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桑树叶片中不同环氧鲨烯环化酶类基因的表达与三萜类化合物组成和含量的变化被引量：2: 2015年; 由环氧鲨烯环化酶(OCS)催化的环化反应是氧化鲨烯合成三萜类化合物的第一步反应。通过对野生桑种川桑(Morus notabilis)、栽培桑种广东桑(Morus atropurpurea)桑叶中不同OCS基因的表达分析及桑叶中三萜类化合物组成和含量检测,探究桑树中三萜类化合物合成的关键酶。通过与拟南芥(Arabidopis thaliana)的OCS氨基酸序列进行比对,在川桑基因组中共鉴定得到12个OCS基因。半定量RT-PCR检测发现有9个OCS基因在川桑与广东桑的叶片中均有表达,其中MnPEN1、MnPEN2、MnPEN4基因的表达水平在2个桑种的叶片中差异较明显。通过气相色谱-质谱(GC/MS)分析发现川桑与广东桑叶片中的三萜类化合物组成有着较大差异,川桑的叶片中含有较多的α-香树素,广东桑叶片中的羊毛甾醇含量明显较高;而与这2种化合物合成相关的MnLAS、MnPEN1、MnPEN2、MnPEN4基因的表达水平在2个桑种之间也存在差异。推测在2个供试桑种的桑叶中,由于OCS基因表达水平的差异使相关三萜类化合物合成酶的活性不同,这是造成2个桑种桑叶中三萜类化合物组成和含量差异的原因之一。; 丁光宇梁九波王裕鹏李文生张少宇刁杨洋王刘清来烽伟何宁佳; 关键词：川桑广东桑半定量RT-PCR

桑树杂交组合亲本的SSR标记多态性及遗传背景分析被引量：5: 2014年; 在对PCR反应体系进行正交试验优化的基础上,采用2 878对SSR分子标记分析以桑树品种伦教109作为父本,珍珠白和粤武2号分别作为母本的2对杂交组合亲本间的多态性。结果表明,桑树杂交组合珍珠白×伦教109亲本间的多态性为69%,粤武2号×伦教109亲本间的多态性为54%。选用珍珠白×伦教109的F1群体进行SSR分子标记遗传连锁分析,对亲本的遗传背景分析发现:在母本珍珠白中,相引相分子标记数目为58对,相斥相分子标记数目为70对,符合1∶1分离比;而在父本伦教109中则没有检测到相斥相分子标记对。据此推测桑树品种珍珠白可能为异源四倍体,而伦教109可能为同源四倍体。; 罗义维亓希武帅琴王裕鹏卢承琼向仲怀唐翠明何宁佳; 关键词：桑树多态性

川桑丝氨酸蛋白酶抑制剂基因的鉴定与表达模式分析被引量：3: 2014年; 丝氨酸蛋白酶抑制剂(SPI)主要参与蛋白酶活性的调节,植物SPI具有抵御病原菌侵染和昆虫取食危害的功能。通过比对MEROPS数据库以及保守氨基酸基序的分析,在川桑(Morus notabilis)基因组中鉴定到34个SPI蛋白。这些SPI蛋白可分为Kunitz、Serpin和PI-Ⅰ3个家族,依据氨基酸序列中的半胱氨酸残基数目又将Kunitz家族成员分为4类。氨基酸多序列比对表明Serpin和PI-Ⅰ家族成员在序列上相对保守。基于川桑根、皮、花、芽、叶的RNAseq数据量化的RPKM值分析发现不同类型SPI基因的组织表达模式存在差异,暗示川桑不同类型SPI行使不同的生物学功能。以广东桑(Morus atropurpurea)品种粤桑-69851的幼叶作为创伤处理材料,检测PI-Ⅰ家族的6个SPI基因对创伤诱导响应的表达模式,其中有4个基因不同程度地受到创伤诱导而上调表达,推测它们在桑树防御昆虫咬食危害中具有重要作用。; 王裕鹏梁九波丁光宇李文生杨光伟何宁佳; 关键词：川桑丝氨酸蛋白酶抑制剂基因家族

桑树Phytocystatin基因的鉴定及表达模式分析: 农业害虫是造成农作物减产最重要的原因。目前，关于害虫的防治主要采用化学杀虫剂和杂交选育抗性品种。然而，过分使用化学杀虫剂能使害虫不断的产生抗性，使用常规的剂量不能达到有效防治的目的，也对生态环境造成严重的破坏。杂交选育抗...; 王裕鹏; 关键词：桑树生物信息学全基因组半胱氨酸蛋白酶基因鉴定; 文献传递

桑树SV分子标记的开发及在F_1群体的偏分离分析被引量：3: 2014年; SV(structure variation)标记是基于基因组结构变异的一种分子标记。为推动桑树遗传图谱的构建,以已完成全基因组测序的川桑(Morus notabilis)基因组为参考序列,利用桑品种伦教109和珍珠白的基因组重测序数据开发了110对桑树SV标记,其中100对SV标记能在伦教109×珍珠白的F1群体中检测到多态性,多态性位点为169个,75.1%(P<0.05)的SV标记在伦教109×珍珠白的F1群体中表现为偏分离。分析SV标记在F1群体中的分离模式,推测在亲本品种伦教109和珍珠白中,至少有一个不是异源四倍体。; 帅琴罗义维卢承琼王裕鹏何宁佳; 关键词：桑树多态性偏分离

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王裕鹏