廖小林
- 作品数：18 被引量：54H指数：5
- 供职机构：中国水产科学研究院黄海水产研究所更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划山东省“泰山学者”建设工程项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 半滑舌鳎性别连锁的微卫星标记及遗传性别鉴定方法
- 一种半滑舌鳎性别连锁的微卫星标记及遗传性别鉴定方法，包括半滑舌鳎性别连锁的微卫星标记的筛选、验证、雌性特异等位基因的克隆、序列分析、特异引物设计以及半滑舌鳎遗传性别鉴定的PCR方法；根据获得的半滑舌鳎性别连锁的微卫星标记...
- 廖小林陈松林徐亘博刘海金徐营
- 文献传递
- 牙鲆遗传连锁图谱的构建被引量：3
- 2012年
- 利用基因组测序得到的大量微卫星序列,以681383B为父本、6812E36为母本杂交获得的F1为作图群体,构建了牙鲆(Paralichthys olivaceus)微卫星标记(SSR)遗传连锁图谱。雌雄图谱共定位SSR标记529个,其中雄性连锁图谱包括418个标记,分布在24个连锁群上,总长度1 418.1 cM,标记平均间隔3.62 cM,图谱覆盖率为88.7%;雌性连锁图谱包括437个标记,分布在24个连锁群上,总长度1 298.1 cM,标记平均间隔为3.16 cM,图谱覆盖率为89.1%。牙鲆中密度遗传图谱的构建为QTL分析以及分子标记辅助育种进一步奠定基础,并可以有效推动牙鲆的遗传改良工作,推动牙鲆养殖业的可持续发展。
- 庞仁谊宋文涛高峰涛廖小林赵永伟牛余泽王磊赵文田永胜陈松林
- 关键词：牙鲆SSR分子标记遗传连锁图谱
- 半滑舌鳎微卫星标记遗传连锁图谱的构建被引量：5
- 2012年
- 利用全基因组测序方法筛选出微卫星标记,以渤海近海野生个体和人工养殖的半滑舌鳎(Cynoglossus semi-laevis)为亲本交配产生的F1全同胞家系为作图群体,构建了半滑舌鳎雌、雄微卫星标记遗传连锁图谱。用320对引物对父母本和92个F1个体进行遗传分析,共得到288个分离标记,其中包含112个偏分离标记(P<0.05)。其中雌性框架图包含242个标记,分布在21个连锁群上,总长度1 311.9 cM,标记间平均距离为4.9 cM,图谱覆盖率为83.3%;雄性框架图定位标记218个,21个连锁群,总长度1 316.2 cM,标记间平均距离为5.5 cM,覆盖率为82%。半滑舌鳎遗传连锁图谱的构建为半滑舌鳎重要经济性状QTL定位、分子标记辅助育种和性别控制奠定了重要基础。
- 赵永伟宋文涛廖小林牛余泽庞仁谊高峰涛沙珍霞陈松林
- 关键词：半滑舌鳎微卫星遗传连锁图谱分子标记辅助育种
- 牙鲆基因资源发掘与高产抗病新品种培育
- 牙鲆是我国重要海水养殖鲆鲽鱼类，也是我国海水养殖鱼类的主导品种之一。本文采用牙鲆全基因组测序和基因资源发掘技术，目的是筛选和鉴定生长、抗病、性别等重要经济性状相关功能基因。
- 陈松林田永胜邵长伟徐田军王磊沙珍霞廖小林王娜邓寒
- 关键词：牙鲆抗病性能
- 鱼类异源冷冻精子诱导雌核发育的方法
- 一种鱼类异源冷冻精子诱导雌核发育的方法，包括异源鱼类精子的冷冻保存和遗传失活、雌核发育二倍体鱼苗的诱导和雌核发育鱼苗的鉴定方法。本发明首次建立了采用花鲈冷冻精子诱导多种海水鱼类卵子雌核发育的方法，筛选到分别适合条斑星鲽、...
- 陈松林杨景峰苏鹏志翟介明田永胜廖小林邵长伟
- 文献传递
- 牙鲆3个养殖群体遗传结构的微卫星分析被引量：24
- 2009年
- 采用微卫星标记分析技术,用5个多态性的微卫星标记对来自3个不同国家(中国、日本和韩国)的牙鲆养殖群体进行了遗传多样性研究。研究结果表明,3个牙鲆群体平均等位基因在4.8～5.6之间,平均观测杂合度(H0)在0.3917～0.5643之间,平均期望杂合度(HE)在0.5981～0.6264之间。有多个位点在不同的群体中偏离哈代-温伯格平衡。遗传距离分析表明,中国群体与日本群体遗传距离最近,韩国群体与日本群体遗传距离最远。分子方差分析(AMOVA)表明,群体内遗传变异与群体间遗传变异分别占总遗传变异的92.44%和7.56%,固定系数(Fst)为0.0752(P<0.001),表明牙鲆3个养殖群体遗传分化显著。
- 邵长伟廖小林田永胜陈松林
- 关键词：牙鲆养殖群体微卫星标记
- 牙鲆微卫星标记的开发及多态性分析
- 2011年
- 将牙鲆基因组DNA经限制性内切酶RsaⅠ和Bst UI双酶切后采用FIASCO法构建酶切片段基因组文库。共挑取269个克隆,177个为阳性克隆,阳性克隆率为65.79%。经测序后获得191条微卫星序列,其中完美型占74.35%;非完美型占14.66%;混合型占10.99%。用引物设计软件Primer Premier 5.0设计引物153对,挑选其中的50对合成并在32个野生牙鲆个体中进行扩增,共31个位点具有多态性,统计结果后使用POPGENE软件进行分析,平均等位基因个数为3.939 4,平均有效等位基因数为3.052 2,平均观测杂合度为0.650 1,平均期望杂合度为0.586 6,各引物的Hardy-Weinberg平衡指数在0.012 587～0.984 917变动。这些筛选出的多态性微卫星标记可应用于进一步的牙鲆遗传多样性分析、家系分析及遗传图谱的构建等工作中。
- 张潇珺徐亘博廖小林张家波陈松林
- 关键词：牙鲆微卫星FIASCO多态性
- 牙鲆良种培育技术的建立及“鲆优1号”新品种创制和应用
- 陈松林田永胜邓寒沙珍霞刘寿堂廖小林王娜邵长伟徐田军王磊张玉喜刘云国季相山宋文涛张潇珺
- 近10年来，项目组对牙鲆分子标记开发、高产抗病良种培育技术等进行了系统研究，在牙鲆微卫星标记批量化发掘、高产抗病良种选育技术以及良种培育等方面取得多项原创性成果：1．批量发掘牙鲆微卫星标记资源，采用文库构建、EST测序、...
- 关键词：
- 关键词：牙鲆良种繁育
- 四个舌鳎育种群体表型性状及线粒体CO Ⅰ和Cyt b基因比较分析被引量：2
- 2015年
- 对半滑舌鳎、黑鳃舌鳎和短吻三线舌鳎2个自然群体（Ca1和Ca2）的21个可量性状进行了测定,利用单因素方差分析（One-Way ANOVA）和Student-Newman-Keuls多重比较法,对21个可量性状进行分析和比较。结果发现,短吻三线舌鳎2个群体之间无显著性差异性状达71.43%,半滑舌鳎与短吻三线舌鳎具有显著性差异性状达71.43%,黑鳃舌鳎与短吻三线舌鳎具有显著性差异性状达66.67%~71.43%,半滑舌鳎与黑鳃舌鳎具有显著性差异性状达57.14%。对4个舌鳎群体线粒体（mt DNA）细胞色素氧化酶Ⅰ亚基（COⅠ）和细胞色素b（Cyt b）基因进行克隆,在Gen Bank上未发现与黑鳃舌鳎同缘的COⅠ和Cyt b序列,说明黑鳃舌鳎COⅠ和Cyt b基因是首次被克隆,登录号分别为JQ937270 and JQ937271。3种舌鳎的COⅠ和Cyt b基因碱基含量分析显示,G含量最低,T含量均为最高,并且AT含量要高于GC。利用COⅠ和Cyt b序列分别检测舌鳎4个群体种内、种外遗传距离,并构建的NJ系统进化树,结果显示：半滑舌鳎与黑鳃舌鳎遗传距离分别为0.047~0.050和0.045,半滑舌鳎与短吻三线舌鳎分别为0.129~0.132和0.161~0.166,黑鳃舌鳎与短吻三线舌鳎分别为0.123~0.126和0.162~0.172,短吻三线舌鳎种内外遗传距离分别为0.002和0.002~0.004,半滑舌鳎与黑鳃舌鳎亲缘关系较近,它们与短吻三线舌鳎的亲缘关系较远,短吻三线舌鳎种内分化未达到种群分化的程度。研究表明,COⅠ和Cyt b基因完全可作为3种舌鳎种质鉴定的DNA条形码。
- 田永胜齐文山田敬云廖小林陈松林
- 关键词：半滑舌鳎可量性状CYT
- 牙鲆遗传作图及生长性状QTL定位被引量：5
- 2012年
- 采用牙鲆日本群体和韩国群体杂交的92个F1个体作为分离群体，利用微卫星标记和Joinmap4．0作图软件构建了牙鲆遗传连锁图谱。共有221个SSR标记用于连锁图谱构建，雌性图谱中，共178个微卫星标记定位到22个连锁群上，观测总长度为（Goa）599．0cM，覆盖率（Coa）达76．27％。雄性图谱中，共194个微卫星标记定位到23个连锁群上，Goa为693．4cM，Coa为78．82％。对全长、体质量、体高3组数据进行主成分分析处理，得到可解释3个性状的89．6％特征的一组数据，命名为牙鲆生长性状GT。用WinQTLCart2．5软件的复合区间作图，在已构建的遗传连锁图谱上对牙鲆生长性状GT进行QTL定位，取LOD经验值2．5为QTL存在的阈值；对微卫星标记进行性状一标记之间的回归分析。本研究共定位3个与牙鲆生长性状GT相关的QTLs，qGT-f4qGT-m20qGT-f20，可解释表型变异率分别为27．60％，13．74％，10．27％。在性状一标记之间的回归分析中，得到22个与生长性状GT相关（P〈O．05）的微卫星标记，单个标记可解释表型变异率介于3．70％～10．42％，其中6个微卫星标记scaffold558_51720、scaffold558_26183、scaffold903_69232、scaffold485_47120、scaffoldl262_77386、scaffold809_65154与生长性状GT之间呈极显著相关（P〈O．01），可解释表型变异率分别为10．42％、7．31％、10．07％、10．07％、8．39％和11．26％。
- 牛余泽廖小林宋文涛王磊赵永伟高峰涛陈松林
- 关键词：牙鲆微卫星生长性状QTL定位
