陈喆
- 作品数：10 被引量：40H指数：3
- 供职机构：杭州师范大学生命与环境科学学院更多>>
- 发文基金：浙江省大学生科技创新活动计划(新苗人才计划)项目浙江省自然科学基金浙江省科技计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学医药卫生生物学更多>>
- 一种基于动态贝叶斯网络的基因调控网络构建方法
- 一种基于动态贝叶斯网络的基因调控网络构建方法，包括以下步骤：步骤一：获取基因表达的时间序列数据；步骤二：时间序列数据采用离散化方法，离散成数个表达水平；步骤三：设定基因调控网络的时间延迟；步骤四：利用动态贝叶斯网络的结构...
- 吴剑丙陈喆钱永生
- 文献传递
- 近5年我国药用植物遗传连锁图谱构建的研究进展被引量：4
- 2015年
- 遗传连锁图谱的构建是基因组研究中的重要环节,也是基因定位与克隆、分子标记辅助育种及数量性状定位等研究的基础,加之分子标记技术的蓬勃发展,为构建高密度遗传连锁图谱奠定了技术基础。对遗传图谱的构建步骤、分子标记的种类、作图群体的种类及近5年我国药用植物遗传图谱的研究进展进行了简要概述,并探讨了目前该领域研究中存在的主要问题及今后的研究方向。
- 陈喆何仁锋姜梦莹孙涛应奇才冯尚国王慧中
- 关键词：药用植物遗传连锁图谱分子标记辅助育种
- 温郁金SCoT-PCR反应体系的正交优化被引量：1
- 2015年
- 以温郁金为试材,运用L25(56)正交设计在5个水平上对影响温郁金SCoT-PCR反应的模板DNA、Mg2+、dNTPs、Taq酶和引物5个因素进行优化试验,对PCR结果进行极差分析。建立并优化温郁金的目标起始密码子多态性-聚合酶链式反应(SCoT-PCR)体系,以期为温郁金的遗传多样性分析及分子鉴定等研究提供技术支持。结果表明:建立了温郁金SCoT-PCR的最佳反应体系(20μL):引物0.8μmol/L,dNTPs 0.4mmol/L,Mg2+1.5mmol/L,Taq酶0.5U,模板DNA 40ng,且确定各因素对温郁金SCoT-PCR反应效果的影响大小依次为:dNTPs>Taq酶>引物>Mg2+>模板DNA,其中dNTPs对体系影响最大。优化的温郁金SCoT-PCR反应体系在多个温郁金品种遗传多样性研究中得到了验证,结果表现出良好的稳定性、重复性和多态性丰富等特点,可用于今后温郁金品种遗传多样性分析、系统发育分析、遗传图谱构建、基因定位和分子标记辅助育种等研究。
- 陈喆冯尚国王振何仁锋姜梦莹王慧中
- 关键词：温郁金正交设计
- 鉴别鼓槌石斛和球花石斛的分子特异性标记引物及方法
- 本发明涉及鉴别鼓槌石斛和球花石斛的分子特异性标记引物及方法。用于鉴别鼓槌石斛 D.chrysotoxum 和球花石斛 D.thyrsiflorum 的分子特异性标记引物的上游引物GCF：如SEQIDNO.1所示；下游引物...
- 王慧中冯尚国史钰军何仁锋陈喆
- 文献传递
- 一种适用于基因芯片的倍数法差异基因筛选控制方法
- 一种用于基因芯片的倍数法差异基因筛选控制方法，包括如下步骤：步骤一：获取基因表达谱数据；步骤二：计算每个基因的倍数差异值，如倍数差异值大于预设倍数，判定为差异基因；步骤三：对倍数值进行对数变换；步骤四：进行正态变换，计算...
- 吴剑丙陈喆王慧中钱永生
- 文献传递
- 药用菊花SSR-PCR反应体系优化及引物筛选被引量：21
- 2015年
- 为进一步开发利用药用菊花种质资源和开展分子标记辅助选择育种,本研究利用L25（56）正交设计对影响药用菊花SSR-PCR反应的模板DNA、Mg2＋、d NTPs、Taq酶、引物等5个因素进行优化,并对SSR引物进行筛选。结果建立了药用菊花SSR-PCR最佳反应体系（20μL）：模板DNA 60 ng,正、反向引物0.25μmol/L,d NTPs 0.3 mmol/L,Mg2＋3.0 mmol/L,Taq酶1.5 U。运用优化后的反应体系,从136对引物中成功筛选出了扩增条带清晰、多态性丰富的SSR引物57对,大多数条带大小集中在100~500 bp,不同引物扩增的条带数为5~15条。优化的SSR-PCR反应体系在多个药用菊花品种遗传多样性研究中得到了验证,获得了稳定性、重复性良好和多态性丰富的扩增图谱。该体系的建立可为今后利用SSR标记对药用菊花种质鉴定、遗传多样性分析、系统发育研究、遗传图谱构建、基因定位和分子标记辅助育种等研究提供了依据。
- 何仁锋冯尚国陈喆沈晓霞沈宇峰王志安王慧中
- 关键词：药用植物菊花正交设计SSR-PCR引物筛选
- 一种基于病毒基因组序列的微小核糖核酸基因从头预测控制方法
- 一种基于病毒基因组序列的微小核糖核酸基因从头预测控制方法，包括以下步骤：步骤一：获取病毒基因组序列；步骤二：建立编码区序列数据库：通过将所有已知的编码蛋白的序列整理成数据库，并比对到病毒基因组序列上，获得基因组上的坐标位...
- 吴剑丙王慧中陈喆
- 文献传递
- 兰属植物遗传资源核心种质构建探讨被引量：3
- 2015年
- 兰属植物遗传资源是兰属植物遗传与育种研究的基础材料,由于其存在数量庞大、生境地域复杂、利用效率低、优异基因筛选困难等问题,给兰属资源的收集、保存、研究和利用带来了困难,因此,尝试开展兰属植物遗传资源核心种质研究是十分急迫和必要的.借鉴农作物成功的经验,本文基于形态、农艺性状和SSR分子标记数据对兰属植物核心种质基本内涵、构建核心种质的步骤和检测指标与评价方法等方面进行了阐述,并探讨其存在的问题和发展方向,以期为兰属植物核心种质的构建和种质创新与利用提供理论参考.
- 何仁锋陈喆姜梦莹周淑婷应奇才冯尚国王慧中
- 关键词：兰属植物遗传资源核心种质
- 石斛属植物的分子鉴定及其亲缘关系研究
- 石斛属（Dendrobium Sw.）是兰科（Orchidaceae）中最为重要的属之一，有1000多种;主要分布于热带和亚热带地区以及澳大利亚北部;具有很高的药用价值和园艺价值。然而，由于人为的过度采集和生境的破坏，石...
- 陈喆
- 关键词：石斛属植物分子鉴定物种鉴别亲缘关系
- 文献传递
- 药用菊花SCoT-PCR反应体系的正交优化被引量：10
- 2014年
- 为进一步开发利用药用菊花种质资源,为药用菊花的遗传多样性及分子鉴定研究提供技术支持,建立并优化药用菊花的目标起始密码子多态性-聚合酶链式反应(SCoT-PCR)体系,在方差分析基础上,运用L25(56)正交设计在5个水平上对影响药用菊花SCoT-PCR反应的模板DNA、Mg2+、dNTPs、Taq酶、引物5个因素进行优化试验,并对PCR结果进行分析。建立了药用菊花SCoT-PCR最佳反应体系(20μL):模板DNA 10 ng,引物0.8μmol·L-1,dNTPs 0.2 mmol·L-1,Mg2+2.0 mmol·L-1,Taq酶1.5 U,SCoT反应的影响因素依次为:Taq酶>引物>dNTPs>Mg2+>模板DNA。优化的SCoT-PCR反应体系在多个药用菊花品种遗传多样性研究中得到了验证,结果表现出良好的稳定性、重复性和多态性丰富等特点,该体系的建立为药用菊花品种遗传多样性分析、系统发育研究、遗传图谱构建、基因定位和分子标记辅助育种研究奠定了基础。
- 何仁锋冯尚国陈喆高岭沈晓霞沈宇峰王志安王慧中
- 关键词：药用菊花正交设计
