杨继
- 作品数：3 被引量：0H指数：0
- 供职机构：清华大学化学工程系更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：化学工程自动化与计算机技术更多>>
- 基于结构建模与分子对接的β-内酰胺酶活性位点设计研究
- 为了进一步研究蛋白质设计的原理，特别是酶催化位点的设计，本课题的研究选择TEM型β-内酰胺酶和头抱菌素作为研究对象，通过结构建模及分子对接，来研究β-内酰胺酶不同突变株与不同结构头抱菌素的结合情况，分析其活性位点突变的规...
- 金瑶华杨继朱玉山
- 关键词：Β-内酰胺酶活性位点分子对接
- 基于结构建模与分子对接的β-内酰胺酶活性位点设计
- 以生物酶为催化剂进行物质转化的工业生物技术由于具备高效率、低能耗、低物耗及环境友好等特点开始在高附加值化学品及医药等的制备过程中逐步得到应用,但天然酶是蛋白质,它适宜的工作条件是常温、水溶剂、中性pH值及特定底物,因此不...
- 金瑶华杨继朱玉山
- 关键词：同源建模分子对接头孢菌素Β-内酰胺酶生物酶
- 文献传递
- 细胞色素P450BM3蛋白质瞬时界面的计算设计研究
- 2011年
- 瞬时蛋白,蛋白作用在细胞内有着重要的生理作用,所形成的界面为瞬时蛋白,蛋白界面。作为电子传递功能相关瞬时界面的代表,细胞色素P450被广泛的研究。本文选取具有高效电子传递效率的P450BM3蛋白作为研究素材,在其HEME域上选择了9个设计位点。通过在能量函数中引入特异性能量函数项,取得了较好的设计结果,有6个位点的残基类型与天然蛋白的残基类型一致。另外,本文还探讨了计算模型中加入水分子的重要性,说明了水分子在提供范德华能和氢键能方面的作用。
- 杨继朱玉山
- 关键词：能量函数
