孙超
- 作品数：104 被引量：745H指数：17
- 供职机构：中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金长江学者和创新团队发展计划国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学生物学自动化与计算机技术更多>>
- 甘草酸合成生物学元件初探:甘草法呢基焦磷酸合酶基因的克隆及序列分析
- 甘草酸是中药甘草(Glycyrrhiza uralensis)的主要有效成分,法呢基焦磷酸合酶(famesyl-diphosphate synthase,FPS)是甘草酸合成途径中关键酶之一。根据甘草转录组数据设计引物,...
- 李滢牛云云宋经元罗红梅李秋实孙超
- 关键词：甘草甘草酸基因克隆
- 植物单细胞转录组测序研究进展被引量：5
- 2021年
- 单细胞转录组测序是一种在单细胞水平上研究基因表达的技术。多孔板法和液滴法是目前应用于植物研究的两类主要的单细胞转录组技术。首先概述了植物单细胞转录组测序的技术原理和数据分析流程,然后介绍了植物单细胞转录组的研究进展,重点阐述了单细胞转录组测序技术在鉴定植物细胞类型、揭示细胞演化轨迹和构建细胞间调控网络中的应用。单细胞转录组测序技术可为植物领域的研究提供新视角,有助于识别和理解复杂组织中关键的细胞生物学过程。
- 李益孙超
- 关键词：单细胞转录组测序
- 赤芝萜类合酶GL-TS3编码基因cDNA序列及其应用
- 本发明涉及赤芝萜类合酶GL-TS3编码基因cDNA序列及其应用，所述赤芝萜类合酶GL-TS3编码基因的cDNA序列如Seq？ID？No.2所示，编码347个氨基酸。本发明通过赤芝萜类合酶基因GL-TS3转化大肠杆菌，以内...
- 孙超陈士林曾欣宜王丽芝李滢
- 文献传递
- 基于流式细胞技术的灵芝基因组大小估测被引量：17
- 2013年
- 以药典规定的灵芝正品来源灵芝Ganoderma lucidum作为研究对象,利用已完成全基因组测序的黑曲霉Aspergillus niger作为内标,通过机械破碎菌丝体的方法获得合适浓度的细胞核悬液,碘化丙啶荧光染色后成功应用流式细胞术进行基因组大小估测。经过优化材料培养、样品制备、上机分析等实验条件,估测得出灵芝基因组大小(48.98±0.60)Mb,为灵芝基因组学研究提供重要数据。该方法简捷稳定,在蕈菌范围内,首次得到了全基因组测序数据与光学图谱结果验证,为蕈菌基因组学研究提供重要技术平台。
- 李秋实徐江朱英杰孙超宋经元陈士林
- 关键词：DNA含量荧光染色蕈菌
- 甘草酸合成生物学元件初探：甘草法呢基焦磷酸合酶基因的克隆及序列分析
- 2013年
- 甘草酸是中药甘草的主要有效成分,法呢基焦磷酸合酶(FPS)是甘草酸合成途径中关键酶之一。根据甘草转录组数据设计引物,对FPS基因进行克隆,获得甘草FPS基因的全长编码序列。甘草FPS基因编码区全长1 029 bp,编码342个氨基酸残基。将甘草FPS基因与GenBank中其他植物FPS基因序列进行比对分析,发现其核酸序列与鹰嘴豆、苜蓿、蒺藜苜蓿、大豆、百脉根的序列相似度最高,分别达到94%、94%、93%、93%、92%。进一步的系统进化分析表明FPS基因具有较高的保守性,其序列进化树与植物分类一致。
- 李滢牛云云宋经元罗红梅李秋实孙超
- 关键词：甘草甘草酸基因克隆
- 基于gus报告基因的灵芝转化体系建立
- 灵芝(Ganodermalucidum)是我国传统药物中有多种治疗和保健作用的药用真菌。本课题组于2012年6月发表了灵芝基因组的研究结果,推动灵芝成为中药学研究中的首个模式药用物种。遗传转化体系平台是模式药用物种研究的...
- 徐志超徐江季爱加汪波孙伟宋经元孙超郭红卫胡鸢雷陈士林
- 关键词：报告基因GFP灵芝
- 文献传递
- 金银花中表达基因密码子偏好性分析被引量：3
- 2013年
- 密码子是生物体中重要的遗传信息载体,经过长期进化,不同的生物体对同一密码子形成了一定程度的使用偏好性。本研究对已获得的金银花转录组进行基因预测,利用CodonW程序对所有含有完整阅读框的预测基因,以及参与绿原酸合成的羟基化肉桂酰转移酶(HQT)基因进行密码子偏好性分析。并将HQT基因与大肠杆菌、酵母和拟南芥全基因组的密码子使用频率进行比较,为在细菌、真菌和植物中表达金银花中HQT基因,或通过合成生物学手段异源合成绿原酸奠定了前期研究基础。
- 何柳朱英杰孙超
- 关键词：密码子转录组金银花绿原酸
- 丹参基因组SSR位点的特征分析及引物开发被引量：11
- 2013年
- 丹参为唇形科鼠尾草属多年生落叶开花植物,以根与根茎部位入药,广泛用于多种疾病的治疗。本研究采用生物信息学方法,从丹参基因组框架图序列中发掘出4 832个长度超过40 bp的基因组SSR位点。结果表明,二核苷酸重复基元和三核苷酸重复基元是构成丹参基因组SSR位点的主要类型,分别占全部SSR位点总数的37.3%和61.3%。此外,富含A/T碱基的SSR位点,包括AT/TA、AAT/ATT、ATA/TAT、TAA/TTA,分别占全部SSR位点总数的30.5%,21.6%,17.1%,20.4%,在数量上明显高于其他类型。以基因组SSR位点为基础,共设计基因组SSR引物序列1 079对。这些引物可用于基因组多样性分析、遗传图谱构建、分子标记筛选等工作,为后期丹参群体遗传学与基因组学研究奠定基础。
- 徐海滨钱俊汪波孙超谢丽芳宋经元
- 关键词：丹参简单重复序列引物设计
- 药用植物分子遗传学研究规律的探讨被引量：11
- 2020年
- 该文探讨了药用植物分子遗传学的定义,即是以药用植物作为研究对象的综合性学科,该学科关注药用植物的遗传和变异规律,研究药用植物关键性状(有效成分、产量、抗性等)和基因型的相关性,主要从分子水平上研究药用植物基因的结构与功能,遗传与变异,从而揭示药用植物生长发育和环境应答过程中遗传信息传递、表达和调控的分子机制。详细论述了药用植物分子遗传学的三大研究重点方向:一是药用植物个体和群体的遗传和变异规律,主要突出药用植物的人工驯化的遗传机制、药用植物物种层面的个体基因组学和药用植物群体遗传多样性的形成和规律;二是药用植物药效成分合成途径的解析及代谢途径的进化。重点阐述药用植物有效成分的生物合成、有效成分的多样性及分子进化;三是药用植物体内外因子影响其关键性状形成的分子遗传调控机制。主要涉及到药用植物药用活性成分的积累和分布,环境因子对活性成分积累调控网络分子机制。最后结合多组学技术的快速发展对药用植物分子遗传研究重点的未来发展方向进行了展望,并提出应用药用植物分子遗传学规律实现药用植物保育、育种和有效成分生物合成等的具体方法和措施。
- 陈士林孙伟吴问广陈万生王瑛董扬刘义飞徐志超孙超尹青岗李勇青罗鸣肖莹万会花
- 关键词：群体遗传学转录调控
- 药用模式生物研究策略被引量：3
- 2014年
- 模式生物是用于研究某种特定的生物学现象而被选定的物种.基于模式生物的研究策略已经在多个生物学领域取得巨大的成功,揭示了众多生命科学的机理,发展了一系列生命科学研究技术.近年来,现代生物学发展迅速,其相关的概念和技术正不断渗入并影响着药用生物的研究领域,包括基于模式生物的研究策略.丹参(Salvia miltiorrhiza)、灵芝(Ganoderma lucidum)等模式药用生物已经提出了多年,受到国内外的广泛关注.但是由于缺乏成熟的模式药用生物研究体系,使得当前药用生物的研究成果比较分散,难以在理论水平上汇总提高,极大地消耗了药用生物界的研究资源和研究力量,阻碍了药用生物学的发展.本文结合近期药用生物学的研究成果,从药用模式生物研究体系建立的必要性出发,提出了药用模式生物研究体系的基本概念和建立目的,分析了应用药用模式生物研究体系研究的可行性,提出了药用模式生物的选择原则并从遗传信息获得、遗传转化体系建立、突变体库构建和次生代谢物生产体系建立4个方面描述了药用模式生物研究体系的建立策略.本文还介绍了以药用模式生物为对象的次生代谢产物生源合成及调控研究策略,同时认为,药用模式生物体系在阐释药材道地性等中医药传统问题及发展合成生物学等现代科学前沿中发挥重要作用.
- 徐江孙超徐志超季爱加胡鸢雷孙伟王丽芝汪波杨培张鑫宋经元陈士林
- 关键词：模式生物道地药材合成生物学
