董浚键
- 作品数：53 被引量：185H指数：8
- 供职机构：中国水产科学研究院珠江水产研究所更多>>
- 发文基金：国家现代农业产业技术体系建设项目国家自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学经济管理自动化与计算机技术更多>>
- 草鱼jam-a分子在胚胎幼鱼期及受GCRV感染PSF细胞的表达分析被引量：1
- 2019年
- 草鱼呼肠孤病毒(Grass carp reovirus, GCRV)可引发草鱼(Ctenopharyngodon idellus)出血病,导致高死亡率。草鱼吻端成纤维细胞(Grass carp snout fibroblast cells, PSF)是GCRV的敏感细胞系。JAM-A (Junctional adhesion molecule A)为免疫球蛋白超家族成员,是多种病毒的细胞受体。本研究在前期克隆到草鱼3种jam-a基因,命名为gcjam-a1,gcjam-a2和gcjam-a3。在获取ORF序列的基础上,利用qRT-PCR分析了3种gcjam-a在草鱼胚胎及幼鱼不同发育时期及PSF细胞中受GCRV(GD108株)感染前后的表达模式。结果显示,检测的13个胚胎及幼鱼发育时期中,gcjam-a1在未受精卵中高表达,在受精卵至出膜前的胚胎表达水平均较低;从出膜后1~3 d表达量开始上升;出膜6~15 d均呈高水平表达。gcjam-a2与gcjam-a3在草鱼胚胎及幼鱼发育各阶段表达水平较低。在无病毒感染的PSF细胞中,gcjam-a只有少量表达。受GCRV-GD108感染后,病毒S7基因在PSF细胞中的拷贝数随时间呈显著上调趋势,gcjam-a的表达量也有不同程度的上调,mR NA上调水平为gcjam-a1>gcjam-a2>gcjam-a3。本研究证实了3种gcjam-a基因在PSF细胞中的表达均与GCRV-GD108感染相关,其中,gcjam-a1的表达水平受GCRV-GD108感染影响最大,同时,它在孵化出膜后表达上升,推测它可能与病毒的感染更相关。gcjam-a1可作为下一步GCRV与宿主互作研究中的候选分子。
- 田园园焦真真孙成飞董浚键江小燕胡婕叶星
- 关键词：病毒受体
- 大口黑鲈3个养殖群体的遗传多样性分析被引量：14
- 2019年
- 该研究通过毛细管电泳法筛选微卫星引物,从GenBank的51对微卫星引物中共筛选出12对具有特异性和多态性的引物,并合成荧光标记引物,对广东大口黑鲈(Micropterus salmoides)主养区3个养殖群体进行STR分型,以分析其遗传多样性。结果显示所检测的12个微卫星位点中,3个位点呈现高多态性,4个具有中度多态性,其余5个位点为低多态性。3个群体的遗传多样性水平偏低,期望杂合度(He)分别为0.312 5、0.360 6和0.328 4。群体间遗传分化指数及AMOVA分析显示,群体间遗传分化属于低水平,遗传变异有85.83%是由群体内不同个体间的差异造成的。群体间遗传距离分析显示,3个养殖群体间的遗传距离和遗传相似度比较接近。遗传结构分析表明3个养殖群体来自于同一个亚群。研究结果提示现阶段中国大口黑鲈养殖群体的遗传多样性已显著下降,因此在选育种过程应高度重视提高与维持种群遗传多样性的问题。
- 孙成飞谢汶峰胡婕董浚键田园园吴灶和叶星
- 关键词：大口黑鲈微卫星毛细管电泳
- 尼罗罗非鱼γ-干扰素基因的克隆、结构分析及组织表达被引量：6
- 2017年
- γ-干扰素(interferon,IFN)是调控天然免疫与细胞免疫的一种重要细胞因子,在抵抗病毒入侵和细菌感染中发挥重要作用。该研究从尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)脾脏组织中扩增到γ-干扰素基因的c DNA,大小为621 bp,编码206个氨基酸。生物信息学分析表明,尼罗罗非鱼γ-干扰素分子(On IFNγ)具有信号肽、IFN特征序列及核定位信号。预测的三级结构与人类IFNγ晶体结构最相似。q PCR检测显示,IFNγ在正常鱼体内的脾脏中表达量最高,其次是肠、鳃和肾脏。感染无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)后,On IFNγ在脾脏、肾和鳃中的表达均显著上调(P<0.05)。On IFNγ在相关免疫器官中的高表达、受感染后的表达上调,说明其在罗非鱼免疫防御中可能具有重要作用。该研究为进一步开展On IFNγ基因的功能研究、探讨其在抗病转基因及抗病选育中的开发应用奠定了基础。
- 余嘉欣吴芳孙成飞董浚键田园园叶星
- 关键词：尼罗罗非鱼Γ-干扰素生物信息学
- 大口黑鲈源维氏气单胞菌的分离鉴定被引量：16
- 2021年
- 为查明2020年春季广东省佛山市某养殖场人工养殖大口黑鲈(Micropterus salmoides)鱼苗出现暴发性死亡的病因,该研究对患病大口黑鲈鱼苗肝脏组织中分离的一株细菌GZXR2020进行了分子鉴定,PCR扩增获得该菌株的16S rRNA基因和gyrB基因全长序列,BLAST显示其与维氏气单胞菌(Aeromonas veronii)的相应序列高度同源,同源性分别高于99.5%和98.3%。根据VITEK2全自动细菌鉴定系统45个理化项目的鉴定结果、羊血琼脂平板溶血实验呈β-溶血的结果,进一步通过毒力基因检测并结合补充理化鉴定结果,可判断此分离菌株为维氏气单胞菌温和生物型(A.veronii bv.sobria)。人工回归感染实验采用低、中、高3种菌液浓度(3×10^(7)、1.5×10^(8)和3×10^(8)CFU·mL^(−1))进行腹腔注射攻毒,可分别导致7%、40%和100%的死亡率,证实维氏气单胞菌温和生物型是引起此次大口黑鲈暴发性死亡的致病原。药物敏感性实验显示,在所检测的17种抗菌药物中,该菌株对大观霉素、氟罗沙星、氟苯尼考等7种药物敏感。
- 杨超董浚键刘志刚孙成飞赵飞叶星
- 关键词：大口黑鲈耐药分析
- 尼罗罗非鱼无乳链球菌荚膜多糖合成基因的表达及其与荚膜唾液酸含量、菌株致病性的关系被引量：1
- 2018年
- 为了解尼罗罗非鱼无乳链球菌(GBS)荚膜多糖合成基因的表达及其与荚膜唾液酸含量、菌株致病性的关系,本实验克隆了尼罗罗非鱼荚膜多糖合成基因cps E、cps K和neu A,通过q RT-PCR方法分析了这3个基因在不同培养温度下表达水平的变化,同时通过比色法测定了不同培养温度下GBS荚膜唾液酸含量的变化,通过人工感染实验分析了不同水温条件下GBS对罗非鱼的致病性。结果显示,cps E、cps K和neu A编码的氨基酸序列均具有保守的与荚膜多糖合成相关的酶活性位点,Cps E、Neu A与已知鱼源GBS(Ia和Ib型)和人源GBS(Ia、Ib和II^IX型)相应序列的同源性均达到97%以上,而Cps K与鱼源、人源的序列同源性则分别为56%~100%和27%~100%。在不同培养温度下GBS cps K和neu A基因表达水平的变化与荚膜唾液酸含量的变化一致;在较高温度(28和34°C)下培养的GBS荚膜唾液酸含量及菌株攻毒后罗非鱼的死亡率均随温度的升高而递增,而在22°C下培养的GBS唾液酸含量最高,攻毒后罗非鱼的死亡率却最低。本研究结果表明,GBS Cps K和Neu A在GBS荚膜多糖的唾液酸化中起重要作用,较低温度下GBS荚膜唾液酸的高含量有助于其在宿主体内的潜伏,而较高水温条件下细菌的强致病性可能还与除荚膜唾液酸外的某些重要的毒力因子的表达有关。
- 师红亚董浚键张德锋孙成飞田园园卢迈新叶星
- 关键词：尼罗罗非鱼
- 摄食配合饲料翘嘴鳜快长组与慢长组转录组特征比较分析
- 2023年
- 翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)是我国淡水名贵鱼类,长期以来翘嘴鳜养殖自开口到养成均是投喂活饵,开发配合饲料代替活饵对翘嘴鳜养殖业绿色健康发展意义重大。近年已在翘嘴鳜配合饲料养殖试验中发现个体间生长速度存在很大差异。为探究其生长差异与基因表达和调控的关系,本研究采用RNA-Seq技术对经过一个完整养殖周期、投喂配合饲料翘嘴鳜的快长组和慢长组的4种组织(肝脏、肌肉、脑和胃)进行转录组测序与差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)分析。与慢长组相比,快长组的肌肉和脑中分别筛选出920个和696个上调基因(68.81%和74.68%),417个和236个下调基因(31.19%和25.32%);肝脏和胃中分别有347个和191个上调基因(47.28%和46.25%),387个和222个下调基因(52.72%和53.75%)。鉴定出与生长和代谢相关的DEGs包括谷氨酸脱羧酶(glutamate decarboxylase,gadl)、生长/分化因子(growth differentiation factor,gdf)、脂蛋白脂肪酶(lipoprotein lipase,lpl)、脂肪酸结合蛋白(fatty acid-binding protein,fabp)等基因。GO功能注释显示,DEGs主要被注释在免疫、代谢、信号转导、酶活性等生物过程,以及信号受体结合、酶活性等分子功能上。KEGG功能注释显示,肝脏、肌肉、脑、胃中的DEGs分别被富集到17、15、12、7条通路,包括与能量代谢、脂质代谢、细胞生长与分化、神经配体-受体互作、激素合成、信号转导等相关的信号通路中,如牛磺酸和亚牛磺酸代谢、氨基酸合成、PPAR信号通路等。研究结果提示翘嘴鳜的生长分化由多个基因参与,并由多个基因构成多个潜在的调控网络共同调控。本研究结果有助于深入了解影响翘嘴鳜配合饲料利用和生长发育的分子机制。
- 陈晓孙成飞董浚键张赫桐田园园高风英叶星
- 关键词：翘嘴鳜配合饲料转录组
- 饵料鱼和配合饲料两种模式下广东养殖鳜鱼成本与收益分析被引量：6
- 2022年
- 翘嘴鳜是我国传统的名贵淡水鱼,俗称“桂花鱼”(以下简称鳜鱼),肉质丰腴细嫩,味道鲜美可口,无肌间刺,营养价值高。据《2021年中国渔业统计年鉴》数据,2020年全国养殖鳜鱼产量37.7万吨,比2019年增长近4万吨,其中广东省产量14.3万吨,占比38%;2020年广东贡献了全国93%的鳜鱼增量。
- 汪福保程光兆孙成飞董浚键可小丽王淼卢迈新叶星
- 关键词：成本与收益分析配合饲料桂花鱼饵料鱼翘嘴鳜鳜鱼
- 翘嘴鳜主要形态性状与体重的相关性及雌雄形态性状差异分析被引量：35
- 2018年
- 为了解翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)主要形态性状与体重的相关性,以及雌雄形态性状的差异,本研究测量了同塘养殖的2837尾翘嘴鳜的7个生长相关性状,包括全长、体高、头长、眼径、尾柄全长和尾柄高与体重。采用相关分析、通径分析和多元线性回归分析方法,分析各形态性状与体重的相关关系,并从中随机取雌雄个体各150尾建立多元回归方程,并另随机取120尾进行雌雄判别验证。结果显示,在各形态性状中,全长、体高与体重的相关系数最大。通过建立回归方程组并进行偏回归系数检验,发现头长和尾柄高与体重的相关性不显著,故剔除这2个性状后作进一步分析。通径分析显示,全长和体高对体重的直接作用最大,且大于间接作用;单性状及两两性状协同对体重的决定系数显示,全长及体高对体重的单独决定程度最高,且二者的协同作用也最大;4个性状对体重的决定系数总和(∑d)达0.896,说明这4个性状与体重有较大的相关性,拟合的多元回归方程具有较大的参考意义。建立雌雄鱼判别回归方程并分析验证显示,对于体重小于200 g的个体其雌雄性别判别的准确率较高。本研究可为翘嘴鳜生长性状选择评价指标的确定提供参考,将有助于提高选育种效率。
- 董浚键孙成飞田园园曾庆凯师红亚卢迈新卢迈新
- 关键词：翘嘴鳜形态性状体重通径分析
- 一种嗜中性粒细胞的富集分离方法
- 本发明提供一种嗜中性粒细胞的富集分离方法，具体过程如下：1)用第一注射器向闭鳔类鱼体的鱼鳔内注射大肠杆菌灭活菌液后，继续培养；2)用第二注射器沿原注射孔向步骤1)所得闭鳔类鱼体的鱼鳔内注射HBSS，轻轻颠倒鱼体；3)用第...
- 董浚键叶星孙成飞田园园胡婕
- 文献传递
- 结合RT-PCR与NEST-PCR的草鱼出血病病毒检测试剂盒和检测方法
- 本发明提供一种结合RT‑PCR与NEST‑PCR的草鱼出血病病毒检测试剂盒和检测方法。设计巢式PCR反应(NEST‑PCR)，以RT‑PCR反应产物作为模板，进行NEST‑PCR扩增，有效提高了检测的灵敏度，可检测到携带...
- 叶星董浚键赵立祥曾庆凯孙成飞田园园
- 文献传递
