郭冬
- 作品数：52 被引量：80H指数：5
- 供职机构：中国热带农业科学院热带生物技术研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家天然橡胶产业技术体系建设专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学文化科学医药卫生更多>>
- 巴西橡胶树HbSIP2互作蛋白的筛选和鉴定被引量：1
- 2019年
- 可溶性无机焦磷酸酶在天然橡胶生物合成中具有重要的调控作用,HbSIP2是胶乳中关键的可溶性无机焦磷酸酶基因。为了深入了解HbSIP2调控橡胶生物合成的机理,本研究对HbSIP2互作蛋白进行了筛选和鉴定。结果表明:诱饵载体p GBKT7-Hb SIP2无自激活活性,且对酵母无毒性作用,可以用于酵母文库筛选。将诱饵载体与橡胶树胶乳cDNA文库进行杂交,初步筛选获得20个与HbSIP2互作的蛋白。进一步通过双分子荧光互补实验证实,Hb SIP2能够与橡胶延伸因子发生蛋白互作。本研究结果为HbSIP2调控橡胶生物合成的机理研究提供了重要的理论依据。
- 朱家红徐靖郭冬李辉亮王颖彭世清
- 关键词：巴西橡胶树
- 海南龙血树类黄酮3′-羟化酶基因(DcF3′H)的克隆与表达分析被引量：2
- 2016年
- 类黄酮3′-羟化酶(Flavonoid 3′-hydroxylase,F3′H)是植物黄酮类化合物骨架修饰途径中的关键酶之一,在形成结构多样化的黄酮类化合物中起重要作用。在前期已获得的龙血树转录组数据基础上克隆了1个海南龙血树F3′H基因,命名为DcF3′H。DcF3′H含有的开放阅读框长1 533 bp,编码510个氨基酸。推导的DcF3′H分子量为58 ku,等电点p I为6.59。DcF3′H含有细胞色素P450的保守结构域和CYP基序,与甘蔗、玉米、猕猴桃、小麦、烟草、黄瓜和大豆等植物的F3′H同源性分别为76%、75%、77%、74%、75%、76%和75%。进化树分析表明,DcF3′H与中国水仙亲缘关系较近,与苜蓿和鹰嘴豆的亲缘关系较远。荧光定量表达结果显示:DcF3′H在根、茎、叶、花和果等组织中均有表达,其中在花中表达量最高,根中表达量最低;无机盐诱导剂处理能显著提高DcF3'H的表达量,处理3 d时DcF3′H的表达量提高了5.58倍。此结果将为进一步研究海南龙血树类黄酮3′-羟化酶基因的功能奠定基础。
- 陈盼曹天骏戴好富李辉亮郭冬梅文莉彭世清
- 关键词：海南龙血树
- 巴西橡胶树HbHMAD1的克隆及表达
- 2011年
- 根据已获得的在橡胶树自根幼态无性系与老态无性系胶乳中一个差异表达的片段序列设计引物,通过RACE法获得了橡胶树编码含有重金属相关结构域蛋白的cDNA,命名为HbHMAD1。序列分析结果表明,HbHMAD1长为814 bp,含有453 bp的阅读框,78 bp的5'-UTR和283 bp的3'-UTR,编码150个氨基酸,分子量为16.9 ku,等电点为10.4。HbHMAD1含有重金属相关结构域,与蓖麻(Ricinus communis)、拟南芥(Arabodopsis thesis)(3个)和玉米(Zea mays)中的含有重金属相关结构域蛋白的同源性分别为85%、64%、63%、60%和55%。半定量RT-PCR分析表明HbHMAD1基因在胶乳和树皮中表达,在叶中微量表达,在花中基本不表达。
- 王颖郭冬李辉亮彭世清
- 关键词：巴西橡胶树
- 海南龙血树4-香豆酸辅酶A连接酶基因的克隆与表达分析被引量：2
- 2018年
- 4-香豆酸辅酶A连接酶(4CL)是苯丙烷代谢途径中的一个关键酶之一,在木质素和类黄酮生物合成中起重要作用。利用前期已获得的转录组数据,克隆了1个海南龙血树4CL基因,命名为Dc4CL1。Dc4CL1全长为2139bp,编码549个氨基酸。Dc4CL1氨基酸序列具有典型的保守序列SSGTTGMPKGV和催化活性中心GEICIRG序列,其等电点为8.98,相对分子质量为59.7kD,不稳定系数为47.60,在分类上属于不稳定性蛋白。进化树分析表明,Dc4CL1属于ClassⅢ类4CL,血竭诱导剂能够诱导Dc4CL1的表达;Dc4CL1对干旱、盐和糖三种胁迫无响应,而对紫外辐射响应积极;龙血树经过茉莉酸(jasmonicacidJA)、脱落酸(abscisicacidABA)、细胞分裂素(6-BA)和油菜素甾醇(brassinosteroidBR)诱导处理可以上调Dc4CL1的表达。本研究将为进一步揭示4CL在海南龙血树类黄酮生物合成和血竭形成中的潜在功能提供帮助。
- 夏栋楠朱家红李辉亮郭冬王颖符文英彭世清
- 关键词：海南龙血树
- 橡胶树自根幼态无性系高产的分子机制及应用
- 李辉亮郭冬彭世清王颖朱家红杨子平陈雄庭鲁惠中兰芳银唐潇
- 所属科学技术领域：农业生物技术。主要内容：橡胶树是热区一种重要的经济作物，其生产的天然橡胶是一种工业原料和战略物资。橡胶树自根幼态无性系是经组织培养获得的有自己根系的幼态再生植株。该项目针对幼态无性系高产橡胶树的早期分子...
- 关键词：
- 关键词：橡胶树经济作物
- 巴西橡胶树HbMET的克隆与表达分析
- 2015年
- 通过同源克隆和RACE方法获得了巴西橡胶树DNA甲基转移酶(DNA Methyltransferase,MET)基因(Hb MET)。Hb MET长4 896 bp,含有4 635 bp的阅读框架,编码1 545个氨基酸。蛋白分子量174.36 ku,等电点为6.36。氨基酸序列与可可、毛果杨、黄瓜、拟南芥、碧桃、葡萄和烟草等物种的MET家族成员的同源性分别为73%、77%、74%、56%、72%和68%。进化树分析表明,Hb MET氨基酸序列与毛果杨的MET亲缘关系最近。Hb MET在巴西橡胶树的根、树皮、叶、胶乳中均有表达,其中在胶乳中表达量最低;Hb MET在橡胶树自根幼态无性系的胶乳中表达比老态无性系胶乳中的表达低。
- 李辉亮郭冬汪晗杨子平彭世清
- 关键词：巴西橡胶树DNA甲基转移酶DNA甲基化
- 一种橡胶树八氢番茄红素脱氢酶基因VIGS沉默体系及其构建方法与应用
- 本发明实施例公开了一种橡胶树八氢番茄红素脱氢酶基因VIGS沉默体系及其构建方法与应用，属于生物技术领域。所述橡胶树八氢番茄红素脱氢酶基因VIGS沉默体系具有如SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列。本发明操作简单，建立了...
- 李辉亮彭世清郭冬王颖朱家红
- 文献传递
- 海南龙血树WD40转录因子基因DcWD40-1的克隆和表达分析被引量：2
- 2020年
- 海南龙血树是国产血竭的主要基源植物,其血竭主要化学成分为类黄酮化合物。为进一步了解DcWD40-1在类黄酮生物合成中的潜在功能和作用机制,该研究根据海南龙血树转录组数据,利用RT-PCR技术在海南龙血树中克隆了一个WD40基因DcWD40-1,该基因全长1550 bp,包含一个1353 bp的开放阅读框,编码450个氨基酸,蛋白质分子量50.77 kD,理论等电点5.71。生物信息学分析显示,DcWD40-1属于WD40蛋白家族成员,具有5个保守的WD40结构域,和其他植物WD40蛋白同源性高,保守性强。利用Genome Walking方法分离了1503 bp的DcWD40-1启动子序列,该区域具有典型真核生物启动子结构特征,并含有多个应答激素和胁迫的响应元件。表达分析显示,血竭诱导剂能够诱导Dc WD40-1的表达,DcWD40-1的变化与血竭形成及类黄酮积累正相关。此外,DcWD40-1也能对茉莉酸甲酯、细胞分裂素、油菜素内酯和UV-B处理做出积极响应。
- 朱家红夏栋楠王颖郭冬李辉亮梅文莉彭世清
- 关键词：海南龙血树血竭类黄酮基因表达
- 调控橡胶树法尼基焦磷酸合酶基因转录因子的初步筛选被引量：1
- 2014年
- 为研究橡胶树中法尼基焦磷酸合酶基因(Hb FPS)的表达调控机制,采用酵母单杂交技术筛选了胶乳中与Hb FPS启动子结合的蛋白因子。将Hb FPS启动子与报告质粒p HIS2.1连接构建诱饵质粒p His-FPS,经筛选确定抑制背景表达的3-氨基三唑(3-aminotriazole,3-AT)浓度为10 mmol/L。同时以橡胶树胶乳m RNA为模板合成双链c DNA,并将双链c DNA、线性化的p GADT7Rec2载体和诱饵质粒p His-FPS共同转化酵母菌株Y187,两载体共转化效率为1.7×106 cfu/μg。筛选共得到阳性克隆36个,获得31条序列。对获得的c DNA序列进行生物信息学分析,得到2个转录因子序列,分别为类乙烯响应转录因子ERF003和Hb LMYC2。结果为进一步研究Hb FPS表达调控机制奠定基础。
- 郭冬李辉亮杨子平彭世清
- 关键词：橡胶树转录因子
- 巴西橡胶树HbHDT1基因的克隆及表达分析被引量：8
- 2010年
- 根据一个已获得的在巴西橡胶树幼态无性系与老态无性系之间差异表达的SSH片段的序列信息设计引物,通过RACE的方法获得橡胶树编码组蛋白去乙酰化酶(histone deacetylase)的cDNA(命名为HbHDT1)。序列分析结果表明,HbHDT1长为1197bp,含有917bp的阅读框,86bp的5'-UTR和196bp的3'-UTR,编码304个氨基酸。该氨基酸序列与蓖麻、毛果杨、马铃薯、红花苜蓿、大豆、小麦的HDACs家族成员的同源性分别为65%、59%、50%、45%、43%和40%。半定量RT-PCR分析结果表明HbHDT1在巴西橡胶树的花、愈伤组织、胚、叶、芽、胶乳中均有表达。在体细胞胚发生过程中HbHDT1表达出现明显的差异,在培养12d的体细胞胚中表达量最低,在培养53d的体细胞胚中表达量最高。茉莉酸和乙烯处理对胶乳中HbHDT1的表达无影响。
- 鲁惠中李辉亮郭冬彭世清
- 关键词：组蛋白去乙酰化酶巴西橡胶树茉莉酸乙烯
