余琴 作品数:21 被引量:96 H指数:6 供职机构: 北京市朝阳区疾病预防控制中心 更多>> 发文基金: 国家科技重大专项 艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项 国家重点实验室开放基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
内蒙古自治区结核分枝杆菌Spoligotyping分型及北京家族分析 被引量:9 2013年 目的了解内蒙古自治区结核分枝杆菌临床分离株的基因型构成,及该地区北京家族菌株的分布特征。方法从内蒙古自治区结核病防治研究所收集2011年全年临床分离的372株结核分枝杆菌菌株及其372例来源患者的背景资料,采用间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)方法和BioNumerics 5.0软件进行基因分型分析,将372株临床菌株Spoligotyping分型结果与SpolDB 4.0数据库进行比对。另外,采用NTF及LSP对北京家族菌株进行分析。来源患者中汉族和蒙古族分别为282例及84例,其他为回族4例,维吾尔族和满族各1例,例数过少,因此仅分析主要民族与北京家族的易感性。以SPSS 13.0软件进行统计学分析,χ2检验分析不同民族与北京家族易感性。结果372株临床菌株共分为48种基因型,其中24种基因型为新的型别。85.48%(318/372)为北京家族,同时存在T家族(仅次于北京家族的主要流行基因型)占4.84%(18/372)、H家族(Haarlem)0.81%(3/372)、MANU家族(2004年最先于印度Delhi发现)0.27%(1/372)和LAM家族(Latin American and Mediter-ranean,拉丁美洲和地中海家族)0.27%(1/372)。汉族北京家族菌株占87.94%(248/282),非北京家族菌株占12.06%(34/282),蒙古族北京家族菌株79.76%(67/84),非北京家族菌株20.24%(17/84),差异无统计学意义(χ2=3.612,P=0.057)。结论内蒙古自治区结核分枝杆菌临床分离株基因具有多态性,且北京基因型为该地区主要流行株,而北京家族菌株与民族易感性间无关联。 余琴 苏云开 吕冰 马岩 连璐璐 杨晓敏 董海燕 刘耀 赵秀芹 吴移谋 万康林关键词:细菌分型技术 分子分型 汉族 江西部分地区303株结核分枝杆菌基因分型研究 被引量:2 2014年 目的选取2008年-2009年间由南昌市疾病预防控制中心收集的江西省部分地区结核分枝杆菌临床分离株,通过多位点可变数目串联重复序列分型,了解南昌市结核分枝杆菌流行菌株基因分型情况。方法对临床分离株进行常规培养,收集菌体,提取基因组DNA,采用聚合酶链反应(PCR)分别对15个VNTR位点进行检测分析,基因聚类分析采用BioNumeics软件。结果经聚类分析,303株结核分枝杆菌分为4个基因群(I群、Ⅱ群、Ⅲ群、Ⅳ群)119个基因型。聚类分析得知,Ⅰ群占86.47%,可分成91个基因型;Ⅱ群占3.96%,可分成6个基因型;Ⅲ群占4.95%,可分成11个基因型;Ⅳ群占4.62%,可分成11个基因型。结论江西部分地区的结核分枝杆菌存在基因多态性,其主要流行型为Ⅰ型。 赵竟男 余琴 曾艳文 付军 赵秀芹 万康林关键词:结核分枝杆菌 基因分型 胶体金免疫层析法检测结核分枝杆菌特异性IgG/IgM抗体对结核病诊断的应用价值 被引量:25 2018年 目的评价胶体金免疫层析法检测血清中结核分枝杆菌特异性IgG/IgM抗体在结核病诊断中的应用价值。方法收集结核病患者和健康人的血清样本共332份及其背景资料,采用胶体金法检测血清中特异性结核抗体IgG/IgM,与临床诊断和细菌学检测结果比较,使用SPSS 22.0统计软件对结果进行比较分析,以P<0.05为差异具有统计学意义。结果胶体金免疫层析法检测结核病患者中特异性结核抗体IgG/IgM的灵敏度为41.15%、特异性为91.67%,检测菌阳和菌阴结核病患者的敏感性分别为51.38%和33.77%。在全部结核病患者中,特异性结核抗体IgG/IgM检测检出率(41.15%)显著高于痰涂片法(18.84%)和痰菌培养法(36.15%)(P<0.05)。结核抗体检测、痰涂片法和痰培养法三种方法联合检测阳性率为61.54%,高于单种方法检测或其中两种方法联合检测。结论胶体金免疫层析法检测血清中结核分枝杆菌抗体具有灵敏、特异、快速和简便等优点,可用于结核病的筛查,同时该方法也具有一定的局限性,敏感度和特异度有待进一步的提高,因此不可单独用于诊断结核病,可配合痰细菌学、影像学和临床表现等进行辅助诊断。 李霜君 张治国 张治国 余琴 罗巧 李晓琴 王莉 刘海灿 李马超关键词:结核抗体 结核分枝杆菌 胶体金免疫层析法 Ag85A、Ag85B、16kDa和38kDa用于结核病血清学诊断的评价 2016年 目的对Ag85A、Ag85B、16k Da和38k Da 4种结核分枝杆菌抗原和几种抗原的组合进行诊断效能评价,分析其应用价值。方法采用酶联免疫吸附试验,包被抗原使用Ag85A、Ag85B、16k Da和38k Da 4种原核系统表达的重组结核分枝杆菌抗原,检测54份结核病患者血清和93份健康者血清,并利用受试者工作特征曲线法计算不同抗原的最佳临界值(cut-off值),计算单种抗原和抗原组合的阳性率,对其诊断价值进行综合评价。结果 4种抗原的最佳包被浓度分别为3.05 mg/ml、4.50 mg/ml、2.45 mg/ml和7.50 mg/ml,最佳血清稀释度分别为1∶200、1∶400、1∶200、1∶200;11种抗原组合中Ag85B+16k Da+38k Da的组合诊断效能效果最好,灵敏度为70.4%,特异度为80.0%,诊断效率为76.2%,Youden指数为0.504。结论抗原组合Ag85B+16k Da+38k Da取得了较高的检测灵敏度,相比单种抗原更具有诊断价值。 林楠 余琴 刘英杰 魏云芳 万康林关键词:结核分枝杆菌 血清学 内蒙古地区结核分枝杆菌串联重复序列基因多态性分析 被引量:2 2013年 目的了解内蒙古地区结核分枝杆菌临床分离株的串联重复序列(variable number tandem repeat,VNTR)基因多态性和VNTR基因型构成,及不同VNTR位点在该地区结核分枝杆菌基因分型中的应用。方法从内蒙古自治区结核病防治研究所收集临床分离的结核分枝杆菌菌株及其病例背景资料,采用多位点串联重复序列分析(MLVA)对收集的菌株进行22个VNTR位点分析,计算Hunter-Gaston指数(HGDI),分析各个位点的分辨率,同时用BioNumerics软件对VNTR结果进行聚类分析。且统计学分析民族与主要基因型间的关系。结果 372株菌共分为308个基因型,47簇,261个独特基因型,成簇率为17.20%。22个VNTR位点的基因多态性存在较大的差异,位点VNTR3820(HGDI 0.838)的分型分辨能力最高,MIRU23(HGDI 0.068)和MIRU27(HGDI 0.083)分型分辨能力较差。随着VNTR位点的增加,分型的分辨能力也有所提高。Ⅰ群基因型菌株与民族易感性的分析表明,汉族与蒙古族间Ⅰ群基因型菌株分布差异无统计学意义(χ2=0.337,P=0.561>0.05)。结论内蒙古地区结核分枝杆菌临床分离株基因具有多态性,不同VNTR位点在内蒙古地区结核分枝杆菌中具有不同的分辨能力。且Ⅰ群基因型为该地区主要流行株,而Ⅰ群基因型菌株与民族易感性间无关联。 苏云开 余琴 吕冰 马岩 连璐璐 杨晓敏 董海燕 刘耀 赵秀芹 吴移谋 万康林关键词:结核分枝杆菌 可变数目串联重复序列 基因多态性 2013-2021年北京市朝阳区结核病门诊实验室痰检结果分析 被引量:1 2024年 目的分析2013—2021年间北京市朝阳区结核病门诊部就诊患者痰标本检测情况,探讨近9年间患者痰标本检测病原学阳性的变化,从而为结核病的早期发现及有效防控提供科学依据。方法收集2013—2021年初诊痰标本检测数据,包括萋尼氏抗酸染色镜检、固体罗氏培养及GeneXpertMTB/RIF检测,进行回顾性分析,同时对照门诊管理患者病例资料,进行统计学分析。结果2013—2021年共接收初诊疑似肺结核患者8826人次,经临床诊断为肺结核并在册管理的患者2189例。对所有在册管理患者进行涂片和培养检测,χ^(2)线性趋势检验显示:随年份变化,涂片阳性率(χ^(2)=45.110,P<0.001)和培养阳性率呈下降趋势(χ^(2)=8.820,P=0.003)。对3种方法诊断肺结核的效能分析,涂片、培养及GeneXpertMTB/RIF的灵敏度及特异度分别为37.46%/91.53%、46.23%/79.73%、55.38%/86.09%。2013—2021年,京籍与非京籍病例病原学阳性率差异有统计学意义的为2016(χ^(2)=4.478,P=0.034)年和2017年(χ^(2)=5.771,P=0.016);男性病例及女性病例病原学阳性率的比较,差异无统计学意义(P<0.05)。同时,不同性质痰涂片及培养的结果差异均有统计学意义(P<0.001)。结论2013—2021年朝阳区肺结核防控工作获得较好成效,已确诊管理患者病原学检测阳性率逐年上升,提升痰标本质量是确保肺结核患者病原学阳性检出率的基础。 余琴 林楠 俞南 张爱洁 赵爱兰 徐伟 丁北川 孙灵利关键词:肺结核 痰标本 病原学检测 四种结核抗原用于结核病血清学诊断的初步评价 被引量:9 2014年 目的对MPT63、Ag85A、RV2031c和融合蛋白CFP10-ESAT6四种结核分枝杆菌抗原进行诊断效能评价,优选出最佳的抗原组合,分析其应用价值。方法基于酶联免疫吸附试验,分别用MPT63、Ag85A、RV2031c和融合蛋白CFP10-ESAT6四种重组结核抗原,对199份血清(含94份结核病患者血清和105份健康者血清)进行检测。结合受试者工作特征曲线法计算不同抗原的最佳临界值(cut-off value)并以此确立各抗原组合的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值和诊断效率,对它们的诊断效能和应用价值进行综合评价。结果 11种组合中Rv2031c与CFP10-ESAT6的组合诊断效能最好,灵敏度为63.8%,特异度为82.9%,阳性预测值为76.9%,阴性预测值为71.9%,诊断效率为73.9%。其余组合的灵敏度的范围30.9%~66%,特异度范围76.2%~90.5%。结论 Rv2031c和CFP10-ESAT6组合后的诊断效能最佳,有一定的临床应用价值。 林楠 吴小翠 赵平 余琴 庞慧 万康林关键词:酶联免疫吸附试验 受试者工作特征曲线 多色巢式实时荧光定量聚合酶链式反应技术为初始方法联合线性探针及表型药敏试验的二阶段流程检测耐药结核病的临床实践 2024年 目的评估以多色巢式实时荧光定量聚合酶链式反应技术(GeneXpert)为初始检测方法联合线性探针及表型药敏试验的二阶段检测流程在临床使用时对利福平耐药结核病的检出效果。方法回顾性收集并分析2019—2022年北京市朝阳区结核病门诊部登记的645例病原学阳性肺结核患者基本信息及实验室检测结果。参照《利福平耐药肺结核诊断流程》解读,将GeneXpert作为初始第一阶段利福平耐药检出方法,然后对未接受GeneXpert检测或检测结果显示结核分枝杆菌阴性或利福平耐药不明确的患者标本开展培养,并对培养阳性菌株开展线性探针耐多药检测和微孔板法进一步进行利福平耐药检测的第二阶段检测流程。对二阶段流程中检出的利福平耐药菌株进行利福平、异烟肼、左氧氟沙星、莫西沙星4种药物比例法药敏试验。分析二阶段检测流程对利福平耐药检出情况及利福平耐药患者对其他药物的耐药谱。结果645例病原学阳性患者的利福平耐药检测率为95.97%(619/645),利福平耐药检出比例为7.59%(47/619)。其中第一阶段GeneXpert法检出87.23%(41/47)利福平耐药患者,而第二阶段线性探针和微孔板法共检出12.77%(6/47)利福平耐药患者。47例利福平耐药病例中37例培养阳性,经4种药物比例法药敏检测显示,7例为单耐利福平,26例为同时耐利福平和异烟肼,2例为准广泛耐药。结论以GeneXpert为初始检测方法联合后续培养及线性探针和/或表型药敏试验的二阶段检测流程有助于检出更多利福平耐药患者。 赵爱兰 代小伟 余琴 张爱洁 夏辉 俞南关键词:耐药 北京市朝阳区餐饮和公共场所从业人员结核病防治知识调查 被引量:2 2015年 目的了解北京市朝阳区餐饮和公共场所从业人员结核病防治核心知识知晓情况,为进一步加强该行业人员结核病健康教育和促进工作提供依据。方法采用多级分层随机抽样方法抽取调查对象开展问卷调查,调查北京市朝阳区对结核病防治核心问题的知晓情况,并汇总分析。采用SPSS 16.0统计软件进行数据处理,计数资料使用χ2检验。结果共调查2 000人,回收有效问卷1 892份,朝阳区餐饮和公共场所从业人员结核病防治核心知识总体知晓率为80.67%。大专以上学历文化程度者知晓率最高,为83.99%,其次为83.99%学历、初中学历(76.91%)及小学学历(75.69%),组间比较差异有统计学意义(χ2=108.48,P<0.01);50~岁、40~岁、30~岁、18~岁年龄组知晓率分别为76.72%、82.37%、82.74%、81.62%,高于60~岁年龄组(70.42%),组间比较差异有统计学意义(χ2=75.58,P<0.01)。结论朝阳区针对餐饮和公共场所从业人员的结核病健康促进工作效果显著,但应加强针对低文化程度和高年龄从业者的宣传教育。 赵平 余琴 宋辉 刘英杰关键词:结核病 知晓率 公共卫生 GeneXpert MTB/RIF技术对肺结核的诊断效能评估 被引量:3 2018年 目的评估GeneXpert MTB/RIF技术在快速诊断肺结核方面的应用价值。方法收集2015年1-6月在北京市朝阳区结核病门诊就诊的240例疑似肺结核患者的痰液标本,每份标本同时进行涂片萋-尼氏染色显微镜检查抗酸杆菌,利用BACTEC MGIT 960(M960)系统进行结核杆菌培养及药物敏感性试验和利用GeneXpert MTB/RIF系统进行结核分枝杆菌基因及利福平耐药性检测。结果 GeneXpert MTB/RIF,试验阳性率为36.3%(87/240),M960系统培养阳性率为33.8%(81/240),差异无统计学意义(χ~2=0.33,P>0.05)。以培养阳性为标准,GeneXpert MTB/RIF试验的灵敏度为84.0%(68/81),特异度为87.8(129/147),阳性预测值为78.2%(68/87),阴性预测值为87.2%(129/148)。GeneXpert MTB/RIF系统和M960系统检测结果一致性为82.8%,Kappa值为0.73。结论 GeneXpert MTB/RIF系统技术操作简便,阳性检出率和灵敏度均较高,对快速诊断肺结核具有较高的临床应用价值。 赵平 余琴 张喻 陈亮关键词:结核分枝杆菌 利福平 分子诊断技术