1
- 2013年
- 为研究雌核发育二倍体鲫鲤产生二倍体卵子的分子机制,实验采用PCR和cDNA末端快速分离法,克隆获得了雌核发育二倍体鲫鲤第三代(G3)、二倍体红鲫、三倍体湘云鲫和四倍体鲫鲤的细胞周期相关基因——cdc2基因cDNA全序列。结果显示,4种不同倍性鱼cdc2基因均编码含有302个氨基酸蛋白,而且编码的蛋白都含有与其他CDK激酶相当保守的序列PSTAVRE;同源性分析发现,4种鱼cdc2基因编码的氨基酸序列之间的相似度大于97.6%,说明Cdc2蛋白在这4种不同倍性鱼中具有高度保守性。采用实时荧光定量PCR(real-timePCR)对cdc2基因在G3、二倍体红鲫、三倍体湘云鲫及四倍体鲫鲤早期卵巢中的表达进行分析,结果发现,G3cdc2基因比普通二倍体红鲫和三倍体湘云鲫表达要高,比四倍体鲫鲤的表达水平低。该研究从分子水平证明了G3早期性腺中存在着大量的多倍体卵原细胞。同时,研究表明,cdc2基因在雌核发育二倍体鲫鲤早期卵巢的高表达暗示着G3多次进入S期却不经历M期导致二倍体配子的产生。
- 陶敏刘少军钟欢周毅宋灿张纯刘筠
- 关键词：细胞周期
- 异源四倍体鲫鲤及亲本ApoE的克隆及组织表达分析
- 2012年
- 载脂蛋白E(Apolipoprotein E,ApoE)作为胆固醇代谢过程中的关键因子,参与脂蛋白转运和性腺发育。为进一步了解该基因的作用,本实验克隆并测序了异源四倍体鲫鲤及其父母本ApoE基因的全长序列。异源四倍体鲫鲤、红鲫和鲤的ApoE全长分别为1393 bp、1384 bp和1396 bp,均编码281个氨基酸。序列对比表明,异源四倍体鲫鲤ApoE与父本鲤更为相似。另外有2个氨基酸位点发生了与父母本均不同的变异,证明异源四倍体鲫鲤除了有杂交特征外也产生了变异。通过Mega软件构建的哺乳动物ApoE进化树与系统分类相一致:鲤科鱼类的ApoE聚类在一起而分离于其它物种。Real time PCR分析表明,ApoE基因在3种鱼中的组织表达模式基本一致,所有组织均有表达,而在脾脏中表达最高。
- 王凤华周毅刘少军钟欢张纯陶敏刘筠
- 关键词：异源四倍体鲫鲤红鲫载脂蛋白
