李哲谦
- 作品数：5 被引量：7H指数：2
- 供职机构：上海大学通信与信息工程学院更多>>
- 发文基金：上海市教育委员会重点学科基金上海市教委科研基金浙江省科技厅面上科研社会发展项目更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学医药卫生更多>>
- 基于支持向量机的蛋白质相互作用预测被引量：6
- 2008年
- 研究蛋白质与蛋白质的相互作用是了解蛋白质功能的重要一步,对于进行药物设计、新陈代谢和信号传导网络的分析具有重要意义。本文采用支持向量机学习方法,利用氨基酸物理化学特性构建支持向量,选取DIP数据库中的酵母表达蛋白进行蛋白质相互作用预测,在34000对酵母蛋白实验数据中,预测准确率可达73.21%,证明了该方法的有效性。
- 李哲谦刘书朋严壮志黄海
- 关键词：蛋白质-蛋白质相互作用支持向量机模式识别
- 乳酸左旋氧氟沙星口腔贴膜的制备方法
- 本发明涉及一种乳酸左旋氧氟沙星口腔贴膜的制备方法，属医药制品制造工艺技术领域。本发明的口腔贴膜由药物层和保护层组成，药物层基质采用聚乙烯醇和羧甲基纤维素钠，其两者比例为2∶1；药物层的有效药物成分为乳酸左旋氧氟沙星、醋酸...
- 李哲谦刘书朋严壮志辛艳飞黄海
- 文献传递
- 改进信息离散性度量方法的蛋白质二级结构预测
- 2008年
- 采用一种信息离散性度量方法对CB396数据集中的蛋白质数据进行二级结构预测,预测准确率达到72.1%.为了提高预测准确率,将FDOD算法结合PSI-BLAST进行多重序列比对,使预测准确率提高到75.6%,证明了该方法的有效性.在此基础上,利用20种疏水标度改进FDOD方法,以减小计算量.最后,结合长程作用,对预测准确性的影响因素进行了讨论.
- 李哲谦刘书朋严壮志辛艳飞
- 关键词：二级结构预测
- 基于改进支持向量机方法的蛋白质相互作用预测被引量：2
- 2009年
- 蛋白质与蛋白质相互作用研究是蛋白质组学的重要研究内容之一。本研究采用支持向量机学习方法,将氨基酸物理化学特性和序列信息方法相结合构建支持向量,选取DIP数据库中的酵母表达蛋白序列进行蛋白质相互作用预测。在34 000对酵母表达蛋白实验数据中,预测准确率达到83.72%,而单独运用基于氨基酸物理化学特性的方法和基于序列信息的方法预测准确率分别为75.86%和79.63%。在提高预测准确率的同时通过引入离散信息度量函数(FDOD)减少支持向量的维数,使支持向量学习时间缩短,提高相互作用预测的速度。
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- 关键词：蛋白质-蛋白质相互作用支持向量机
- 基于支持向量机的蛋白质相互作用研究
- 生物体系的运作与蛋白质之间的相互作用密不可分，DNA合成、基因转录激活以及信息传导等重要的生命活动均涉及到蛋白质。蛋白质-蛋白质相互作用是生物调控的基本单元，是实现生物体功能的基础。了解蛋白质的本质，结构以及相互作用方式...
- 李哲谦
- 关键词：支持向量机研究方法蛋白质相互作用生物信息
- 文献传递
