商娜
- 作品数:5 被引量:13H指数:2
- 供职机构:军事医学科学院生物工程研究所病原微生物生物安全国家重点实验室更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学医药卫生更多>>
- 弗氏志贺菌磷酸化蛋白的检测
- 2010年
- 目的:检测弗氏志贺菌全菌蛋白中被磷酸化修饰的蛋白。方法:制取弗氏2a志贺菌2457T野生株全菌磷酸化蛋白样品时加入磷酸化酶抑制剂,随后对样品进行双向电泳,以抗磷酸丝氨酸/苏氨酸/酪氨酸抗体为免疫探针,通过Western印迹找到被磷酸化的蛋白,并进行胶内酶解及MALDI-TOF质谱分析。结果与结论:共检测到13个磷酸化蛋白,其中9个为代谢途径中的酶。
- 刘小青朱力吴松羽商娜冯尔玲魏华王恒樑
- 关键词:磷酸化蛋白
- 蛋白负染方法在蛋白质组学中的应用评价被引量:2
- 2010年
- 为评价蛋白质负染方法在蛋白质组学分析中的应用,采用负染和考马斯亮蓝染色两种方法对同一样品的双向电泳胶进行染色,取相对应的8对蛋白点,并进行胶内酶解及MALDI-TOF/TOF分析,比较两种方法与质谱的兼容性。图像分析显示,负染方法展示出的蛋白点更多,但三维峰图不如考染明晰;质谱结果显示,8个负染蛋白点中有7个鉴定结果有效,8个考染蛋白点鉴定结果均有效。因此可以得出以下结论:负染的灵敏度高于考染,与质谱的兼容性良好,适用于建立双向电泳参考图谱的研究;但负染后的胶图不适于进行蛋白点丰度对比分析。
- 刘小青朱力胡威商娜冯尔玲魏华王恒樑
- 关键词:双向电泳质谱蛋白质组学
- 弗氏志贺菌2a 2457T株蛋白复合体BN/SDS-PAGE电泳方法的建立被引量:1
- 2010年
- 目的建立分离弗氏志贺菌2a2457T株胞内可溶性复合物的BN/SDS-PAGE电泳方法 ,并优化分离条件。方法分别比较了不同配胶方式、配胶长度以及胶条平衡方法。结果成功建立了分离弗氏志贺菌2a2457T株胞内可溶性复合物的方法。结论本实验所建立及优化的方法 ,可以有效地分离蛋白复合体,为进一步研究志贺菌属蛋白复合体奠定了基础,并对以后的实验具有一定的参考价值。
- 商娜朱力刘小青刘先凯冯尔玲游松王恒樑
- 关键词:蛋白复合体蛋白质组学
- 不同浓度和梯度的SDS-PAGE胶对双向电泳中蛋白分离的影响被引量:4
- 2009年
- 目的:探讨双向电泳中不同浓度和梯度的SDS-PAGE胶对肠道菌蛋白分离效果的影响。方法:制备弗氏2a志贺菌2457T野生株37℃晚期全菌蛋白质样品,进行不同浓度及梯度的SDS-PAGE,研究分离肠道菌蛋白最适宜的SDS-PAGE胶浓度。结果:获得了3个不同浓度(10%、12.5%和15%)的均一胶电泳图谱和3个不同梯度(4%~15%、10%~20%和12%~14%)的电泳图谱,并比较了这些图谱的分离效果;同时,为了分析肠道菌天然表达蛋白的相对分子质量范围,鉴定了8个极端相对分子质量蛋白。结论:对于肠道菌蛋白质的分离来说,12.5%的均一胶或12%~14%的梯度胶较为适宜。
- 郑学学商娜耿鑫朱力廖祥儒王恒樑
- 关键词:双向电泳SDS-PAGE
- 细菌蛋白质组双向电泳中“串联珠”现象初探被引量:6
- 2011年
- 目的初步探讨细菌样品双向电泳中"串联珠"状蛋白点产生的原因。方法通过对比不同样品制备方法对双向电泳胶图的影响,分析"串联珠"状蛋白点出现的条件,并取"串联珠"状蛋白点进行胶内酶解及MALDI-TOF/TOF分析,寻找"串联珠"状蛋白点可能产生的原因。结果以含0.5%SDS的裂解液煮沸菌体的方法制备样品,就会产生"串联珠"状蛋白点。蛋白鉴定结果显示"串联珠"状蛋白点为同一蛋白,MALDI-TOF/TOF一级质谱峰没有出现明显的偏移峰。结论 "串联珠"产生的原因是由于SDS在加热条件下会对蛋白产生修饰或紧密结合作用,特别是相对分子质量较大的酸性蛋白。
- 胡威朱力商娜王雪芳徐慧杰冯尔玲魏华王恒樑
- 关键词:双向电泳基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱