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一种使单态性SSR标记转变为多态性标记的方法: 本发明属于棉花分子育种技术领域，具体是一种使单态性SSR标记转变为多态性标记的方法。它包括以下步骤：(1)8％非变性聚丙烯酰胺凝胶的制备，丙烯酰胺与甲叉双丙烯酰胺的比例为25-30∶1，10x TBE 100ml，然后用...; 林忠旭张献龙李夕梅; 文献传递

基于重测序的陆地棉InDel标记开发与评价被引量：19: 2019年; 碱基插入/缺失(InDel)是基因组中丰富的遗传变异形式。InDel以其密度高、易于基因型分型等优点成为分子标记开发的理想来源。本研究利用262份陆地棉品系重测序数据鉴定的InDel位点,在全基因组范围内设计了3206个InDel标记并挑选均匀分布的320个标记进行验证。320个标记筛选出87个多态性标记,多态性率为26.88%。利用多态性标记对不同地理来源的262份陆地棉种质资源进行基因分型,共检测到160个等位位点;多态性信息含量(PIC)为0.0836～0.3750,平均值为0.3073;基因多样性指数变异范围为0.0874～0.5000,平均值为0.3876,表明我国陆地棉遗传基础相对狭窄。群体结构分析将262份陆地棉品系大致划分为2个亚群,聚类分析和主成分分析的结果与之基本一致。采用混合线性模型(Mixed linear model)对6个纤维品质性状的关联分析检测到65个关联位点(P <0.01),各位点对表型变异贡献率为2.57%～8.12%。本研究旨在利用重测序数据开发全基因组范围的可用于凝胶检测的InDel标记,为棉花种质资源研究和分子标记辅助选择育种提供便捷工具。; 吴迷汪念沈超黄聪温天旺林忠旭; 关键词：陆地棉 INDEL标记

利用多群体、多环境定位陆地棉农艺性状QTL及纤维长度主效QTL的克隆: 利用纤维品质优良的陆地棉品系DH962和高产品种"冀棉5号"为亲本构建了F2分离群体,利用已发表的SSR标记以及两亲本RAD测序鉴定的多态性分子标记,构建了1张包含1013个位点,长3 004.71 ...; 王寒涛沈超林忠旭; 关键词：纤维长度 QTL定位

新疆彩色棉23个品种指纹图谱的构建及遗传多样性分析被引量：13: 2014年; 以新疆截止2012年审定的23份新彩棉品种为材料,利用SSR标记进行DNA指纹图谱的构建和遗传多样性分析.从5000对SSR引物中,挑选出多态性高、稳定性好、均匀分布在棉花26条染色体上的52对引物,在23份新彩棉品种中筛选出核心引物47对,SSR扩增检测到多态性基因型位点数共计162个,每个标记检测到的基因型位点数在2～7之间,平均为3.45个;引物多态信息量（PIC）值介于0.4537～0.8686之间,平均值为0.7096.结果显示：在23份新彩棉品种中,14份品种采用特异或特征引物可以一次性区分开,其余9份品种需要采用引物组合来实现区别该品种与其他品种.最少选用18对特异引物及组合引物就可以完全区分开新彩棉1～23号品种.利用18对SSR标记构建了新彩棉1号至23号品种的指纹图谱.利用NTSYS-pcV2.10软件聚类分析表明：23个新彩棉品种遗传相似系数变化范围是0.3781～0.9298,平均为0.5511,表明新彩棉品种之间存在着丰富的遗传多样性.; 尤春源聂新辉张胜郭欢乐王夏青林忠旭; 关键词：彩色棉 DNA指纹图谱

利用EST-SSR标记构建棉花纤维转录遗传连锁图谱的方法: 本发明属于棉花分子育种技术领域，具体涉及一种构建棉花纤维转录图谱的方法，步骤如下：以海岛棉Pima 3-79为父本，陆地棉鄂棉22为母本，杂交得F1；种植F<Sub>1</Sub>，使F1自交，得到F<Sub>2</Su...; 张献龙林忠旭刘传祥; 文献传递

棉花MAGIC群体的遗传解析与种质创新: 林忠旭

陆地棉产量、纤维品质相关性状主效QTL和上位性互作分析被引量：22: 2009年; 【目的】为了能够较为全面地了解陆地棉产量和纤维品质相关性状的遗传基础,利用包含471个标记、总长3070.2cM、覆盖棉花基因组65.88%左右的遗传图谱对其进行主效QTL定位和上位性互作分析。【方法】以DH962×冀棉5号的F2:3家系为分析群体,用WinQTLCartV2.5进行复合区间作图定位主效QTL,利用EPISTACY软件对共显性标记进行两位点的上位性互作分析。【结果】共检测到9个与产量相关性状的主效QTL,和5个与纤维品质相关性状的主效QTL,整齐度和比强度在显著LOD阈值下没有检测到相关QTL。共检测到75对互作位点,大多数互作属于非QTL位点与非QTL位点之间的互作,互作类型以加性显性互作和显性加性互作为主。所涉及的性状中,影响衣分和纤维长度的互作位点最多,单株铃数和衣指的最少。在LG1上检测到1个同时控制单株籽棉重、单株皮棉重和籽指主效QTL。在两位点的互作对中也发现了同时影响单株籽棉重、单株皮棉重和马克隆值的互作位点1对,同时影响衣分和纤维长度的互作位点4对。【结论】除了主效QTL外,上位性是陆地棉产量和纤维品质性状的重要遗传基础。主效QTL的效应小和上位性互作将会使得棉花分子标记辅助育种更加困难和复杂。表型相关的性状是由相同的QTL/互作位点所控制,这有助于多个性状的同时选择。; 林忠旭冯常辉郭小平张献龙; 关键词：陆地棉纤维品质上位性

棉花产量及相关性状的QTL s定位与效应分析: 利用由陆地棉邯郸208和海岛棉Pima90杂交组合衍生的F<,2:3>家系群体进行产量及其相差性状的QTL检测和遗传效应分析.结果检测出39个QTL分别与产量及农艺性状有关,分布在21个连锁群上.其中衣指QTL1个,解释...; 贺道华林忠旭张献龙聂以春郭小平; 关键词：棉花 QTL分析相关性状; 文献传递

陆地棉对黄萎病抗性的分子标记研究被引量：37: 2005年; 利用陆地棉标准系TM-1和常抗棉2个陆地棉品种杂交并自交,获得109个F2单株及F2:3家系为作图群体,以SSR、RAPD和SRAP 3种分子标记进行抗黄萎病性状的分子标记筛选。结果从1 611对(条)引物中仅筛选到70对(条)多态性引物,获得75个多态性位点并进行标记间的连锁性分析。75个标记构建了一个包括15个连锁群,全长535 cM的陆地棉品种间分子标记遗传连锁图,标记间平均距离为11.15 cM,有27个标记不能进入任何连锁群。连锁群的标记数最少2个,最多6个;长度从1.0 cM到92.7 cM不等。对其F2:3家系的成株期抗黄萎病性状即平均病情指数的分布进行分析,显示其呈正态分布,进一步说明陆地棉对黄萎病的抗性为数量遗传;单标记分析及复合区间作图,检测出与抗黄萎病性相关的3个QTL,分别位于第3、5、6连锁群上,贡献率分别为14.15%、3.45%和18.78%。另外,对该群体生长过程中黄萎病不同发病高峰期的病情也进行了分析。; 王红梅张献龙贺道华林忠旭聂以春李运海陈伟; 关键词：陆地棉分子标记黄萎病

海岛棉遗传多样性的SRAP标记分析被引量：46: 2008年; 利用SRAP标记,选用132对带型清晰的多态性引物,对我国引入海岛棉以来培育的36个国内品种及20个国外品种进行遗传多样性分析。共检测到419个多态性位点,每组合的多态性条带数从2-9不等,平均为3.17。利用NTSYS-pc2.10e软件采用Jaccard’s相似系数和UPGMA方法进行聚类分析。结果表明,大部分具有亲缘关系的品种聚在同类中,说明其结果与系谱具有一定的相符性;56个品种的平均遗传相似系数为0.497,变化范围在0.312-0.876之间,说明我国海岛棉品种在分子水平上存在较大差异;我国3个育种时期育成品种的平均相似系数依次为0.501、0.507和0.548,表明我国现在育成的品种相对于早期品种遗传多样性在逐渐降低。这些结果为我国海岛棉育种提供了有益的参考。; 李武倪薇林忠旭张献龙; 关键词：海岛棉 SRAP

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