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基于MOLMAP指数的光化学反应分类预测被引量：1: 2012年; 由反应物和产物的结构衍生了反应物、产物和化学反应的MOLMAP指数,其中化合物的结构由化学键的物理化学性质和拓扑性质所表征.将前述MOLMAP指数应用于一个含七类光化学反应的数据集,通过随机森林建立了三种类型的模型:(1)预测反应物可能发生的反应类型;(2)预测可能合成产物的反应类型;(3)预测整个化学反应的类型.由于无需指定数据集中参与反应的化学键,所以,MOLMAP指数能够得到广泛的应用.所得分类预测结果好于我们此前对同一数据集的研究,表明改进化学键的描述有助于提高MOLMAP指数的预测能力.; 张庆友冯秀林龙海林索净洁张丹丹许力壮许禄

MOLMAP指数生成及其在化学反应分类和反应性预测中的应用: 2012年; 分子MOLMAP指数是通过递交一个分子中所有化学键描述符到Kohonen自组织映射,基于一个特定的算法所生成,其中Kohonen自组织映射已经预先由多种类型化学键所衍生的描述符进行了训练。化学键描述符由化学键的物理化学性质或(和)拓扑性质组成。MOLMAP指数是一个基于化学键类型的分子指数。若2个描述符相似的化学键激活同一个Kohonen自组织映射神经元,则2个化学键为同一类型。进一步,采用反应物与生成物的MOLMAP指数差异性描述化学反应,衍生了化学反应的MOLMAP指数。此指数能够在没有参与化学反应的化学键信息的情况下进行化学反应的相关研究,因而能够广泛地应用。本文从3个方面概述了MOLMAP指数的应用:1)在化学反应分类中的应用,例如:预测生物代谢反应分类;2)在化学反应性预测中的应用,化学反应性是指与化学反应有关的性质,例如:预测物质的变异性和抗氧化性;3)在三维数据处理中的应用,是基于MOLMAP指数算法进行的扩展,例如:预测氯酚类化合物的毒性。; 龙海林冯秀林索净洁张丹丹李静亚张庆友许禄

MOLMAP指数及其在变异性预测中的应用被引量：1: 2012年; 分子映射(MOLMAP)指数是以分子的化学键描述符为基础,通过Kohonen自组织映射依据一定的算法而衍生.化学键描述符是由化学键的物理化学性质,如两端原子的电荷差和拓扑性质,键连杂原子数量等所组成.本文将分子映射指数应用于4075个有机物质(Ames实验结果:2305个结构有诱变性,1770个结构无诱变性)的变异性预测.通过随机森林,分别采用三种类型的指数建立模型:(1)采用不同维数的分子映射指数;(2)采用全局分子描述符;(3)将分子映射指数与全局分子描述符相结合.整个数据集的集外(out-of-bag)交叉验证的正确预测率达到85.4%.为了检验模型的稳定性,采用所建模型预测源于另一数据库的472个化合物,正确预测率为86.7%,与此前的研究相比,两个预测结果均有所提高.; 张庆友龙海林冯秀林索净洁张丹丹李静亚许力壮许禄; 关键词：诱变性

脂肪酶催化不对称反应中伯醇产物的手性选择性预测: 近年来,纯手性化合物的需求日益提高[1],促进了手性合成技术的发展,其中一个学术和经济上最可取的方法是催化不对称合成。为了降低实验成本和提高实验效率,研究者们从理论上研究了化合物的结构与手性选择性之间的关系; 索净洁赵谈封冯秀林张庆友; 文献传递

不对称反应的对映体过量值预测: <正>一对对映体常表现出不同的物理、化学和生理活性,因而纯手性物质需求日益增长[1]。目前公认的经济有效的方法是通过不对称手性催化反应生成高纯度的手性产物[2],虽然如此,催化剂筛选仍然十分耗时且成; 张丹丹索净洁冯秀林李静亚龙海林赵谈封张庆友; 关键词：对映体过量值手性催化剂; 文献传递

分子映射指数在化学反应分类预测中的应用: 对于化学反应数据库的分析来说,化学反应的自动分类是十分重要的,尤其是对于代谢反应。在这一领域,已经进行的一些研究主要基于反应中心识别。然而,在大多数的数据库,由于无法得到反应中心的信息,这些方法的应用受到了限制。　　化学...; 冯秀林; 关键词：光化学反应; 文献传递

基于分子结构的光化学反应分类预测: 化学反应自动分类研究对于计算机辅助合成设计、反应数据库的评估和检索均非常重要。目前采用的化学反应分类方法要求预先识别参与化学反应的原子或化学键,因而应用的范围受到限制。本文在仅需要反应物和产物结构的情况下建立了化学反应分...; 冯秀林龙海林索净洁张丹丹李静亚张庆友; 关键词：RANDOM FORESTS

高选择性拓扑指数EAID及其唯一性: EAID是基于扩展连接矩阵而衍生成的拓扑指数,该指数包含各原子之间的连接关系和原子的性质。EAID指数具有高选择性,每个化合物均可以衍生成一个数学不变量,而不出现简并,这将为数据库的检索提供很大的方便。本文改进了EAID...; 索净洁龙海林李静亚张丹丹冯秀林张庆友; 关键词：拓扑指数

MOLMAP指数的衍生及其在变异性预测中的应用: MOLMAP(MOLecular Mapping of Atom-level Properites)指数以化学键描述符为基础,通过表征化学键两端原子的电荷差和键连杂原子数量等物理化学性质和拓扑性质,并结合Kohonen自...; 龙海林李静亚张丹丹冯秀林索净洁张庆友; 关键词：RANDOM FORESTS 诱变性

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冯秀林