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欧阳清检

作品数:3 被引量:2H指数:1
供职机构:湖南大学更多>>
发文基金:湖南省科技计划项目国家科技支撑计划长沙市科技计划项目更多>>
相关领域:生物学医药卫生更多>>

文献类型

  • 2篇期刊文章
  • 1篇学位论文

领域

  • 2篇生物学
  • 1篇医药卫生

主题

  • 3篇简单重复序列
  • 2篇病毒
  • 1篇单纯疱疹
  • 1篇单纯疱疹病毒
  • 1篇亚种
  • 1篇乙型
  • 1篇乙型肝炎
  • 1篇乙型肝炎病毒
  • 1篇人腺病毒
  • 1篇疱疹
  • 1篇基因
  • 1篇基因组
  • 1篇肝炎
  • 1篇肝炎病毒
  • 1篇SSRS
  • 1篇B2
  • 1篇C2
  • 1篇GC含量

机构

  • 3篇湖南大学

作者

  • 3篇欧阳清检
  • 2篇赵相艳
  • 2篇谭钟扬
  • 2篇冯海平
  • 1篇田优
  • 1篇牛一乐
  • 1篇李丹

传媒

  • 2篇生物信息学

年份

  • 2篇2013
  • 1篇2011
3 条 记 录,以下是 1-3
排序方式:
人腺病毒B、D亚种基因组中简单重复序列分析
2013年
本文以人腺病毒B亚种31条基因组序列及D亚种39条基因组序列为研究材料,利用ImperfectMicrosatelliteExtractor和DNAMAN软件对这些基因组序列中简单重复序列(SSR)的分布情况进行了系统性分析和比较。分析结果显示:人腺病毒B、D亚种基因组中简单重复序列的平均相对密度是十分接近的,但在不同类型SSR中分布情况又有所不同。D亚种中二型SSR明显高于B亚种,在两亚种一型SSR中(A)n、(T)n都是比较多的,而在两亚种二型SSR中的(CG/GC)n表现出了较高的偏好性。在同亚种多序列比对分析中,D亚种表现出了更高的稳定性。B、D亚种中SSR的这种特异性分布可能与它们的进化机制和致病性有关。
田优谭钟扬赵相艳牛一乐冯海平欧阳清检
关键词:人腺病毒亚种简单重复序列
乙型肝炎病毒B2和C2亚型中SSRs的比较分析被引量:2
2011年
乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)属于嗜肝DNA病毒科(hepadnaviridae),它分布在世界各地并严重危害人类的健康。本文从NCBI的GenBank中下载了106条B2亚型和130条C2亚型的基因组全长序列,以下载的数据为材料,分析简单重复序列(simple sequence repeats,SSRs)在B2和C2亚型基因组序列中的分布情况。结果显示,简单重复序列的重复次数比较少;二型简单重复序列在研究的五种简单重复序列类型中占绝对优势;这可能与B2和C2亚型基因组序列有较高的突变率有关。同时还发现最普遍的SSRs、序列间SSRs的平均相对丰度和平均相对密度在B2和C2亚型中分布情况相似。
冯海平谭钟扬李丹赵相艳李明福欧阳清检
关键词:简单重复序列乙型肝炎病毒
单纯疱疹病毒中简单重复序列及其GC含量的研究
人类单纯疱疹病毒一型(Herpes simplex virus type1,HSV-1)和二型(Herpessimplex virus type2,HSV-2)的感染是普遍存在于全世界的,它们感染人后经常引发各种疱疹和许...
欧阳清检
关键词:简单重复序列单纯疱疹病毒GC含量
文献传递
共1页<1>
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