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杨铁林
作品数:
42
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H指数:3
供职机构:
西安交通大学
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发文基金:
国家自然科学基金
中国博士后科学基金
陕西省自然科学基金
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相关领域:
医药卫生
生物学
自动化与计算机技术
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合作作者
郭燕
西安交通大学
郭燕
西安交通大学生命科学与技术学院...
朱东丽
西安交通大学生命科学与技术学院...
陈晓峰
西安交通大学
邓红文
西安交通大学
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作者
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杨铁林
25篇
郭燕
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郭燕
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朱东丽
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2010
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2009
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2007
1篇
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一种基于基因组表观调控元件特征的复杂疾病易感基因的挖掘方法
本发明公开了一种基于基因组表观调控元件特征的复杂疾病易感基因的挖掘方法,收集待分析病症的已知易感基因,以及已知易感基因的所有表观调控元件信息;利用表观调控元件信息,根据基因组的物理位置对所有已知易感基因的启动子区域进行注...
郭燕
杨铁林
董珊珊
陈晓峰
文献传递
一种基于染色质调控环路检测复杂疾病上位性的方法及系统
本发明公开了一种基于染色质调控环路检测复杂疾病上位性的方法及系统:收集并整理与复杂疾病相关细胞系的染色质远程交互作用数据和染色质分割状态数据;利用上述数据建立染色质调控环路;计算调控环路内能影响复杂疾病表型的SNP相互作...
杨铁林
姚石
陈一霄
牛慧敏
董珊珊
郭燕
文献传递
一种基于孟德尔随机化预测复杂疾病及表型相关代谢物的方法
本发明公开了一种基于孟德尔随机化分析预测复杂疾病及表型相关代谢物的方法,包括以下步骤:(1)血液代谢物全基因组关联研究数据的收集与整理;(2)工具变量的筛选与去多效性;(3)根据筛选的工具变量进行双样本孟德尔随机化分析,...
杨铁林
张堃
郭燕
吴昊
郭婧
丁景苗
文献传递
人类复杂疾病/性状的分子遗传学研究
邓红文
杨铁林
郭燕
郭艳芳
张峰
课题背景: 复杂疾病/性状与人类健康密切相关,对其进行分子遗传学研究是现代生物学和医学领域的热点和挑战。骨质疏松和肥胖是具有严重危害的复杂疾病,女性初潮与绝经年龄则是影响女性健康的重要复杂性状。 研究目的与意义: ...
关键词:
关键词:
复杂疾病
分子遗传
基因定位
一种双碱基突变的高活性sgRNA骨架、sgRNA骨架载体及其应用
本发明公开了一种双碱基突变的高活性sgRNA骨架、sgRNA骨架载体及其应用,在张峰实验室的sgRNA scaffold载体的基础上通过对该骨架序列两个碱基的改变实现的。PCR获得的高活性骨架片段sgRNA(TTAT)s...
陈皓
陈欢欢
胡维欣
王卓馨
杨铁林
郭燕
文献传递
一种对基因线路和转录调控关系自动化建模的方法
本发明公开了一种对基因线路和转录调控关系自动化建模的方法:根据一组关键词生成备选数学模型集合,其中每一个模型由不同关键词之间的组合定义;对于生成的模型,利用用户给定的表征数据进行参数估计;在备选数学模型集合中选择具有最小...
杨铁林
刘禹佳
刘聪聪
郭燕
董珊珊
文献传递
错配sgRNA选取方法及其在DNA特定位点上CRISPR系统中的应用
本发明涉及一种错配sgRNA选取方法及其在DNA特定位点上CRISPR系统中的应用,涉及基因编辑领域,该方法包括:搭建sgRNA脱靶错配活性预测模型、给定DNA位点上错配sgRNA活性的预测与挑选、挑选出的错配sgRNA...
郭燕
胡维欣
荣誉
董珊珊
杨铁林
脑疾病发病风险预测模型建立方法、系统、设备及存储介质
本发明提供一种脑疾病发病风险预测模型建立方法、系统、设备及存储介质:方法包括根据自定义输入的脑成像衍生表型和脑疾病的全基因组关联研究统计数据文件进行预处理从而保证输入数据协调一致;在孟德尔随机化设计思想的基础上,排除混杂...
郭燕
郭婧
俞可
董珊珊
杨铁林
一种批量设计融合PCR引物的方法
本发明提供一种批量设计融合PCR引物的方法,由预先安装的python程序读取用户准备的自定义输入文件,目标染色体序列文件,以及实验载体候选酶切位点文件,然后程序根据用户输入的设计引物长度等信息,基于程序内部算法设计引物,...
杨铁林
陈晓峰
郭燕
朱东丽
卢冰婕
杨熳
文献传递
基于个体通路活性的癌症诊断和预后预测系统、设备及存储介质
本发明公开了一种基于个体通路活性的癌症诊断和预后预测系统、设备及存储介质,系统包括:获取数据模块,用于获取待测个体的转录组测序数据;标准化处理模块,用于对待测个体的转录组测序数据进行标准化处理,将标准化后的基因表达值转化...
杨铁林
柯欣
董珊珊
郭燕
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