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三个生物相关体系相互作用的分子模拟研究: 结构决定功能，功能的发挥取决于物质的动态结构。分子之间以及以上层次的超分子及有序高级结构的聚集体，主要是依靠氢键、盐键、一些弱的共价键和相互作用以及范德华等将分子结合在一起。这些弱的相互作用力之间构成相互作用网络是稳定生...; 刘亚芳; 关键词：分子动力学模拟范德华力静电相互作用; 文献传递

兔子朊蛋白结构稳定性的分子动力学研究(英文): 2012年; 朊蛋白病是一种能够对人类和动物带来致命影响,并具有高度传染性的神经退行性疾病.兔子是目前已经报道的哺乳类动物中对朊蛋白病免疫的少数几个物种之一.我们将分子动力学和操控式分子动力学模拟相结合,研究了兔子正常朊蛋白的结构稳定性;同时讨论了蛋白结构的收敛性及刚性分布,并揭示了兔子朊蛋白中关键二级结构的动力学以及受力各向异性特征,证实了兔子朊蛋白结构的稳定性特征.; 陈欣金相逢刘亚芳张敬来; 关键词：分子动力学模拟

富亮氨酸牙釉蛋白在羟基磷灰石(010)晶面选择性吸附的分子动力学研究(英文): 2014年; 蛋白质可以影响晶体的成核及生长速率,从而改变晶体的形貌和习性,因此了解牙釉蛋白在羟基磷灰石(HAP)表面的相互作用对于了解牙齿的生长机理具有重要意义.采用分子动力学(MD)和操控式分子动力学(SMD)相结合的方法研究了六个不同取向的富亮氨酸牙釉蛋白(LRAP)在HAP(010)晶面的吸附-脱附行为.在MD模拟中筛选出关键的吸附残基,并通过SMD模拟中的脱附时间对其进行分类.研究发现Glu56和Asp58是两个出现概率较高的吸附残基,其中Asp58在六个体系中都发挥了主要的吸附作用.我们进一步对吸附位点的作用基团和作用形式进行分析,发现酸性氨基酸侧链上的羧基基团与HAP表面钙离子的静电相互作用是最主要的作用形式.羧基上的两个氧原子可以钳住"钙离子,从而将LRAP锚定在HAP表面.因此,富含羧基基团的氨基酸是HAP晶型控制的首选残基.; 李涛刘亚芳陈欣; 关键词：脱附

聚乙烯吡咯烷酮与纳米羟基磷灰石相互作用的机理研究被引量：1: 2018年; 仿生方法合成纳米羟基磷灰石(HAP)时,加入聚乙烯吡咯烷酮(PVP)能较大程度影响HAP的形貌.目前实验已经在一定程度上解释了PVP对HAP形貌的影响机理,但在分子层面上两者之间的相互作用并不清晰.在本文中,我们使用分子动力学(MD)模拟对三条PVP链在HAP(010)、HAP(001)和HAP(002)晶面的吸附动力学行为分别进行了三组平行的研究.从吸附稳定性、相互作用类型、关键作用原子对、分子构型特征等方面对PVP与HAP之间的相互作用机理进行了阐释,并比较了PVP在HAP不同晶面上的吸附特异性.结果表明HAP三个晶面与PVP作用的强弱顺序为:HAP(001)>HAP(010)>HAP(002),合理解释了实验上以PVP作为封端剂调节合成HAP时,HAP(002)晶面是优势生长晶面的原因.为进一步研究功能性HAP的生长形貌调控机理提供了理论基础.; 魏亚茹陈欣刘亚芳; 关键词：羟基磷灰石聚乙烯吡咯烷酮相互作用分子动力学模拟

人类朊蛋白稳定性的流体分子动力学研究（英文）: 2014年; 朊蛋白病,被称为传染性海绵状脑病(TSE),或者致死性神经退行传染病,在人和动物中发病,与α-螺旋构型部分向β-折叠构型转变有关.本文使用分子动力学模拟和流体分子动力学模拟相结合的方法对野生型人类朊蛋白和R200K突变型人类朊蛋白的结构稳定性进行了研究.研究发现,α-螺旋柱交叉形成的防护墙是维持朊蛋白结构稳定的关键因素,而β-折叠活性较高.流体动力干扰在一定程度上可以不改变折叠路径并能够有效加速蛋白质的解折叠过程.; 朱书艳陈西良陈欣段丹辉刘亚芳于笑寒雷雨声; 关键词：稳定性流体力学

课程思政视域下培养高中生物学学科核心素养的教学实践研究: 2019年党中央印发文件明确指出“要深化大中小学思政课一体化建设,增强各类课程与思政课建设的协同效应”。《普通高中生物学课程标准(2017年版2020年修订)》中明确提出“本课程是以提高学生生物学学科核心素养为宗旨的课程...; 刘亚芳; 关键词：教学实践

麋鹿朊蛋白结构稳定性的分子动力学研究: 2012年; 朊蛋白病是一种致命且具有高度传染性的神经退行性疾病.糜鹿是目前已经报道的哺乳类动物中较易发生朊蛋白病的物种之一.作者使用分子动力学和操控式分子动力学模拟相结合的方法对糜鹿正常朊蛋白的结构稳定性进行了研究.发现了麋鹿朊蛋白结构中的不稳定结构域分布以及热动力学性质,揭示了糜鹿朊蛋白稳定性的分子结构基础以及力学特征.; 刘亚芳陈欣赵清岚; 关键词：分子动力学模拟稳定性

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刘亚芳