王宝文
- 作品数：59 被引量：141H指数：7
- 供职机构：燕山大学信息科学与工程学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金河北省科学技术研究与发展计划项目河北省普通高等学校博士科研资助基金项目更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学电子电信经济管理更多>>
- 应用于癌症基因表达数据的OMB双向聚类算法被引量：1
- 2011年
- 癌症基因表达数据的聚类分析可以为癌症的早期诊断和精确的癌症亚型分型提供依据。针对癌症基因表达数据的特点,提出一种称为OMB(Override Matrix Bicluster)的双向聚类算法。OMB算法分别在基因表达数据矩阵的行和列上搜索低于阈值的行和列,用删除添加算法产生一个子矩阵;构建与基因表达矩阵大小相同的覆盖矩阵,标识矩阵中上一次迭代产生的子矩阵的位置;在标识出来的矩阵中,重复贪婪迭代搜索找到K个聚类结果。Matlab实验结果表明OMB算法对具有重叠结构的癌症基因表达数据具有更好的聚类效果。
- 王常武刘楠楠贾永伟王宝文刘文远
- 基于SVM和优化特征集的MicroRNA靶标预测
- 2013年
- MicroRNAs(miRNAs)是一类长约22个核苷酸序列(nt)的非编码单链小RNA,通过与靶标mRNA 3′-UTR完全或不完全碱基互补匹配,在后转录时期发挥重要的基因调控功能。正确识别miRNA阳性靶标已成为研究miRNA功能的瓶颈。针对miRNA靶标预测的高维、非线性小样本数据集,本文基于υ-SVM,提出冗余特征剔除算法,并将模式识别和特征选择融合在一起,通过冗余特征剔除算法优化特征集,构造表征miRNA与靶标作用模型的最佳特征组合,先验参数γ(0<υ≤1)控制数据集压缩比例,选取有区分力度的支持向量集,进而构建最佳预测性能的miRNA靶标分类器模型。采用独立测试集对miRNA靶标预测模型进行无偏差性能评估。试验表明,文中靶标预测的分类识别和泛化性能比算法miTarget、NBmiRTar及TargetMiner等更佳。
- 王宝文齐晓阳王常武刘文远司亚利
- 关键词：MICRORNA支持向量机分类器模型
- 无线通信系统的MIMO信道测量与建模被引量：4
- 2006年
- 在多径信道中,使用多天线的M IMO(多输入多输出)无线系统能够比单天线系统提供更高的信道容量,而信道测量与建模是决定通信性能的一个重要因素。文中对目前国际范围内现有的M IMO信道测量和建模进行了研究,并进行了归纳和分类,同时分析了M IMO信道测量和建模的方法,指出了目前信道测量和建模中存在的问题,并给出了一些针对M IMO信道测量系统设计的建议。
- 吴国荣刘文远王宝文王茂盛
- 关键词：无线通信系统MIMO信道测量信道模型
- 一种带路径验证的OCSP改进方案
- 对在线证书状态协议(OCSP)进行了分析,提出了一种改进的 OCSP 实现方案,实现了标准方案没有实现的证书路径验证,明确协议中没有规定的收集撤销信息的后端结构,提高了 OCSP 系统的效率、实时性、安全性和正确性。
- 刘文远申伟王宝文
- 关键词：公钥基础设施在线证书状态协议
- 文献传递
- 路网中速度不确定移动对象的K范围近邻查询方法
- 2012年
- K范围近邻查询是指查找给定范围区域内所有点的近邻对象。现有工作主要考虑对象固定不动情况下的K范围近邻查询,实际上对象不但可能移动,而且由于外界环境和自身情况等不确定性因素的影响,移动对象运动速度的不确定性也是客观存在的。基于此,本文考虑了速度不确定移动对象的K范围近邻查询,提出路网中速度不确定的移动对象的K范围近邻查询的处理算法,利用共享查询的思想减少了冗余查询的代价,最后,通过实验验证了所提算法的有效性。
- 邓成玉胡云周同王宝文索健
- 关键词：空间数据库路网K近邻查询
- 基于本体的业务流程知识集成研究被引量：2
- 2010年
- 本文在企业知识集成的现有研究成果基础上,提出一个基于本体的业务流程知识集成模型,详细介绍该模型中的知识表示、知识建模和构建知识链3个方面的关键技术,给出了实现在采购及物资管理系统中集成知识管理的具体应用实例。
- 王宝文姜学永刘文远贾大苗柯铁军
- 关键词：本体知识知识链
- 一种可扩展半径的RNA二级结构密度聚类算法
- 2015年
- 基于自由能模型预测RNA二级结构时,真实结构可能存在于高于最小自由能一定范围内的次优结构集合中.通过对RNA次优结构集合聚类,选取代表性的结构,可以提高RNA二级结构预测的准确率.针对可变密度的RNA二级结构数据集合,提出了一种可扩展半径的密度聚类算法.算法利用特征选择方法对特征集合进行筛选,选取与聚类相关度较高的特征子集,降低聚类空间的维度.聚类过程,以最大密度对象作为簇的初始聚类中心,根据簇内的密度分布情况和密度变化参数更新簇的半径,直到簇扩展完成.实验表明,该算法可以识别并处理变密度簇,能够有效地聚类RNA二级结构.
- 王常武王秀芹魏真真王宝文刘文远李永强
- 关键词：RNA二级结构密度聚类算法
- 基于频谱分析的串联重复序列识别方法
- 2011年
- 针对现有串联重复序列识别方法存在的计算量大、灵敏度低等问题,提出一种基于频谱分析的串联重复序列识别方法。该方法采用碱基的电子离子相互作用势作为基因序列数字化表示的方法,通过对数字序列作离散傅里叶变换得到序列中串联重复序列出现的频率,并对基因序列做加窗傅里叶变换,找出串联重复序列存在的位置。实验表明,该方法的计算量较已有方法减少了75%,并能较好地解决已有方法识别灵敏度低的缺点。
- 聂俊岚毛伟伟王常武王宝文刘文远
- 关键词：串联重复序列离散傅里叶变换频谱分析信噪比
- 基于多级滤波器的蛋白质热点区域预测
- 2011年
- 针对数字滤波技术用于蛋白质热点区域预测时预测结果精度低的问题,提出一种基于多级滤波器的预测方法。依据共振识别模型从一组蛋白质中提取出特征频率,设计一个选通特性良好的多级滤波器对蛋白质序列进行滤波,根据滤波器输出序列的能量谱定位蛋白质的热点区域。实验表明,多级滤波器能提高预测结果的精度。
- 刘文远王东伟王常武王宝文
- 关键词：蛋白质数字信号处理
- 一种基于模糊神经网络加权的多维稀疏模糊推理方法被引量：1
- 2008年
- 在稀疏规则库条件下,经典的插值理论针对一维稀疏规则库提出了各种不同的插值方法,取得了很多很好的经验;但对多维稀疏规则条件的近似推理研究很少,不仅存在着难以保证推理结果的凸性和正规性等问题,而且没有考虑到多维变量之间的联系即对结论的影响权值,造成推理结果的误差性更大。多变量规则的模糊插值推理是插值推理研究的重要方面,为了在多变量稀疏规则条件下得到好的插值推理效果,本文提出了一种基于模糊神经网络加权的多维模糊推理方法,为智能系统中的模糊推理提供了一个十分有用的工具。
- 刘文远张庆大王宝文石岩
- 关键词：模糊神经网络权值
