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罗永海
作品数:
2
被引量:24
H指数:2
供职机构:
江苏师范大学生命科学学院
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发文基金:
江苏省高校自然科学研究项目
农业部农作物物种资源保护项目
江苏高校优势学科建设工程资助项目
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相关领域:
农业科学
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合作作者
李宗芸
江苏师范大学生命科学学院
石璇
江苏师范大学生命科学学院
余益成
江苏师范大学生命科学学院
韩永华
江苏师范大学生命科学学院
俞立璇
江苏师范大学生命科学学院
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2篇
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农业科学
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BLAST
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EQ
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NRDNA
机构
2篇
江苏师范大学
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中国农业科学...
作者
2篇
罗永海
2篇
李宗芸
1篇
曹清河
1篇
谢逸萍
1篇
刘美艳
1篇
俞立璇
1篇
韩永华
1篇
石璇
1篇
余益成
传媒
1篇
作物学报
1篇
植物科学学报
年份
1篇
2016
1篇
2014
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栽培种甘薯及其近缘野生种nrDNA ITS序列分析
被引量:6
2014年
采用核糖体DNA内转录间隔区(nrDNAITS)序列比较分析了甘薯及其近缘野生种的遗传多样性及系统进化关系,首次报道了栽培种甘薯‘徐薯18’(Ipomoea batatas‘Xushu 18’)及其近缘野生种I.triloba(DOM),I.cordatotriloba(MEX),I.nil(PER)。I.nil(JPN)。I.hederacea Jacq.(USA),f.hederacea Jacq.(HK)和种间杂交种67-1(I.batatas‘Xushu18’×I.hederacea Jacq.)及回交种(67-1×I.batatas‘Xushu18’)的nrDNAITS序列。序列分析表明,栽培种甘薯及其近缘野生种nrDNAITS序列长度为570-600bp。其中,ITS1序列为185~209bp,GC含量为53.11%~61.83%;ITS2序列为214-226bp,GC含量为61.21%-72.89%;5.8S序列均为165bp,GC含量为54.55%-55.76%。此外,栽培种甘薯及其近缘野生种ITS序列信息位点均集中在ITS1和ITS2区;与其他甘薯属植物相比,I.wrightii ITS2的末端缺失了6~8个碱基。系统进化分析表明,栽培种甘薯‘徐薯18’(I.batatas‘Xushu18’)和野生种I.triloba、I.cordatotriloba、I.ecunosa、I.trifida的亲缘关系较近,与I.wrightii、I.pes-tigridis、I.grandifolia、I.nil、I.hederaceaJacq.、I.pur-purea的亲缘关系较远;杂交后代与栽培种甘薯‘徐薯18’(I.batatas‘Xushu18’)亲缘关系较近,与野生种父本I.hederaceaJacq.的亲缘关系较远。
俞立璇
刘美艳
曹清河
余益成
谢逸萍
罗永海
韩永华
李宗芸
关键词:
甘薯
NRDNA
BLAST
系统发育树
利用简化基因组技术分析甘薯种间单核苷酸多态性
被引量:18
2016年
选用Xushu 18(6x)和Nancy Hall(6x)、2个二倍体I.trifida(2x)品系(4597-10和4597-21)、四倍体I.trifida(4x)、六倍体I.trifida(6x)、二倍体I.temussima(2x)和I.littorallis(2x)以简化基因组测序技术SLAF-seq测序,获得724 589个SLAF标签,其中多态性SLAF标签35 310个。通过序列分析,获得40 765个有效单核苷酸多态(SNP),并用这些SNP分析了8个种质的群体结构和系统发生树。结果表明,利用简化基因组测序技术SLAF-seq能高效、低成本地开发出大量可用于群体遗传分析的SNP标记;通过构建进化树发现甘薯栽培种和野生种I.trifida的亲缘关系比较近。这些分析结果为进一步研究甘薯栽培种的起源提供了基础数据。
石璇
王茹媛
唐君
李宗芸
罗永海
关键词:
甘薯
SNP
进化分析
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