- 氧化还原酶辅因子使用偏好的生物信息学与化学信息学研究
- 氧化还原反应(oxidation-reduction reaction,也作redox reaction)是生物体内基本且重要的反应类型之一,其反应本质是电子的转移,但因氨基酸本身并不具备良好的得失电子能力,所以绝大多数...
- 曲戈
- 关键词:辅因子生物信息学化学信息学
- 文献传递
- 氧化还原酶辅因子的使用偏好与化学基础被引量:1
- 2009年
- 为了探究氧化还原酶对不同辅因子的使用偏好性,使用生物信息学方法对40个物种体内氧化还原酶辅因子的使用频率进行了统计分析,发现古核生物和原核生物体内大约90%的氧化还原酶使用有机辅因子,真核生物体内约78%的氧化还原酶选择使用有机辅因子。为了进一步解释上述现象,一方面,对氧化还原反应方程式进行了分析,发现有机酶组约28.5%的反应需要氧气的参与;而金属酶组约63.2%的反应需要氧气的参与,由此我们推断氧气的出现有可能是导致金属辅因子使用频率升高的重要原因;另一方面,使用化学信息学方法对氧化还原反应涉及的小分子进行了化学性质的分析,发现有机酶组小分子的分子量和亲水性都比较高,由此我们推断金属辅因子更适于疏水的反应环境。
- 陈蕾曲戈
- 关键词:辅因子生物信息学化学信息学