邱忠营 作品数:7 被引量:16 H指数:4 供职机构: 陕西师范大学生命科学学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 中国博士后科学基金 陕西省科学技术研究发展计划项目 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 更多>>
直翅目昆虫线粒体基因组比较、谱系及进化研究 本研究利用直翅目昆虫线粒体DNA特异性引物,采用传统方法直接测序获得了小凸额蝗(Traulia minuta)、印度橄蝗(Tagasta indica)、僧帽佛蝗(Phlaeoba infumata)、秦岭蹦蝗(Sino... 邱忠营关键词:直翅目昆虫 自然选择 文献传递 DNA单链核苷酸组成的不对称性及形成机制 2007年 在没有自然选择和突变压力的影响下,DNA分子的每条链都应该满足A=T,C=G,即PR2法则(parity rule type 2)。但实际情况往往偏离PR2,其机制可能是不同的选择压力和不同的突变压力造成了DNA链组成不对称。该文从复制过程中可能的偏好、转录过程中的偏好、基因方向性偏好和信号序列以及氨基酸限制和密码予使用偏好几个方面来阐述引起DNA链组成不对称性的原因。 邱忠营 黄原华阴腹露蝗转录组分析 被引量:4 2016年 华阴腹露蝗(Fruhstorferiola huayinensis)隶属于直翅目斑腿蝗科,是一种仅分布在我国的蝗虫。为获得华阴腹露蝗的基因数据,对其进行了转录组测序和分析。总计获得37 840条unigenes,对组装得到的unigenes进行NR、NT、GO、COG、KEGG、Swissprot和Interpro七大功能数据库注释,最终22 477条unigenes获得成功注释,占unigenes总数的59.40%。在华阴腹露蝗转录组中共鉴定出337条编码代谢解毒酶的unigenes,19条编码杀虫剂作用靶标蛋白的unigenes。另外,还检测到4 847个简单重复序列(simple sequence repeats,SSRs)。该转录组测序分析将为进一步研究杀虫剂的抗药性机制和华阴腹露蝗基因功能奠定分子基础。 刘菲 邱忠营 黄原关键词:转录组 高通量测序 简单重复序列 疣蝗转录组分析 被引量:7 2016年 疣蝗分布广泛,是一种常见的害虫,主要危害农作物,但分子信息缺乏。我们采用高通量Illumina测序技术和从头组装的方法获得了疣蝗转录组unigenes,并鉴定了天然免疫相关信号通路基因。本研究共获得疣蝗转录组unigenes 86 756个,平均长度为670 bp,N50为1 033 bp。使用六大数据库Nr、Nt、Swiss-Prot、GO、COG和KEGG注释疣蝗转录组unigenes,分别对应有29 627,13 866,23 398,13 474,11 968和21 027个unigenes获得注释。本研究共鉴定319个天然免疫信号通路相关的unigenes,其中,参与Toll通路的unigenes 49个,参与免疫缺失(IMD)通路的unigenes 13个,参与JAK-STAT信号通路的unigenes 117个,参与MAPK-fly通路相关的unigenes 58个,参与黑化(Melanization)通路的unigenes 82个。另外,我们还预测到了9 287个微卫星(SSRs)。本研究为疣蝗基因功能分析、免疫通路相关基因和分子标记的进一步研究提供了分子理论基础。 邱忠营 刘菲 张克瑶 黄原关键词:疣蝗 转录组 天然免疫 SSRS A new species in the genus Pseudoeoscyllina(Orthoptera:Acrididae) from Inner Mongolia,China 2015年 One new species in the genus Pseudoeoscyllina from Inner Mongolia is described, e.g. Pseudoeoscyllina xilingensis sp. nov. A key to all known species of this genus is given. Type specimens are deposited in the Institute of Zoology, Shaanxi Normal University. 郑哲民 林立亮 邱忠营关键词:CAELIFERA ACRIDOIDEA 无齿稻蝗和黄翅踵蝗线粒体基因组与系统发育分析 被引量:4 2018年 为了研究无齿稻蝗和黄翅踵蝗在蝗总科的系统发育地位,本研究采用基于长PCR的二次PCR方法对这两种蝗虫的线粒体基因组进行了测定和系统发育分析。结构显示:无齿稻蝗和黄翅踵蝗线粒体基因组全长分别是15 447 bp和15 598 bp,均含有典型的37个基因以及一个控制区,基因排序和数量与其他已知近缘昆虫相同;线粒体基因组A+T含量分别是75.4%、75.4%。两种蝗虫的蛋白质编码基因中均是除了COX1的起始密码子是ACC,其他都是典型的起始密码子ATN;所有蛋白质编码基因的终止密码子都是典型的TAA或TAG;两种蝗虫t RNA基因中,21个能形成三叶草结构,只有trn^(SAGN)缺少DHU臂;黄翅踵蝗控制区的N链出现一个tRNA-like的结构。由两个外群和24个蝗总科物种构建的系统树结果显示无齿稻蝗与小稻蝗为姐妹群,黄翅踵蝗与飞蝗属和车蝗属与小车蝗属组成的分支为姐妹群。 常会会 杨丽平 刘菲 汪晓阳 汪晓阳 邱忠营 李雪娟关键词:线粒体基因组 系统发育 云南卡蝗、斑腿勐腊蝗与柯氏无翅蝗线粒体基因组序列测定与分析 长期以来,直翅目学者都在探讨直翅目各类群之间的系统发育关系。虽然螽亚目和蝗亚目的单系性目前已被接受,但有的学者认为二者具有不同的分类等级;动物线粒体基因组由于它自身的一些特点,成为了研究基因组结构、功能和进化的最佳模型。... 邱忠营关键词:线粒体基因组 直翅目 系统发育 文献传递