赵云坡 作品数:19 被引量:105 H指数:6 供职机构: 中国科学院研究生院 更多>> 发文基金: 国家重点基础研究发展计划 江苏省自然科学基金 江苏省高技术研究计划项目 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
家蚕抗浓核病毒基因的定位克隆及其功能研究 家蚕病毒病包括核型多角体病,质型多角体病,软化病和浓核病。家蚕病毒病往往给养蚕业带来重大的经济损失。如何从根本上解决病毒病对蚕业生产的危害,是蚕业学者一直都在研究的课题。有些家蚕品种对浓核毒病表现出完全抵抗性。通过遗传分... 赵云坡关键词:家蚕 图位克隆 酵母双杂交 抗菌肽 利用SSR标记对家蚕耐氟基因进行连锁定位分析 被引量:16 2008年 采用家蚕耐氟品系T6和敏感品系733新组配正反交群体(733新×T6)×733新和733新×(733新×T6),分别记作BC1F和BC1M。基于雌性家蚕染色体不发生交换,用已构建的家蚕SSR连锁图上的标记对耐氟基因(dominant endurangce to fluoride,Def)进行了定位及连锁分析。在28个连锁群上都找到了多态标记,其中只有3个位于12连锁群上的SSR标记与耐氟基因连锁。根据第12连锁群上已有的微卫星序列,寻找其所在的Scaffold上的其它SSR位点,并设计引物,找到一个新的多态性SSR标记。BC1F群中的所有耐氟个体均表现出与(733新×T6)F1相同的杂合型带型,而所有敏感个体带型与亲本733新一致,均为纯合型,说明家蚕耐氟性状是由位于第12连锁群上单个显性主效基因控制的。利用另一个群体BCM构建了耐氟基因的遗传连锁图。 白会钗 徐安英 李木旺 赵云坡 郭秋红 钱荷英 张月华 赵远 黄勇平 郭锡杰关键词:家蚕 微卫星标记 家蚕scaffold中新微卫星标记的获得与Dll基因的遗传连锁分析 被引量:6 2007年 在进行家蚕遗传连锁图谱的整合过程中,需要寻找两个作图群体中都有多态的共有标记,但这种共有标记数量较少。为此,利用已有的简单重复序列(SSR)与家蚕基因组进行比对,寻找到匹配的scaffold,再采用SS-RHunter1.3搜索其中的SSR区域,排除掉原有SSR序列,选择重复次数在6~23之间的微卫星区域设计引物,用BC1群体的亲本及F1进行多态性的筛选,选择有多态性的标记用7019×(F50B×7019)BC1群体进行基因型分析。结果显示:根据原家蚕第2连锁群上SSR位点新设计的邻近的7对引物中,有6对引物在BC1群体的亲本中有多态性,选择其中2个进行遗传连锁分析,作图结果与原有相应SSR标记的作图结果基本保持一致,其中根据S0207所在scaffold上开发的NS02071和NS02072之间的图距达到6.9 cM;根据家蚕大造和C108的回交一代初步定位的D ll基因的位置与后来在其所在scaffold上所设计的临近引物D ll1和D ll2的定位一致,且这两个标记在遗传连锁图上的图距为0.0 cM,表明这两个标记在遗传图上的位置重叠。由此,在较短的DNA区域内(在遗传连锁图上表现1个位点)便有多个SSR标记可供使用,将为定位家蚕重要经济性状基因、分子辅助育种及功能基因研究等提供更多有价值的信息。 郭秋红 詹帅 相辉 赵云坡 李卫华 黄勇平关键词:家蚕 微卫星标记 SCAFFOLD 利用SSR标记对家蚕黄血基因进行定位及连锁分析 <正>形态遗传学研究已经证明家蚕茧色受遗传基因控制,与中肠和中部丝腺的色素透过性有关。参与茧色遗传的基因较为复杂,以黄茧为例,有控制桑叶类胡萝卜素透过中肠壁的黄血基因(Y)、抑制基因(I)、黄茧基因(C)等。Y基因使家蚕... 赵云坡 徐安英 李木旺 李明辉 郭秋红 孙平江 钱荷英 张月华文献传递 利用SSR标记对家蚕卵非胶着性基因(Ng)的定位分析 被引量:1 2010年 家蚕卵非胶着性基因(No-glue,Ng)位于第12染色体,Ng突变体的雌性成虫生殖器的粘液腺只分泌极少量的粘性物质,因此产下的卵不能粘着而成为天然散卵,是研究家蚕粘液蛋白分泌机制的重要材料。利用雌性家蚕的W染色体和Z染色体间不发生交换的特点,采用产胶着卵的家蚕品系KY和产非胶着卵的家蚕品系巴格达特(Ba)组配正反交群体(Ba×KY)F1♀×KY♂和KY♀×(Ba×KY)F1♂2种材料,分别记作BC1F和BC1M,根据已经构建的家蚕SSR分子标记连锁图谱对Ng基因进行连锁分析及定位。BC1F群体中的所有产非胶着卵的个体均表现出与(Ba×KY)F1相同的杂合型带型;而所有产胶着卵个体的带型与亲本KY一致,为纯合型。筛选出4个与Ng基因连锁的SSR标记,并利用BC1M群体构建Ng基因的SSR标记遗传连锁图,连锁图的遗传距离为51.9cM,与Ng基因最近的引物为S1213,图距为0cM。 张月华 李刚 赵云坡 徐安英 沈兴家 孙平江 钱荷英 苗雪霞 黄勇平关键词:家蚕 SSR定位 家蚕G蛋白α亚基基因BmGα12的克隆及序列分析与融合表达 被引量:1 2011年 异三聚体G蛋白是真核细胞感知外界信号后将信号传递到细胞内的重要分子,参与生物体内广泛的信号转导途径。采用生物信息学方法和RT-PCR、RACE技术克隆了家蚕G蛋白α亚基基因BmGα12的全长cDNA序列,该序列全长1374 bp,开放阅读框(ORF)1 128 bp,编码375个氨基酸。将构建的表达载体pET-41b(+)-Gα12转化E.coli BL21宿主菌进行诱导表达,经SDS-PAGE和Western blot检测显示,BmGα12可在E.coli BL21中高效表达,GST-BmGα12融合蛋白主要以包涵体形式存在,其分子质量约71 kD。系统进化分析显示BmGα12与大鼠和人Gα12/Gα13的亲缘关系较近,初步推测BmGα12介导的信号传导同样在细胞生长、胚胎发育中起重要作用。 章玉萍 蒋剑豪 赵云坡 汤强 代君君 王储炎 吴传华 范涛 苗雪霞关键词:家蚕 基因克隆 融合蛋白 采用单碱基延伸法检测家蚕单核苷酸多态性位点 2009年 单核苷酸多态性(SNP)分型可以作为丰富的分子标记用于家蚕群体遗传学、基因组注释以及功能基因研究。利用SNaPshot试剂盒的SNP分型方法,对以单碱基延伸法检测家蚕SNP位点进行了探索。首先对SNP位点进行PCR扩增,然后以PCR产物为模板,以4种荧光标记ddNTPs为底物,采用延伸引物扩增SNP位点处的一个碱基,最后用377测序仪进行基因分型。通过对家蚕2个SNP位点的分析结果表明,利用单碱基延伸法可以准确地检测SNP位点,并且可以知道该位点的碱基。由于单碱基延伸法可以通过多重PCR在1个反应体系检测多至10个位点,因此该方法不仅方便快捷,并且可以实现高通量检测SNP位点。 赵云坡 张浩 杨晓楠 詹帅 黄勇平 苗雪霞关键词:单核苷酸多态性 基因分型 家蚕 家蚕3-羟基异丁酸脱氢酶基因克隆及其在模拟失重环境中的表达模式分析 被引量:2 2008年 采用RT-PCR和RACE技术克隆了家蚕3-羟基异丁酸脱氢酶(hibadh)基因全长cDNA(GenBank登录号EU719652)并对其序列进行了分析,用RT-PCR方法检测了hibadh基因在家蚕5龄幼虫不同组织中的分布,最后用real-timeRT-PCR方法分析了整个胚胎期家蚕hibadh基因在模拟失重环境中的表达模式。克隆的hibadh基因cDNA全长1074bp,包含1个能编码完整Hibadh长度为969bp的开放阅读框。家蚕hibadh基因与伯霍尔德杆菌、果蝇、蜜蜂、热带爪蟾、小鼠、人类等6个物种hibadh基因推导的氨基酸序列同源性分别达到46%、43%、48%、44%、45%、45%。Hibadh蛋白为分泌蛋白,不存在糖基磷脂酰肌醇锚定位点,分子量和等电点分别为34.1kD和9.14。hibadh基因在家蚕5龄幼虫的头、丝腺、中肠、皮肤、血液、脂肪体、马氏管等组织中稳定表达。模拟失重环境中家蚕hibadh基因在胚胎发育的不同时期表达量不同,胚体突起发生期和反转期hibadh基因表达量分别上调2.3倍(P<0.05)和4.6倍(P<0.01),气管形成期hibadh基因表达量下调7.6倍(P<0.01),其余时间段hibadh基因表达量没有明显变化。整个胚胎发育期内,模拟失重组与对照组相比较hibadh基因总表达量下调2.6倍(P<0.05)。在模拟失重环境中,家蚕hibadh基因的表达模式与家蚕整体的响应模式有相似之处但不尽相同。基因对环境反应的灵敏度高于有机体整体对环境反应的灵敏度。该研究有利于进一步探讨hibadh基因的重力生物学机制。 田宗成 周博 骞爱荣 续惠云 狄升蒙 赵云坡 章玉萍 刘佳 黄勇平 商澎关键词:家蚕 AMPLIFICATION 家蚕品种资源的遗传多样性与分子系统学研究 被引量:3 2007年 利用微卫星(SSR)标记,在DNA分子水平上对不同地理系统和化性的家蚕品种之间的遗传差异进行了研究。结果表明:在11对引物中均出现稳定的扩增带,扩增带总数为106条,最多的有16条,最少有4条,平均每个引物9.6条。利用单匹配相似系数和UPGMA聚类法对结果进行分析,发现其SSR不但具有品种特异性,而且具有系统特异性,证明不同化性及地理系统的家蚕在进化上属有显著差异的类群。 钱荷英 徐安英 张月华 孙平江 赵云坡关键词:家蚕 分子系统树 物种进化 基因图谱 地理种群 利用SSR标记对家蚕卵非胶着性基因(Ng)进行定位分析 家蚕卵非胶着性基因(No-glue,Ng)位于第12染色体,Ng突变体的雌性副腺只分泌极少量的粘性物质,因此产下的卵不能粘着而成为天然散卵,是家蚕粘液蛋白分泌研究的重要材料。利用家蚕雌不发生交换的特点,采用产胶着卵的家蚕... 张月华 李刚 赵云坡 徐安英 沈兴家 孙平江 钱荷英 苗雪霞 黄勇平 郭锡杰关键词:家蚕 SSR定位 文献传递