胡海芳
- 作品数：7 被引量：9H指数：2
- 供职机构：新疆医科大学第一附属医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 新疆维、汉人群CD14基因单核苷酸多态性的连锁不平衡和单倍型分析被引量：1
- 2011年
- 目的研究CD14基因-159-、1359r、s2569192 3个单核苷酸多态性(SNP)的发生频率在新疆维吾尔族(维族)、汉族人群是否存在连锁不平衡关系及其单倍型组成。方法应用SNaPshot SNP分型技术对新疆地区维族、汉族300例(维、汉族各150例)健康个体CD14基因-159C/T-、1359T/Gr、s2569192G/C 3个SNP位点进行基因分型,分析3个位点间的连锁不平衡关系,计算它们构成的单倍型。结果 CD14基因-159C/T-、1359T/G、rs2569192G/C 3个SNP位点基因型频率分布符合H-W平衡。新疆维族和汉族的等位基因发生频率差异无统计学意义(P>0.05)。通过对这3个SNP位点两两间进行连锁不平衡分析,发现连锁不平衡系数|D’|值都为1。3个SNP主要组成4种单倍型:TGC、CTC、CGG、CGC,维、汉族单倍型频率比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论新疆地区维、汉人群CD14基因-159C/T-、1359T/Gr、s2569192G/C 3个SNP位点呈完全连锁不平衡。TGC是维、汉族人群的主要单倍型。为新疆地区维、汉族人群CD14基因3个SNP的群体遗传学资料,并且为寻找与CD14相关疾病单倍型奠定了基础。
- 胡海芳张华孙捷阳玉萍王燕谭国萍向阳冰陈俞
- 关键词：CD14单核苷酸多态性单倍型
- 新疆维吾尔族、汉族人群TIM-3启动子区rs10053538与过敏性鼻炎的相关性被引量：3
- 2011年
- 目的探讨新疆维吾尔族、汉族TIM-3基因的单核苷酸多态性位点rs10053538的多态性及其与过敏性鼻炎的关系。方法采用SNaPshot SNP分型技术检测新疆地区维、汉族正常及过敏性鼻炎各150例TIM-3启动子区rs10053538的单核苷酸多态性,计算基因型和等位基因频率。结果新疆地区维吾尔族、汉族正常人群TIM-3基因启动子区rs10053538位点基因型及其频率TT、TG、GG分别为0.86、0.13、0.01及0.89、0.1、0.01,过敏性鼻炎组的频率分别为0.86、0.14、0及0.87、0.13、0,其基因型和等位基因频率均与对照组差异无统计学意义(P值>0.05)。结论新疆维吾尔族、汉族人群TIM-3基因启动子区rs10053538与过敏性鼻炎之间不存在相关性。
- 王燕张华刘志连胡海芳王惠妩向阳冰谭国萍阳玉萍
- 关键词：TIM-3基因基因多态性过敏性鼻炎
- CD14基因多态性与变应性疾病
- 2010年
- CD14是细菌内毒素脂多糖受体，通过对其单核苷酸多态性的研究，发现基因多态性与环境内毒素暴露水平密切相关。CD14基因多态性可影响Th1／Th2免疫应答平衡，从而影响变态反应性疾病的发生。本文在综合国内外相关研究基础上就CD14基因多态性与变应性疾病的关系做一综述。
- 胡海芳张华
- 关键词：变应性ALLERGIC
- 新疆维吾尔族、汉族CD14基因多态性与变应性鼻炎的关联研究
- 目的：研究新疆地区维吾尔族、汉族CD14基因单核苷酸多态性的特点及其与变应性鼻炎的关系。
方法：首先采用直接测序的方法检测32例正常维吾尔族人CD14基因全长，确定维吾尔族人群CD14基因SNPs的位置、类型和频率...
- 胡海芳
- 关键词：维吾尔族汉族变应性鼻炎CD14单核苷酸多态性
- 文献传递
- 维吾尔族CD14基因单核苷酸多态性和遗传结构分析被引量：1
- 2011年
- 目的通过检测新疆维吾尔族人群CD14基因全长的序列信息,分析CD14基因的单核昔酸多态性(single nucleotide polymorphisnrs,SNPs)和维吾尔族遗传结构。方法采用直接测序的方法检测32例健康维吾尔族人CD14基因全长,将测序结果与美国国家生物技术信息中心(NCBI)及国际人类基因组单体型图计划(HapMap)中中国汉族人、日本人、欧洲人及非洲人的SNP进行对比,确定维吾尔族人群CD14基因SNPs的位置、类型和频率。结果总共有效测序长度约为4000bp,发现了11个SNP位点,这11个位点彼此都处于高度的连锁不平衡。通过11个位点计算出4个主要单倍型,频率最高的是ACAGGGCTGGG,为56.2%。计算出3个频率大于10%的标签SNP(tagSNP)。这11个SNP位点里有9个位点在NCBI的dbSNP数据库中已存在,2个是新发现的低频SNP,其中rs2569192和rs4914在维吾尔族人的分布与中国汉族人、日本人、欧洲人、非洲人明显不同,差异有显著性(P<0.01)。rs2569190和rs2569191在维吾尔族人分布与其他种族人的差异有显著性(P<0.05)。结论中国维吾尔族人群CD14基因的SNPs分布和遗传结构有别于其他人种,在后续研究中应参考维吾尔族人自己的测序数据。该研究为CD14基因与疾病关联研究候选SNPs的选择提供了科学依据。
- 胡海芳王燕张华谭国萍向阳冰
- 关键词：CD14单核苷酸多态性维吾尔族
- 新疆维吾尔族健康人中Tim-3基因结构分析
- 2011年
- 目的检测新疆维吾尔族人中Tim-3基因启动子区和非翻译区单核苷酸多态性(SNP),寻找Tim-3基因的遗传标记。方法采用分段扩增直接测序法,检测32名正常新疆维吾尔族人Tim-3基因5′启动子3kb和3′端1kb的长度—筛查SNPs,将测序结果与NCBI数据库中其他人种进行比较,确立新疆维吾尔族人中Tim-3基因突变的位置、类型及频率。结果在Tim-3基因启动子区和非翻译区发现12个SNP位点,有8个高频SNP位点在NCBI的dbSNP数据库中已存在,4个是新发现的低频SNP;各个SNPs的基因型和等位基因分布经Hardy-Wein-berg平衡定律检验,均达到遗传平衡,具有群体代表性。32例SNPs的分布及频率未见明显的统计学差异。结论新疆维吾尔族人中Tim-3基因SNP分布具有种族和地域差异,可为研究维、汉族人Tim-3基因与疾病相关性提供依据。
- 王燕胡海芳张华
- 关键词：人种群
- 新疆维吾尔族和汉族人群Tim-3基因多态性与变应性鼻炎的相关性研究被引量：4
- 2011年
- 目的研究探讨新疆地区维吾尔族（维族）、汉族人群Tim-3基因5′侧翼区的rs10515746（-574G〉T）、rs4704853（-882C〉T）及位于内含子区的rs13170556和rs6555849位点的单核苷酸多态性（single nueleotide polymorphism，SNP）及其与变应性鼻炎（allergic rhinitis，AR）的关系。方法采用SNaPshot SNP分型技术，对新疆地区维族和汉族AR患者及健康对照人群的Tim-3基因rs10515746（-574G〉T）、rs4704853（-882C〉T）、rs13170556和rs6555849位点的SNP进行分析，根据Tim-3基因分布计算其基因型和等位基因频率，并采用Hardy—Weinberg平衡定律进行检验。结果维族人群中rs10515746（-574G〉T）、rs4704853（-882C〉T）、rs13170556和rs6555849位点基因型频率及其等位基因频率在AR组与对照组间差异均无统计学意义（P值均〉0．05）；汉族人群中基因型频率及其等位基因频率在AR组与对照组之间差异也无统计学意义（P值均〉0．05）。除汉族病例组rs4704853位点外，其他各位点基因型及等位基因频率分布符合Hardy—Weinberg平衡定律。结论新疆地区维族、汉族人群中Tim-3基因rs10515746（-574G〉T）、rs4704853（-882C〉T）、rs13170556和rs6555849位点存在多态性变异，但与AR的易感性无关。
- 王燕刘志连孙捷伊力哈木·依马木胡海芳张华
- 关键词：膜蛋白质类
